New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5855296 = | 51 (0.870) | 4 (0.070) | 3/248 | NT | 8.3% | coding (1316/1392 nt) | tcyP | sodium/cystine symporter |
? | NC_002947 | 5855345 = | 39 (0.690) | coding (1365/1392 nt) | tcyP | sodium/cystine symporter |
GCGGCGGTGCCACCTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGCTCGTGTCTTGCT > NC_002947/5855149‑5855427 | gcggcgGTGCCACCTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTc < 6:61344/149‑1 (MQ=255) ggcggTGCCACCTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCAc > 3:150886/1‑149 (MQ=255) tgctttgcagcccttcgcgggtgaacccgctcctacgggggggcgcagggtgttcaggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcatca < 8:260705‑M1/3‑1 (MQ=255) cggTGCCACCTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCAcca < 8:104392/149‑1 (MQ=255) cggTGCCACCTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCAcca < 5:200898/149‑1 (MQ=255) tttgcagcccttcgcgggtgaacccgctcctacgggggggcgcagggtgttcaggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcaTCAc < 6:351486‑M1/4‑1 (MQ=255) cTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCTTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACTTGAAAGGTTCGATGACGGCTGGCGTT‑GTCACCAGCAAGCttg > 7:301529/1‑147 (MQ=255) cTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGt > 7:228331/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGt > 3:294484/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGaaa < 3:330476/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGaaa < 4:307062/149‑1 (MQ=255) ccGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGaaa < 4:111361/149‑1 (MQ=255) gcgcTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGaaa < 2:289166/147‑1 (MQ=255) gcgcTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGaaa > 1:289166/1‑147 (MQ=255) cgcTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCAccagc < 4:287919/134‑1 (MQ=255) cgcTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCAccagc > 3:287919/1‑134 (MQ=255) gcTGATCGTGCTGCCTGCCTTGGGCTTGGGGGTGGAACTGGTGGCGTGGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTGGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGGGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAgaga < 8:266212/149‑1 (MQ=255) gcTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAgaga < 4:68893/149‑1 (MQ=255) gcTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAgaga < 6:145989/149‑1 (MQ=255) tGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACt > 6:113938/1‑149 (MQ=255) ctgcCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGGCGGCGGGCGTTAGTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAg < 1:232602/148‑1 (MQ=255) tgcCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATTGTCGTTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAgg > 1:76464/1‑148 (MQ=255) tgcCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAgg > 7:128718/1‑147 (MQ=255) ccaTGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTg > 6:125922/1‑149 (MQ=255) aTGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGc < 8:228331/149‑1 (MQ=255) aTGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGc < 4:150886/149‑1 (MQ=255) ggggcgcagggtgttcaggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcatc > 1:351327‑M1/108‑109 (MQ=255) ggggcgcagggtgttcaggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcatc < 2:351327‑M1/2‑1 (MQ=255) agggtgttcaggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcaTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGtga > 3:175643‑M1/101‑149 (MQ=255) agggtgttcaggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcaTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGtga > 5:351486‑M1/101‑149 (MQ=255) ccGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGtgatg < 8:128718/148‑1 (MQ=255) gAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGc < 4:286000/149‑1 (MQ=255) caggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcaTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGtg < 6:194713‑M1/48‑1 (MQ=255) caggttttgagcaagacacgagcggccttgtcgcgaaaggggcgcaatgcgccccggcgatctgtcaggtgtggctcagctcggcatgttcaTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGtg > 5:194713‑M1/93‑140 (MQ=255) gCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGa < 5:113938/148‑1 (MQ=255) tt‑tCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGa < 2:200487/149‑1 (MQ=255) tCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGAc < 3:86596/148‑1 (MQ=255) ggTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTCCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGa > 5:365409/1‑145 (MQ=255) gCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCg > 6:340681/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCg > 6:72833/1‑149 (MQ=255) cGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGc > 1:273231/1‑118 (MQ=255) cGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGc < 2:273231/118‑1 (MQ=255) aTCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCa > 8:260231/1‑149 (MQ=255) aCATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGATGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTgc > 7:272163/1‑149 (MQ=255) aCATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACAt > 3:255081/1‑107 (MQ=255) aCATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACAt < 4:255081/107‑1 (MQ=255) aCATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTgc > 7:244695/1‑149 (MQ=255) ggCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGcccc > 8:64029/1‑149 (MQ=255) gCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCAATGCGccccg < 5:72833/149‑2 (MQ=255) cGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCttt < 2:76464/149‑1 (MQ=255) cGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCttt < 6:365409/149‑1 (MQ=255) aacgtgaacgGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGcc > 8:185338/1‑149 (MQ=255) acgtgaacgGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCg > 2:47337/1‑149 (MQ=255) gtgaacgGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCAATGCGccccg < 4:297666/132‑2 (MQ=255) gtgaacgGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCAATGCGccccg > 3:297666/1‑131 (MQ=255) gaacgGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGCTCg > 7:260705/1‑149 (MQ=255) acgGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGCTCgtg < 7:64029/149‑1 (MQ=255) cGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGCTCGTGTCTTg < 5:340681/148‑1 (MQ=255) gATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGCTCGTGTCTTGCt < 2:102903/149‑1 (MQ=255) gggcgTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGc < 5:204428/128‑1 (MQ=255) gggcgTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGc > 6:204428/1‑128 (MQ=255) | GCGGCGGTGCCACCTTTGCCGCGCTGATCGTGCTGCCAGCCATGGGCTTGCCGGTGGAACTGGTGGCGTTGCTGATT‑TCGGTGGAGCCGCTGATCGACATGGGCCGTACGGCGTTGAACGTGAACGGTTCGATGACGGCGGGCGTT‑GTCACCAGCCAGCTGTTGAAAGAGACTGACAAGGAAGTGCTGGCCGGTGATGAACATGCCGAGCTGAGCCACACCTGACAGATCGCCGGGGCGCATTGCGCCCCTTTCGCGACAAGGCCGCTCGTGTCTTGCT > NC_002947/5855149‑5855427 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |