New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5783559 | 44 (0.750) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.0% | coding (2034/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
? | NC_002947 | = 5783588 | 51 (0.920) | coding (2063/3309 nt) | kefA | intermediate mechanosensitive channel protein |
GCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTGGCTGCACGGCGCCTG > NC_002947/5783440‑5783736 | gCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCAt > 7:257004/1‑149 (MQ=255) acgacgTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATcgcc > 8:228514‑M2/1‑145 (MQ=255) acgTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATcgccctg < 7:140808‑M2/149‑8 (MQ=255) gggCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTtcgtcg > 8:272737/1‑149 (MQ=255) gCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGcc > 7:209651/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGTAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCCCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCgt > 7:289137/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCgt < 8:257004/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTATGCGCTAATGACCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGctacta > 4:260704/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAg < 8:140808/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGc > 8:11791/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGc < 2:218195/148‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCtt < 2:184771/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGc < 1:358679/124‑1 (MQ=255) cTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGc > 2:358679/1‑124 (MQ=255) gctgctCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTAcc > 1:351901/1‑148 (MQ=255) gctCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCAGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATc > 1:303804/1‑149 (MQ=255) gctCAGCCGTCTGCTGCTCAACAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCt < 7:290227/141‑1 (MQ=255) gctCAGCCGTCTGCTGCTCAACAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCt > 8:290227/1‑141 (MQ=255) ctCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATc < 2:295816/148‑1 (MQ=255) tCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGa < 3:260704/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCATGTGCTTCGGCTACAACTACACGGCACTGCAGCTTACAGATCGa > 8:302932/1‑148 (MQ=255) aGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACt > 2:3809/1‑149 (MQ=255) gCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTc < 7:272737/149‑1 (MQ=255) tCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGcta > 3:252143/1‑111 (MQ=255) tCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGcta < 4:252143/111‑1 (MQ=255) gctgctCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTaca > 4:102682/1‑149 (MQ=255) ctgctCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATATacac > 4:291191/1‑149 (MQ=255) ctCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACAcc < 8:209651/147‑1 (MQ=255) ctCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCt > 1:224680/1‑149 (MQ=255) ggCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGAc > 1:88629/1‑125 (MQ=255) ggCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGAc < 2:88629/125‑1 (MQ=255) ccGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACAGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCt > 2:136901/1‑149 (MQ=255) gACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCtggtt > 3:245891/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGa > 3:187970/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGa > 6:325650/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATc < 2:351901/148‑1 (MQ=255) gCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCg < 2:224680/149‑1 (MQ=255) cTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGa < 1:3809/149‑1 (MQ=255) ttCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCCCCGCCCTGCCCATCGCCGTGTTTGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAgc > 3:98946/1‑149 (MQ=255) ttCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCtg < 5:366869/134‑1 (MQ=255) ttCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCtg > 6:366869/1‑134 (MQ=255) ttCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGaa < 3:102682/147‑1 (MQ=255) aGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATcgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcag < 4:368941‑M2/83‑49 (MQ=255) aGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATcgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcag > 3:368941‑M2/1‑35 (MQ=255) gggCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATcgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgccc > 8:280602‑M2/1‑34 (MQ=255) gggCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATcgccctgcggaacagcgaggtgtcacggtgtgccgggctgctgagcagcagacggctgagcagccaggccattagcgcatagcaggtcagcaccacgccgatgccc < 7:280602‑M2/140‑107 (MQ=255) ggTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTgc > 5:99554/1‑149 (MQ=255) gggTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGt > 4:360563/1‑142 (MQ=255) gggTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGt < 3:360563/142‑1 (MQ=255) gggTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGc < 6:99554/149‑1 (MQ=255) gggTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGc < 4:245891/149‑1 (MQ=255) gCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGATGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTc < 8:289137/149‑1 (MQ=255) gTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAgccgc > 7:40618/1‑129 (MQ=255) gTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAgccgc < 8:40618/129‑1 (MQ=255) aCCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTGGc > 5:873/1‑149 (MQ=255) cGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTc < 4:79489/141‑1 (MQ=255) cGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTc > 3:79489/1‑141 (MQ=255) gCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTGGCTGc < 7:11791/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTGGCTGCACGGCGCCTg < 5:325650/149‑1 (MQ=255) tCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTGGCTGCACGGCGCCTg < 3:291191/149‑1 (MQ=255) | GCAGACGACGTGTTGGGCATCGGCGTGGTGCTGACCTGCTATGCGCTAATGGCCTGGCTGCTCAGCCGTCTGCTGCTCAGCAGCCCGGCACACCGTGACACCTCGCTGTTCCGCAGGGCGGTGGGGGTAGCGTTCACCGCCCTGCCCATCGCCCTGTTCGTCGCCGTGTGCTTCGGCTACTACTACACGGCACTGAAGCTTACCGATCGACTCATCTACACCCTGTACCTGCTGCTGTTCTGGTTGGTGATCGAAGCCGCCTTCGTGCGCGGCCTGTCGGTGGCTGCACGGCGCCTG > NC_002947/5783440‑5783736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |