New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3622804 = | 38 (0.650) | 3 (0.050) | 3/242 | NT | 7.5% | coding (1249/1344 nt) | PP_3194 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3622852 = | 38 (0.690) | coding (1201/1344 nt) | PP_3194 | hypothetical protein |
ATGCTCACAGCCTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATGGGTTGCGGCGAA > NC_002947/3622705‑3622996 | aTGCTCACAGCCTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGAGAATTTAAGTCCTAAACATGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCTTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCATg > 6:261679/1‑148 (MQ=255) cctggaaccgggcaaacaggccgacctgctggtgctcgacggttcgcccctggacgacatccgcatccttcaagaccgcgctcggctgcAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTg < 8:233628‑M1/49‑1 (MQ=255) cctggaaccgggcaaacaggccgacctgctggtgctcgacggttcgcccctggacgacatccgcatccttcaagaccgcgctcggctgcAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTg > 7:233628‑M1/90‑138 (MQ=255) cTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAgc < 8:95827/146‑1 (MQ=255) cTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAgc > 7:95827/1‑146 (MQ=255) cTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGcgcg > 3:94538/1‑149 (MQ=255) cTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGGGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGcgcg < 5:261679/149‑1 (MQ=255) aTTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCt > 5:191107/1‑149 (MQ=255) ccGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGaa < 3:180466/148‑1 (MQ=255) ttCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGc > 7:192925/1‑149 (MQ=255) cGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCg < 4:94538/148‑1 (MQ=255) ggACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGa < 8:192925/149‑1 (MQ=255) ggACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGa < 1:162629/149‑1 (MQ=255) gACACGCGGTCGCGGGTGTAGATCTCGGTCCAATACATATAATTTAAAACAAACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGAt > 2:108636/1‑149 (MQ=255) gTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCa < 2:140080/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCa < 6:191107/149‑1 (MQ=255) gagGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGc > 6:337398/1‑142 (MQ=255) gagGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGc < 5:337398/142‑1 (MQ=255) gtcggtcCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTc > 4:54792/1‑147 (MQ=255) tcCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGACGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGACCCGTCGAGCAc > 5:308222/1‑148 (MQ=255) aGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCt < 3:47824/99‑1 (MQ=255) aGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCt > 4:47824/1‑99 (MQ=255) aaTTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGcc > 5:77997/1‑149 (MQ=255) aaTTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGcc > 3:175725/1‑149 (MQ=255) aTTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCt > 1:125662/1‑149 (MQ=255) gAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGtt > 3:142804/1‑149 (MQ=255) gAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTCGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGtt > 2:256243/1‑149 (MQ=255) gTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGc > 3:342703/1‑149 (MQ=255) acCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTc > 5:62903/1‑149 (MQ=255) gTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGa < 4:342703/149‑1 (MQ=255) ttGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCg > 6:240743/1‑147 (MQ=255) ttGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCg < 5:240743/147‑1 (MQ=255) ttGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAg > 8:322335/1‑149 (MQ=255) ggAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGc > 6:78425‑M1/3‑148 (MQ=255) gTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCg > 1:158602/1‑149 (MQ=255) tAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCg > 4:305872/1‑148 (MQ=255) caggcggtgtacaaggccggcgagccggtacggctgcaacgcaccgcctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAgg < 8:233628‑M2/89‑1 (MQ=255) caggcggtgtacaaggccggcgagccggtacggctgcaacgcaccgcctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAgg > 7:233628‑M2/50‑138 (MQ=255) aggcggtgtacaaggccggcgagccggtacggctgcaacgcaccgcctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGtc > 3:34715‑M2/49‑149 (MQ=255) CGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTcg > 2:125662‑M1/1‑149 (MQ=255) GGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTcgc < 2:104723‑M1/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCcgcgc > 3:237544/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCcgcgc > 7:170052/1‑149 (MQ=255) ccGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATc > 4:222045/1‑148 (MQ=255) cGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCaa < 8:170052/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGt < 7:322335/149‑1 (MQ=255) ccTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATgg < 2:158602/149‑1 (MQ=255) ttGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATGGGt > 6:305699/1‑149 (MQ=255) caccgcctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATGGGTTgcgg > 3:349112‑M2/9‑149 (MQ=255) gcctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATGGGTTGCGGCGaa < 3:305872‑M2/145‑1 (MQ=255) cctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATgg < 2:340596‑M2/134‑1 (MQ=255) cctGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCAACAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATgg > 1:340596‑M2/4‑137 (MQ=255) tGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCt < 1:265333‑M2/72‑1 (MQ=255) tGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCt > 2:265333‑M2/2‑73 (MQ=255) | ATGCTCACAGCCTCCATTTGCCGAGTTCGGACACGCGGTCGCGGGTGTAGAGGTCGGTCCATTTCAGCGAATTGAAGTCCGACACCTGCTTGGGGTTGTAGGCGGTGCGTTGCAGCCGTACCGGCTCGCCGGCCTTGTACACCGCCTGCAGCCGAGCGCGGTCTTGAAGGATGCGGATGTCGTCCAGGGGCGAACCGTCGAGCACCAGCAGGTCGGCCTGTTTGCCCGGTTCCAGGGTGCCGAGCGTCTCGCCGCGCGGCATCAAGCGTGCGCCGACATGGGTTGCGGCGAA > NC_002947/3622705‑3622996 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |