New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5375384 | 39 (0.660) | 4 (0.070) | 3/242 | NT | 9.5% | coding (57/1128 nt) | dnaJ | chaperone protein DnaJ |
? | NC_002947 | = 5375412 | 40 (0.720) | coding (29/1128 nt) | dnaJ | chaperone protein DnaJ |
GGTCGAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCACCCGCCCGCTACCCATTAAGAGCCACTGACAGATGCT > NC_002947/5375239‑5375528 | ggTCGAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCt > 4:100686/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGGGGTCCGCtt < 4:207163/149‑1 (MQ=255) tCGAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTc < 7:77225/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAg > 7:96873/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCGTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCGTCAg > 3:238280/1‑149 (MQ=255) gCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGcgcc > 1:54804/1‑149 (MQ=255) gCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGcgcc > 8:118911/1‑149 (MQ=255) ttGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTc > 7:195948/1‑149 (MQ=255) tCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGgcgc < 1:201967/138‑1 (MQ=255) tCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGgcgc > 2:201967/1‑138 (MQ=255) aCAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacc < 6:173901‑M2/149‑6 (MQ=255) aGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacctc > 2:161220‑M2/1‑142 (MQ=255) cACTTCGTAGGCCTCGTTTGCCTCCTTGAACTTGGCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCat < 6:37361/149‑1 (MQ=255) cGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaa < 2:139510‑M1/147‑41 (MQ=255) cGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaa < 3:320131‑M1/147‑41 (MQ=255) tAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATc < 5:323875/149‑1 (MQ=255) cTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGCTTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacctca > 7:204855‑M2/1‑128 (MQ=255) ctcctTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCa > 6:290549/1‑136 (MQ=255) ctcctTGAACTTGTCTTCCCATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCa < 5:290549/136‑1 (MQ=255) ctTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaa > 5:65161‑M1/1‑88 (MQ=255) ctTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaa < 6:65161‑M1/125‑38 (MQ=255) ctTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAg > 2:276328‑M2/1‑116 (MQ=255) ctTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAg < 1:276328‑M2/117‑2 (MQ=255) ctTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGt > 2:255468/1‑148 (MQ=255) gTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCAcc > 5:42652/1‑149 (MQ=255) cTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCtt > 6:181680/1‑149 (MQ=255) ccGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCttg < 2:54804/147‑1 (MQ=255) cGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCttgttg < 7:118911/149‑1 (MQ=255) gATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTgg < 6:42652/149‑1 (MQ=255) aTTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGACCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGATTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTggg > 5:315383/1‑149 (MQ=255) tCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCCTCCGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGc < 4:238280/148‑1 (MQ=255) tttATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCa < 4:144107/135‑1 (MQ=255) tttATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCa > 3:144107/1‑135 (MQ=255) aTCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATaataat < 7:123329/107‑1 (MQ=255) aTCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATaataat > 8:123329/1‑107 (MQ=255) aTCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGtgtg < 5:173901/148‑1 (MQ=255) gCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATc > 1:345517/1‑105 (MQ=255) gCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATc < 2:345517/105‑1 (MQ=255) ggTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTgg < 7:86193/135‑1 (MQ=255) ggTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGAGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTgg > 8:86193/1‑135 (MQ=255) cGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCAt < 8:96873/148‑1 (MQ=255) gggTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCa < 5:181680/149‑1 (MQ=255) gtggtACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCAcc > 8:62798/1‑113 (MQ=255) gtggtACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCAcc < 7:62798/113‑1 (MQ=255) cATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTCGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCAc < 3:206756/142‑1 (MQ=255) cATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTAGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCAc > 4:206756/1‑142 (MQ=255) aTCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCACccgcccgc > 5:4661/1‑149 (MQ=255) aaCGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCACCCGCCCGCTACCCAt > 4:88748/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATa > 4:250454/1‑82 (MQ=255) cttcttGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCACCCGCCCGCTACCCATTAAGAGCCACTGa > 6:14159/1‑149 (MQ=255) ttcttGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaaggaggccaacgaggcctacg < 3:320131‑M2/147‑108 (MQ=255) ttcttGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaaggaggccaacgaggcctacg < 2:139510‑M2/147‑108 (MQ=255) ttGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaag < 6:65161‑M2/125‑89 (MQ=255) ttGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaag > 5:65161‑M2/1‑37 (MQ=255) tGAGGTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaagcggaagacaagttcaaggaggccaacgag > 7:204855‑M1/1‑8 (MQ=255) gAGGTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaaggaggccaacgaggcctacgaagtgct > 2:161220‑M1/1‑7 (MQ=255) gAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCACCCGCCCGCTACCCATTAAGAGCCACTGACAGa < 3:100686/147‑1 (MQ=255) ggTCCtgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaaggaggccaacgaggcctacgaagtgctgt < 6:173901‑M1/149‑145 (MQ=255) ctgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaag > 2:276328‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgggtgtcgagcgcggcgccactgaagcggacctcaagaaggcttaccgccgtttggcgatgaagtaccacccggaccgcaacccgggcgataaagaatcggaagacaagttcaag < 1:276328‑M1/117‑117 (MQ=255) | GGTCGAAGGCCGCACGCTTGCTCGCGTCTGACAGCACTTCGTAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAACTTGTCTTCCGATTCTTTATCGCCCGGGTTGCGGTCCGGGTGGTACTTCATCGCCAAACGGCGGTAAGCCTTCTTGAGGTCCGCTTCAGTGGCGCCGCGCTCGACACCCAGGACCTCATAATAATCACGCTTGGACATAGGTCATTTGCACCTTGTTGGGCGTGTGGCATCTGCGCCACGCCATCAGCACCCGCCCGCTACCCATTAAGAGCCACTGACAGATGCT > NC_002947/5375239‑5375528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |