New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5513242 = | 30 (0.510) | 5 (0.110) | 5/206 | NT | 20.9% | intergenic (+20/‑134) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 5513350 = | 14 (0.300) | intergenic (+128/‑26) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
GACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATC > NC_002947/5513094‑5513387 | gACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTCCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGgcg > 1:8672/1‑149 (MQ=255) gggCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTTGCGCCtgt > 6:247921/1‑149 (MQ=255) gcccacgccgttgcggcccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtgcatgt < 2:231355‑M1/6‑1 (MQ=255) cTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGAAGGTGCAGGCAGATGAGAGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAAGTTTTTGCGCCTTTGcc > 8:146444/1‑149 (MQ=255) tcgtcgGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCgg > 2:340580/1‑149 (MQ=255) cgtcgGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCg < 3:299153/147‑1 (MQ=255) cgGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCctc > 1:248474/1‑149 (MQ=255) cagcaTTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGGGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGGGCCGGCCTCTT‑c < 7:146444/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGAGCATGTGAGCGTGCTGCAGCAGGGGTGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCgg < 2:8672/149‑1 (MQ=255) ttGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCggg < 6:109407/149‑1 (MQ=255) gcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtacataagtgcagggtgacgaagtcttgagcatgtgagagttcctcaaagggatgatgtGCCTGTGCCGGCCTCTA‑CGCgg < 1:300408‑M1/22‑1 (MQ=255) ccagcaggcaggtcacttcgccgatcttggcttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCggg < 2:181096‑M1/23‑1 (MQ=255) gACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCTGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTaaac > 4:255102/1‑147 (MQ=255) aCCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAAccc > 6:32050/1‑149 (MQ=255) aTGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCAGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCg > 1:48716/1‑149 (MQ=255) tgACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTc < 8:253924/148‑1 (MQ=255) cACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTggg < 2:48716/147‑1 (MQ=255) cACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTggg < 2:248474/147‑1 (MQ=255) gaGGGGAGTGTGCTGGC‑GTAAGGCTCGGTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTaa < 5:61346/148‑1 (MQ=255) ggggAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATg > 7:209896/1‑149 (MQ=255) cttcgaaggacaggccgcgcaggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGc < 8:143055‑M1/52‑1 (MQ=255) tgtgCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATgg > 5:182309/1‑149 (MQ=255) tGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCAt > 1:251577/1‑142 (MQ=255) tGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCAt < 2:251577/142‑1 (MQ=255) gC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTATT‑AGCGGGTAAACCCCTTCCAACAGTGGGCGTAATGGCATGGGGCGGt > 8:163410/1‑148 (MQ=255) c‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTc < 5:32050/149‑1 (MQ=255) gCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGt > 7:128476/1‑119 (MQ=255) gCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGt < 8:128476/119‑1 (MQ=255) ggatgtggctgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAg > 4:114889‑M1/76‑149 (MQ=255) gCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGGGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTa < 1:340580/147‑1 (MQ=255) tgccgccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGtt < 8:224869‑M1/83‑1 (MQ=255) aGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGGTCCTACAGTGGGGGTAATGGCATGGGGCGGGTGCCGTCGGAGGAGCGGGtt > 8:223356/1‑149 (MQ=39) ccgtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAccc > 7:143055‑M1/62‑149 (MQ=255) gtagtactggtgcagggtgtcgatcttgagcatgtgagagttcctgaaagggatgctgtGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 7:224869‑M1/60‑149 (MQ=255) agATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 6:361873/149‑1 (MQ=255) cGGGTGGGCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 7:223356/149‑1 (MQ=255) gggTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGTATTTCAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCATTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 5:247921/149‑1 (MQ=255) gtCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacag < 8:209896/149‑1 (MQ=255) tATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTACGCGGGTAACCCCGTTCCTAAAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGc > 1:90892/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATc < 6:182309/148‑1 (MQ=255) | GACATGGGCTTCGTCGGCAGCATTGCCGACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGC‑GGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTT‑CGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGTGGGCGTAATGCCATGGGGCGGTTCCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATC > NC_002947/5513094‑5513387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |