New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4973886 = | 54 (0.920) | 3 (0.050) | 3/240 | NT | 6.0% | coding (1718/2043 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
? | NC_002947 | 4973962 = | 44 (0.800) | coding (1642/2043 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
TCAATGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATG > NC_002947/4973739‑4974029 | agggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtaccttt > 1:266232‑M1/148‑149 (MQ=255) agggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtaccttt > 8:114198‑M1/148‑149 (MQ=255) agggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtaccttt > 6:278640‑M1/148‑149 (MQ=255) agggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtaccttt > 6:272232‑M1/148‑149 (MQ=255) gggctacaagctgttcgacgccaagggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtacctTTg > 3:276939‑M1/147‑149 (MQ=255) cAATGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTg > 7:102455/1‑149 (MQ=255) aaTGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGc > 4:137465/1‑149 (MQ=255) tggtggCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCg < 8:11917/149‑1 (MQ=255) ctggcCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGaa < 5:212942/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGa > 8:319454/1‑147 (MQ=255) cTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGa > 6:193651/1‑147 (MQ=255) gCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAggg < 3:137465/148‑1 (MQ=255) ggtagccagattggtacgggctgcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgcggtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtacctTTGCCGTc > 8:17549‑M1/122‑129 (MQ=255) ggtacccagattggtaccggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtacctTTGCCGTc < 7:17549‑M1/8‑1 (MQ=255) tACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAg > 3:270215/1‑141 (MQ=255) tACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAg < 4:270215/141‑1 (MQ=255) ccGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGt < 3:127301/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGt > 1:14544/1‑149 (MQ=255) cGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGt < 4:203426/121‑1 (MQ=255) cGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGt > 3:203426/1‑121 (MQ=255) gCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGATGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCa > 1:31145/1‑149 (MQ=255) gCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCa < 8:102455/149‑1 (MQ=255) accggcagcgtggtgcctgggcaggacaacaagttgtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtacctTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCg < 8:311809‑M1/43‑1 (MQ=255) gCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCg > 4:327346/1‑147 (MQ=255) gCGTAGGCCGAGGCGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGCTGCCCACGTTCGACTTGGGCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCt < 8:312106/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCAc < 2:14544/149‑1 (MQ=255) cGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGa > 1:203043/1‑149 (MQ=255) gTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtgt > 7:231751/1‑149 (MQ=255) tGAAGCTGGTACCGGTGCCGTAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTACAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTTTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtgtg < 7:326214/149‑1 (MQ=255) tGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATtgtg < 1:311414/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCAGCCTTGACGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGtc > 5:172681/1‑149 (MQ=255) gTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCg < 3:327346/147‑1 (MQ=255) tGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCTTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg < 2:98342/149‑1 (MQ=255) gtccatcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtacctTTGCCGTCGGCATTGATCGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCaaa > 2:104178‑M1/72‑148 (MQ=255) ccGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGc < 3:175215/143‑1 (MQ=255) ccGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGc > 4:175215/1‑143 (MQ=255) catcgccgtgccgatgctggatgcggccggcgacccgattctggatggtagcggtaacccgcgtacctTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGt > 7:311809‑M1/69‑148 (MQ=255) ttGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCCTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCgg < 7:178549/149‑1 (MQ=255) gTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGt < 7:319454/148‑1 (MQ=255) gCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTAc > 4:302404/1‑149 (MQ=255) gCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTAc < 2:31145/149‑1 (MQ=255) ccACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCg > 3:261773/1‑149 (MQ=255) cACGGGAGACTTCGTCTGCAGGTCCATCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTACGCGTTTCAGTCGGCATTCAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCTGGGCTGCCACCGATTTTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTAcctc < 8:73578/149‑3 (MQ=255) aCGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCCCCGAGTGTGGTGTCGACGGCAAAGGTACGCGGGGTACCGCt > 2:326238/1‑149 (MQ=255) tCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCAcc > 8:180154/1‑106 (MQ=255) tCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCAcc < 7:180154/106‑1 (MQ=255) gACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGCACGCGGGTTACCGCTACCATc > 2:298593/1‑149 (MQ=255) aCTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATcc < 3:302404/149‑1 (MQ=255) aCTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATcc < 4:261773/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCggg > 1:372549/1‑149 (MQ=255) cAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTCACCGCTACCATCCAGAATCgg < 6:335811/147‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg > 6:265137/1‑112 (MQ=255) gTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg < 5:265137/112‑1 (MQ=255) tCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCgcc > 8:10744/1‑149 (MQ=255) cagcagCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg > 2:246266/1‑109 (MQ=255) cagcagCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAg < 1:246266/109‑1 (MQ=255) gcagcGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCgccggcc > 2:347531/1‑149 (MQ=255) agcGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGc < 2:203043/149‑1 (MQ=255) gTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTc > 1:224644/1‑135 (MQ=255) gTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTc < 2:224644/135‑1 (MQ=255) gCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCAt < 2:372549/149‑1 (MQ=255) gCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCAt > 6:107120/1‑149 (MQ=255) aTTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAATGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCgg > 3:115134/1‑126 (MQ=255) aTTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAATGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCgg < 4:115134/126‑1 (MQ=255) cGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATcc < 7:321375/138‑1 (MQ=255) cGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATcc > 8:321375/1‑138 (MQ=255) ccGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATg > 1:33904/1‑149 (MQ=255) cGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATg < 8:231751/148‑1 (MQ=255) cTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTAc < 7:354126/92‑1 (MQ=255) cTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTAc > 8:354126/1‑92 (MQ=255) | TCAATGGTGGCCTGGCTGGCCTTGGCCCCTACCCGCTCGACCAGCGAGGCGTAGGCCGAGGTGAAGCTGGTACCGGTGCCGGAATTGGTGCCCACGGTCGACTTGGTCTGCAGGTCCAGCAGCGCGTTGGCATTGCGGTTGTCCGCCTTGCCGTCGGCATTGAACGACAGGGTAAAGCTGTCATTGGCCGCAGGGCTGCCACCGATTGTGGTCTCGACGGCAAAGGTACGCGGGTTACCGCTACCATCCAGAATCGGGTCGCCGGCCGCATCCAGCATCGGCACGGCGATG > NC_002947/4973739‑4974029 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |