New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4933522 = | 58 (0.990) | 4 (0.070) | 3/240 | NT | 7.3% | coding (927/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
? | NC_002947 | 4933601 = | 48 (0.880) | coding (848/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
AGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGC > NC_002947/4933376‑4933670 | aGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTc < 6:321544/149‑1 (MQ=255) gATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGc > 7:143610/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTgg < 7:68041/148‑1 (MQ=255) aGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCt > 6:338699/1‑149 (MQ=255) gccaggccaCAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAg > 4:66185/1‑149 (MQ=255) gccaggccaCAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAg > 8:78488/1‑149 (MQ=255) ccaCAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGc < 3:66185/149‑1 (MQ=255) ccaCAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGc < 7:78488/149‑1 (MQ=255) cacaGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTg < 8:228695/134‑1 (MQ=255) cacaGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTg > 7:228695/1‑134 (MQ=255) cacaGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCgg > 2:251729/1‑147 (MQ=255) cacaGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCgg > 3:52443/1‑147 (MQ=255) acaGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAg > 2:301380/1‑149 (MQ=255) acaGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAg > 3:288542/1‑149 (MQ=255) cTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGa > 7:118170/1‑149 (MQ=255) cTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGa < 3:23078/149‑1 (MQ=255) gTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGAt < 1:166267/147‑1 (MQ=255) tAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCa < 2:196937/148‑1 (MQ=255) tAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCa < 7:331503/148‑1 (MQ=255) gTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCAcgc < 1:251729/149‑1 (MQ=255) gcggcgGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCtt > 4:64052/1‑149 (MQ=255) cggcggTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTg > 3:290239/1‑149 (MQ=255) cACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTg > 8:187350/1‑149 (MQ=255) cTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGtt > 6:89677/1‑149 (MQ=255) tGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTc > 6:27902/1‑149 (MQ=255) gCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTc > 6:287676/1‑148 (MQ=255) gCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTc > 1:16978/1‑148 (MQ=255) ctggctggTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAg < 7:187350/147‑1 (MQ=255) gctggTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATGGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCgctg > 2:166042/1‑149 (MQ=255) cttccgtatcggcgctcaggaacagctcaagaccctgggccgcatcctcaacgtgccggtgacttacgtcgacccgggccaGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCgctg < 2:211022‑M1/68‑1 (MQ=255) gtggCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAg < 5:27902/149‑1 (MQ=255) gcgctcaggaacagctcaagaccctgggccgcatcctcaacgtgccggtgacttacgtcgacccgggccaGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCTGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGAc > 1:211022‑M1/71‑149 (MQ=255) cAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGACAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACt > 1:280362/1‑149 (MQ=255) aGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGGGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTg < 8:76146/149‑1 (MQ=255) ggaacagctcaagaccctgggccgcatcctcaacgtgccggtgacttacgtcgacccgggccaGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGAc < 4:292064‑M1/79‑1 (MQ=255) ggaacagctcaagaccctgggccgcatcctcaacgtgccggtgacttacgtcgacccgggccaGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGAc > 3:292064‑M1/64‑142 (MQ=255) gTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTc > 7:209305/1‑120 (MQ=255) gTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTc < 8:209305/120‑1 (MQ=255) tAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTc > 7:62595/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGa > 3:228439/1‑149 (MQ=255) tcttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTc > 6:359180/1‑145 (MQ=255) tcttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTc < 5:359180/145‑1 (MQ=255) tcttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACg > 3:252681/1‑149 (MQ=255) ttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGt > 1:163463/1‑148 (MQ=255) cgcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa < 8:62595/148‑1 (MQ=255) cgcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa < 4:288542/148‑1 (MQ=255) gcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa > 6:242816/1‑147 (MQ=255) gcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa < 5:242816/147‑1 (MQ=255) cgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTc < 2:16978/149‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGTCCGGGTCGACGTAAGTCACCg < 8:118170/149‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCg > 4:236608/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCAc > 6:286063/1‑149 (MQ=255) cACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACg > 2:121053/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGca > 5:182041/1‑72 (MQ=255) gCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGca < 6:182041/72‑1 (MQ=255) cccGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGa < 4:290239/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGc < 5:287676/149‑1 (MQ=255) gTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGAc > 5:241785/1‑119 (MQ=255) gTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGAc < 6:241785/119‑1 (MQ=255) cAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAggg > 2:291778/1‑149 (MQ=255) cATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGa < 4:252681/149‑1 (MQ=255) aTGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAg < 2:280362/149‑1 (MQ=255) aGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTc < 4:228439/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCt < 3:64052/149‑1 (MQ=255) GTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATGGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAgcgc > 1:166042‑M1/1‑149 (MQ=255) GTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAgcgc > 1:121053‑M1/1‑149 (MQ=255) | AGGATGCAGCCGGCCAGGCCACAGCGCTTGTAGCTGTGGTAGGCGGCGGTCAGCACCTGCTTCTGGCTGGTGGTGGCCAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGC > NC_002947/4933376‑4933670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |