New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4933522 = | 58 (0.990) | 4 (0.070) | 3/240 | NT | 7.3% | coding (927/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
? | NC_002947 | 4933601 = | 48 (0.880) | coding (848/1308 nt) | flhF | flagellar biosynthesis protein FlhF |
CAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGC > NC_002947/4933453‑4933735 | cAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGACAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACt > 1:280362/1‑149 (MQ=255) aGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGGGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTg < 8:76146/149‑1 (MQ=255) tAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTc > 7:62595/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGa > 3:228439/1‑149 (MQ=255) tcttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTc > 6:359180/1‑145 (MQ=255) tcttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTc < 5:359180/145‑1 (MQ=255) tcttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACg > 3:252681/1‑149 (MQ=255) ttcGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGt > 1:163463/1‑148 (MQ=255) cgcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa < 4:288542/148‑1 (MQ=255) cgcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa < 8:62595/148‑1 (MQ=255) gcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa < 5:242816/147‑1 (MQ=255) gcgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTaa > 6:242816/1‑147 (MQ=255) cgGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTc < 2:16978/149‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGTCCGGGTCGACGTAAGTCACCg < 8:118170/149‑1 (MQ=255) aaTGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCg > 4:236608/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑c > 6:286063/1‑149 (MQ=255) cACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑Cg > 2:121053/1‑149 (MQ=255) cccGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGa < 4:290239/149‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGc < 5:287676/149‑1 (MQ=255) gTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGAc < 6:241785/119‑1 (MQ=255) gTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGAc > 5:241785/1‑119 (MQ=255) cAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAggg > 2:291778/1‑149 (MQ=255) cATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGa < 4:252681/149‑1 (MQ=255) aTGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAg < 2:280362/149‑1 (MQ=255) aGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTc < 4:228439/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCt < 3:64052/149‑1 (MQ=255) gtcgctggcagcagcgctggaaccactgctgcgcaagcgcgtggtgctgatcgatactgccggcctgcaagccagcgacTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTcc > 3:292064‑M2/80‑142 (MQ=255) gtcgctggcagcagcgctggaaccactgctgcgcaagcgcgtggtgctgatcgatactgccggcctgcaagccagcgacTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTcc < 4:292064‑M2/63‑1 (MQ=255) gtcgctggcagcagcgctggaaccactgcagcgcaagcgcgtggtgctgatcgatactgccggcctgcaagccagcgacTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAgcgc > 1:211022‑M2/80‑149 (MQ=255) GTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATGGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAgcgc > 1:166042‑M1/1‑149 (MQ=255) GTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAgcgc > 1:121053‑M1/1‑149 (MQ=255) CTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTg > 3:39207‑M1/1‑104 (MQ=255) CTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTg < 4:39207‑M1/104‑1 (MQ=255) gCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGa < 5:338699/147‑1 (MQ=255) cagcgctggaaccactgctgcgcaagcgcgtggtgctgatcgatactgccggcctgcaagccagcgacTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAg < 2:211022‑M2/81‑1 (MQ=255) cAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAg < 4:52443/148‑1 (MQ=255) gCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGt < 1:301380/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTc < 8:143610/149‑1 (MQ=255) aGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCACCGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATg < 1:291778/149‑1 (MQ=255) gATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAg < 4:158020/133‑1 (MQ=255) aTCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAg > 4:233500/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCCACGCGATTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAgc < 5:89677/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAgc > 7:314289/1‑149 (MQ=255) gCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAgcgc > 2:311728/1‑148 (MQ=255) gCACCAAGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTACAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCAGGGTAGAAGTAAGTCACATTCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCAGAGCGCAGATACGGAAGCTGTCCATGATCACCAgcgc > 1:228095/1‑148 (MQ=255) accacGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAg > 5:270052/1‑149 (MQ=255) ccacGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAggg < 4:139575/93‑1 (MQ=255) ccacGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAggg > 3:139575/1‑93 (MQ=255) ccacGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAgg > 5:185502/1‑92 (MQ=255) ccacGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAgg < 6:185502/92‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTgcgc < 1:311728/147‑1 (MQ=255) gcagcaGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCg > 2:310502/1‑149 (MQ=255) gcagcaGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCg > 6:198782/1‑149 (MQ=255) gcagcaGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGAGACTGGCCCGGTACGACGTAAGTAACCGGCA‑CGGTGATGATGAGGACAAGGGTCTTGAGCTGTTCATGATCACCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCAGCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCg > 6:315341/1‑149 (MQ=255) agcagTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGt > 8:6596/1‑148 (MQ=255) agTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACtt < 3:236608/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGc < 1:310502/149‑1 (MQ=255) aGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTa < 8:314289/149‑1 (MQ=255) ctgctgCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAgcgc < 7:6596/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGa > 6:343225/1‑124 (MQ=255) tGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGa < 5:343225/124‑1 (MQ=255) | CAGCACCAGGTAGTTCTTCGCGGCAATGCCACGCCCGGCCAAGGTTTCCAGTTGCATGCGCAGTGCAGGGTCGCTGGCTTGCAGGCCGGCAGTATCGATCAGCACCACGCGCTTGCGCAGCAGTGGTTCCAGCGCTGCTGCCAGCGACTGGCCCGGGTCGACGTAAGTCACCGGCA‑CGTTGAGGATGCGGCCCAGGGTCTTGAGCTGTTCCTGAGCGCCGATACGGAAGCTGTCCATGCTCACCAGCGCCAGGTTCTGCGCGCCGTACTTGAGCACGTAGCGC > NC_002947/4933453‑4933735 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |