New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4734867 | 47 (0.800) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.9% | coding (768/2832 nt) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
? | NC_002947 | = 4734922 | 50 (0.880) | coding (713/2832 nt) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
TCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCT > NC_002947/4734775‑4735069 | tcgtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCc < 4:194077‑M2/149‑2 (MQ=255) tcgtcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCc < 8:172785‑M2/149‑2 (MQ=255) tcgAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCcgcc < 8:33989‑M2/149‑5 (MQ=255) aaCAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCtt > 8:322895/1‑148 (MQ=255) cTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGc < 6:237233/149‑1 (MQ=255) cTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGc > 5:237233/1‑149 (MQ=255) gcgcgGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGcc < 3:361487/147‑1 (MQ=255) gcgGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAAt < 2:194680/149‑1 (MQ=255) gcgGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAAt < 6:58517/149‑1 (MQ=255) ggTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGc < 3:194077/149‑1 (MQ=255) cTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTg < 2:166313/148‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCTAGGCCGAATCGCTTg > 3:22494/1‑147 (MQ=255) ttGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCTAGGCCGAATCGCTTg < 4:22494/147‑1 (MQ=255) ccGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGcc > 8:124587/1‑149 (MQ=255) cGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGccc < 7:322895/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTAGTGCCCgg > 4:147882/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGt < 7:172785/149‑1 (MQ=255) aCCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGt > 1:67985/1‑149 (MQ=255) ttCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTAc < 8:108217/135‑1 (MQ=255) ttCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTAc > 7:108217/1‑135 (MQ=255) aGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACtt > 8:218587/1‑149 (MQ=255) gcCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCa < 8:316479/149‑1 (MQ=255) ccACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCATGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAg > 1:32153/1‑149 (MQ=255) ggTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGccc < 2:211970/149‑1 (MQ=255) ccATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACcg < 1:68387/149‑1 (MQ=255) cGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGtt < 2:67985/149‑1 (MQ=255) gATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTa > 3:50974/1‑149 (MQ=255) aTCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTAc > 8:71299/1‑149 (MQ=255) gACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCt > 3:349634/1‑149 (MQ=255) ctcctTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGa < 7:218587/149‑1 (MQ=255) tcctTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGccc < 5:371872/108‑1 (MQ=255) tcctTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGccc > 6:371872/1‑108 (MQ=255) tcctTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTAATCCAGCATCGGAATCAGCCTCTCGCcgccaaggaggtgctgatcggcatgccccaacgtggccgcctgaacgtgctggtgaacaccttcggcaagaacccgagcgagatg < 8:226497‑M2/149‑86 (MQ=255) cctTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAg > 8:52637/1‑148 (MQ=255) ctTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCa < 4:349634/149‑1 (MQ=255) cgcCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTgg < 7:52637/149‑1 (MQ=255) ttaAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATGCAGGATCGGAATCAGGCTCTCGCcgccaaggaggtcgtgatcgggatggcccaccgtggccgcctgaacgtgctggtgaacaccttcggcaagaacccgcgggagctgttcgacgagt > 6:287589‑M2/2‑53 (MQ=255) agagCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCCCcgccaaggaggtcgtgatcggcaaggcccaccgtggccgcctgaacgtgctcgtgaacaccgtcggcaacaaccccccccagctcttccacgatttac < 5:287589‑M2/148‑99 (MQ=255) gCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa > 2:310436/1‑149 (MQ=255) aTCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGc < 7:108421/132‑1 (MQ=255) aTCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGc > 8:108421/1‑132 (MQ=255) tttCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa < 8:281322/140‑1 (MQ=255) tttCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa > 7:26343/1‑140 (MQ=255) tttCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa > 7:281322/1‑140 (MQ=255) tttCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGaa < 8:26343/140‑1 (MQ=255) tttCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGa < 7:152263/149‑1 (MQ=255) cATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACgg > 6:328254/1‑149 (MQ=255) aTCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGc > 4:274917/1‑149 (MQ=255) cATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTTGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCa < 3:147882/149‑1 (MQ=255) aTCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCAc < 4:50974/149‑1 (MQ=255) ggAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCt > 8:49727/1‑149 (MQ=255) aTCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCGCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTc < 2:32153/149‑1 (MQ=255) ggCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAgg > 2:22540/1‑149 (MQ=255) gCTCTCGCGGCGATCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGTCGGCCGCGCACGCTTTCCAGgc < 6:218440/149‑1 (MQ=255) gCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGgc > 8:350831/1‑149 (MQ=255) gCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCACGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCAAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATAGTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCACgc > 5:218440/1‑149 (MQ=255) tctcGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGgcgc > 5:223094/1‑149 (MQ=255) tcGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCgctg > 5:12790/1‑149 (MQ=255) gccgccTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCgctgct > 8:168595/1‑149 (MQ=255) | TCGTCGAACAGCTCGCGCGGGTTCTTGCCGAAGGTGTTCACCAGCACGTTCAGGCGGCCACGGTGGGCCATGCCGATCACGACCTCCTTGGCGCCGTAAGAGCCGGAACGCTGGATCATTTCATCCAGCATCGGAATCAGGCTCTCGCCGCCTTCAAGGCCGAATCGCTTGGTGCCCGGGTACTTGGTGCCCAGGTACTTTTCCAGGCCCTCACCGGCGGTTACGCGCTCGAGCAGGTGGGCCTGCACGTCAGCGGAATACTCCGGACGGCCGCGCACGCTTTCCAGGCGCTGCT > NC_002947/4734775‑4735069 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |