New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 772928 | 46 (0.890) | 5 (0.100) | 4/252 | NT | 9.7% | coding (591/1044 nt) | PP_0664 | homoserine dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 772998 | 49 (0.980) | coding (661/1044 nt) | PP_0664 | homoserine dehydrogenase |
GTTCGAATACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCT > NC_002947/772781‑773076 | gTTCGAATACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGggcttggct > 1:190179/1‑149 (MQ=255) gTTCGAATACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGC > 6:74147‑M1/1‑148 (MQ=255) gTTCGAATACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGC < 5:74147‑M1/148‑1 (MQ=255) gAATACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCaa > 4:203797/1‑149 (MQ=255) aaTACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAAc > 3:44307/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAgg > 8:240258/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGc > 4:1752/1‑149 (MQ=255) aTGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGc < 3:1752/149‑1 (MQ=255) tGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGca < 4:44307/149‑1 (MQ=255) gAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGca > 2:82418/1‑148 (MQ=255) aGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGcac < 1:177189/148‑1 (MQ=255) cGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAg < 5:299480/149‑1 (MQ=255) gCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGttccacatcggcggtcgggtcagcctcgg > 2:49263‑M1/1‑119 (MQ=255) gCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAgcg > 7:92655/1‑149 (MQ=255) cacaCCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAAc > 2:51613/1‑124 (MQ=255) cacaCCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAAc < 1:51613/124‑1 (MQ=255) acacCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCGTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGTCTTCAACGAGGCTGTGGCACAGGCACAAGCGCt < 4:115901/149‑1 (MQ=255) acacCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCcttccacatcggcggtcgggtcagcctcggc > 5:258894‑M1/1‑117 (MQ=255) tgctgcGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCttt < 8:255929/149‑1 (MQ=255) ctgcGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTg < 1:82418/149‑1 (MQ=255) gcGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGcc > 8:133334/1‑148 (MQ=255) cGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGa < 3:203797/149‑1 (MQ=255) tATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAgg < 3:317291/149‑1 (MQ=255) gcCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCg > 7:107399/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGAcagc < 7:133334/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCtt < 2:59792/121‑1 (MQ=255) ccTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGAccgcc > 5:271661/1‑148 (MQ=255) gcgggcgcgggcTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGAtgt < 3:116675/149‑1 (MQ=255) gcgggcgcgggcTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGAt < 5:241351/147‑1 (MQ=255) gcgcgggcTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGaa < 6:335644/149‑1 (MQ=255) cgcgggcTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAg > 4:254894/1‑149 (MQ=255) gcgGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGCGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGg > 7:212090‑M2/1‑148 (MQ=255) gcTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGttccacatcggcggtcgggtcagcctcggcaaagccaagcgcttgtgcctgggccaccgcctcgttgaagccaag < 1:49263‑M1/149‑76 (MQ=255) cTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCcttccacatcggcggtcgggtcagcctcggcaaagccaagcgcttgtgcctgggccaccgcctcgttgaagccaag < 5:184934‑M1/149‑77 (MQ=255) gTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCcttccacatcggcggtcgggtcagcctcggcaaagccaagcgcttgtgcctgggccaccgcctcgttgaagccaagccc < 6:258894‑M1/148‑80 (MQ=255) tAGGGTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTa < 7:240258/149‑1 (MQ=255) gTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGc < 2:190179/149‑1 (MQ=255) gAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCtt < 7:297599/93‑1 (MQ=255) gAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCtt > 8:297599/1‑93 (MQ=255) ttCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAggtggt > 6:164648/1‑148 (MQ=255) ctcAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGa < 6:36952/148‑1 (MQ=255) aCGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTc < 5:284984/149‑1 (MQ=255) ggTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGc < 8:92655/149‑1 (MQ=255) ggTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGc < 2:11605/149‑1 (MQ=255) ctctAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAAt > 7:206133/1‑148 (MQ=255) tctAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgcc > 1:53493‑M2/1‑109 (MQ=255) tctAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgcc < 2:53493‑M2/112‑4 (MQ=255) tAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGt > 7:272552/1‑149 (MQ=255) cTATGTGCTCTCGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAggtgg < 8:181268/128‑1 (MQ=255) cTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAggtgg > 7:181268/1‑128 (MQ=255) tATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGAccgc < 6:172785/92‑1 (MQ=255) tATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGAccgc > 5:172785/1‑92 (MQ=255) cACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCt > 6:162052/1‑149 (MQ=255) aCGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCt < 3:254894/148‑1 (MQ=255) aCGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTg > 3:66705/1‑149 (MQ=255) gtgctggcttggtttCAACGCGTGGGTGGCCCCTGCACAATCTCTTGGCTTTGCCGTGGCTTAACCGACCGCCGATTTGGAAGGGCATTACGTACGCCTGAAGGTGTTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAggtgg < 8:206133/144‑1 (MQ=255) ggaAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGCCCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAggtgg > 8:6405/1‑149 (MQ=255) gggCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctac < 6:258894‑M2/148‑70 (MQ=255) gggCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGGGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGa < 6:271661/149‑1 (MQ=255) cttggcttCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaag < 5:184934‑M2/149‑74 (MQ=255) cttggcttCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaagc < 1:49263‑M2/149‑74 (MQ=255) ggCcttccacatcggcggtcgggtcagcctcggcaaagccaagcgcttgtgcctgggccaccgcctcgttgaagccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttaga > 1:53493‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCcttccacatcggcggtcgggtcagcctcggcaaagccaagcgcttgtgcctgggccaccgcctcgttgaagccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttaga < 2:53493‑M1/112‑110 (MQ=255) ccttccacatcggcggtcgggtcagcctcggcaaagccaagcgcttgtgcctgggccaccgcctcgttgaagccaagcgcttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaagcccgc > 7:212090‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTTCGAATACGAAGGCGCCGTCATGAGCGGCACACCGGTGCTGCGTATGGCGCGCCAGACCCTGGCGGGCGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGA‑GGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCT > NC_002947/772781‑773076 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |