New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4583494 | 31 (0.530) | 4 (0.080) | 3/218 | NT | 17.0% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | = 4583555 | 13 (0.260) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
TGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCAC‑AGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA > NC_002947/4583351‑4583635 | tgCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGAGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTAGCTCGATCCCACGAAGGAGCGGGTTTACCcgc > 6:87551/1‑149 (MQ=255) gaaGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 7:158210/3‑148 (MQ=255) aGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 3:17826/149‑1 (MQ=255) gTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAt < 8:147515/147‑1 (MQ=255) gATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCTTGTTTACCCGCGAAGATGaca < 8:158210/148‑1 (MQ=255) aTGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACAcc > 5:24360/1‑149 (MQ=255) gCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTg < 5:87551/149‑1 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAg < 7:68948/149‑1 (MQ=255) ccACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAg > 1:256799/1‑143 (MQ=255) ccACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAg < 2:256799/143‑1 (MQ=255) caGCGGGCCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATgg > 3:72835/1‑148 (MQ=255) cgtcgATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCtt > 8:209412/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgt > 1:358608‑M1/1‑99 (MQ=255) aTGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCg > 2:126022/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCg > 1:328161/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCgg > 2:325514/1‑149 (MQ=255) gAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAgg > 2:97655/1‑126 (MQ=255) gAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAgg < 1:97655/126‑1 (MQ=255) tGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTcgc > 5:169002/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTcgc < 6:169002/147‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTcgc < 1:126022/147‑1 (MQ=255) gAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaaccc < 4:13548‑M1/149‑69 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccg > 2:328161‑M2/1‑141 (MQ=255) cGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgct < 1:131321‑M1/149‑72 (MQ=255) cGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgct < 2:358608‑M1/149‑72 (MQ=255) gCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctc > 6:24360‑M2/1‑138 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGgt < 4:288598/121‑1 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGgt > 3:288598/1‑121 (MQ=255) aTGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggg > 4:72835‑M2/1‑130 (MQ=255) tgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACgggggg < 7:209412/148‑1 (MQ=255) aCTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACggggggggggg > 7:232230/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGAACCGGCTTCGGCGGTGTTCGCGGATAAACACGCTCCTAAGGGGGGGGGGGcc > 5:319197/1‑148 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGca > 5:233766/1‑147 (MQ=255) ttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCAGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCAC‑AGt > 1:322764/1‑149 (MQ=255) tCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGccccggg > 7:294513/1‑143 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGAC‑AGTCTg > 5:265535/1‑148 (MQ=255) acaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGCAC‑AGTCTGAACCTTGTTaa > 7:135404/1‑149 (MQ=255) tCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATg < 1:179950/71‑1 (MQ=255) tCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATg > 2:179950/1‑71 (MQ=255) ccccGTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacat > 4:72835‑M1/1‑19 (MQ=255) ccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGACAAGGGGTAACCTTTTTAAGGGGGTTTTTGGTTGGGcccgttg > 1:309071/1‑144 (MQ=25) gAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagc > 6:24360‑M1/1‑11 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcg < 2:358608‑M2/149‑79 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcg < 1:131321‑M2/149‑79 (MQ=255) cGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgtt > 2:328161‑M1/1‑8 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttc < 4:13548‑M2/149‑82 (MQ=255) | TGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGCAC‑AGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA > NC_002947/4583351‑4583635 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |