New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5534108 = | 44 (0.750) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 7.0% | coding (367/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 5534150 = | 37 (0.650) | coding (325/1137 nt) | PP_4867 | BraC‑like branched‑chain amino acid ABC transporter substrate‑binding protein |
ACACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGCCTT > NC_002947/5533964‑5534254 | ccgctggtggcgtgaatggcgagaaaatcgtcctggtcaaaggcgatgacgcctgtgaaccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATc < 5:29264‑M1/5‑1 (MQ=255) acacCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGAt > 5:38284/1‑148 (MQ=255) cacaGCAACCATCATGCCCTTCAGCAAGTCGAAGATGTACTCGCCAGCGACGATACCATGCTAGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGCCCGCGCTCAGTGACATGTGGCTAGGTGGAGACTGTCGTCATGGCGATCa > 4:187487/1‑149 (MQ=255) cGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCAcgc > 4:118530/1‑149 (MQ=255) gCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTCGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCAcgcc > 8:250700/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATGCCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCatat < 6:325634/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTGACGGGCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCata < 3:187487/148‑1 (MQ=255) ccTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCata > 6:244373/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCAtata > 5:181793/1‑149 (MQ=255) aCGTCGACGATGTTGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGa < 3:9977/149‑1 (MQ=255) aCGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGa > 5:354014/1‑149 (MQ=255) gTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGAGGGTTGGTGGAGCATGGCGTGATGGCGATCACGCACGCCTCGTCATATACCTAGGACg > 4:75387/1‑149 (MQ=255) tCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGc > 4:175071/1‑149 (MQ=255) gacgaTGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCg > 7:14963/1‑149 (MQ=255) gTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCATCATATACCTCGGACGCCGGGATc < 6:38284/148‑1 (MQ=255) aGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCgtg > 4:335177/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCgtgt < 3:335177/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCgtgt < 3:118530/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGtt < 6:354014/149‑1 (MQ=255) gatgacgcctgtgaaccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATCACGCCCGCCTCGTCATACACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga > 4:290980‑M1/101‑149 (MQ=255) cgaGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga < 3:75387/147‑1 (MQ=255) cAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTggag < 3:175071/149‑1 (MQ=255) cAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTggag < 5:244373/149‑1 (MQ=255) gacgaTACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAAc < 7:250700/149‑1 (MQ=255) gaTACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAg > 2:110155/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTgg > 5:141540/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGGTGGAGGAACAGAAGTgg > 4:286112/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGc > 7:211777/1‑149 (MQ=255) ccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGtt < 1:140601‑M1/46‑1 (MQ=255) ccgaagcaagccgtggccgtggccaaccgcctggtcgatcaggacaaggtgattggcgtggtgggccacttctgttcctccaacaCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGtt > 2:140601‑M1/86‑131 (MQ=255) tcgtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCAATCAGGCCGCGATCAGTGAGCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACCCCCGCCTCGTCATATACGTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCcaccac > 8:235304/1‑149 (MQ=255) gtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTggag > 8:26651/1‑127 (MQ=255) gtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTggag < 7:26651/127‑1 (MQ=255) gtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGc < 5:191283/149‑1 (MQ=255) gtcACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGGGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCCGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGATGTGGCCCACCACg < 8:114893/148‑1 (MQ=255) aCGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga < 8:58439/123‑1 (MQ=255) aCGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgga > 7:58439/1‑123 (MQ=255) aCGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCaa > 8:167446/1‑149 (MQ=255) cGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCAcc > 5:283006/1‑149 (MQ=255) gCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCt > 6:29264/1‑149 (MQ=255) ggAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGa < 1:110155/149‑1 (MQ=255) gAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgg > 1:330487/1‑107 (MQ=255) gAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTgg < 2:330487/107‑1 (MQ=255) aGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCgg < 6:141540/147‑1 (MQ=255) gcTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTggccacg > 8:164923/1‑149 (MQ=255) tgtgGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGTACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAAACACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGgcttc > 5:139674/1‑148 (MQ=255) tgGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGgcttgct > 1:74260/1‑149 (MQ=255) ggtggAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGt < 8:14963/148‑1 (MQ=255) tGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCg > 7:274287/1‑148 (MQ=255) ggCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGCCtt > 4:256144/1‑149 (MQ=255) gCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGCCtt < 7:167446/148‑1 (MQ=255) | ACACCGCAACCTTCTTGCCCTTGAGCACGTCGACGATGTAGTCGCCAGCGACGATACCCTGCTGGTCGTCACGGCCGCACATGCGGAACATGGCACTCAGGCCGCGCTCAGTGACCTGTGGGTTGGTGGAGCCTGGGGTGATGGCGATCACGCCCGCCTCGTCATATACCTCGGACGCCGGGATCGTGTTGGAGGAACAGAAGTGGCCCACCACGCCAATCACCTTGTCCTGATCGACCAGGCGGTTGGCCACGGCCACGGCTTGCTTCGGTTCACAGGCGTCATCGCCTT > NC_002947/5533964‑5534254 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |