New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 772928 | 46 (0.890) | 5 (0.100) | 4/252 | NT | 9.7% | coding (591/1044 nt) | PP_0664 | homoserine dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 772998 | 49 (0.980) | coding (661/1044 nt) | PP_0664 | homoserine dehydrogenase |
CGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGAGCGCTGGAAGC > NC_002947/772850‑773145 | cgcgggcTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAg > 4:254894/1‑149 (MQ=255) gcgGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGCGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGg > 7:212090‑M2/1‑148 (MQ=255) tAGGGTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTa < 7:240258/149‑1 (MQ=255) gTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGc < 2:190179/149‑1 (MQ=255) ttCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAggtggt > 6:164648/1‑148 (MQ=255) ctcAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGa < 6:36952/148‑1 (MQ=255) aCGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTc < 5:284984/149‑1 (MQ=255) ggTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGc < 2:11605/149‑1 (MQ=255) ggTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGc < 8:92655/149‑1 (MQ=255) ctctAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAAt > 7:206133/1‑148 (MQ=255) tctAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgcc > 1:53493‑M2/1‑109 (MQ=255) tctAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgcc < 2:53493‑M2/112‑4 (MQ=255) tAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGt > 7:272552/1‑149 (MQ=255) cTATGTGCTCTCGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAggtgg < 8:181268/128‑1 (MQ=255) cTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAggtgg > 7:181268/1‑128 (MQ=255) cACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCt > 6:162052/1‑149 (MQ=255) aCGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCt < 3:254894/148‑1 (MQ=255) aCGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTg > 3:66705/1‑149 (MQ=255) gtgctggcttggtttCAACGCGTGGGTGGCCCCTGCACAATCTCTTGGCTTTGCCGTGGCTTAACCGACCGCCGATTTGGAAGGGCATTACGTACGCCTGAAGGTGTTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAggtgg < 8:206133/144‑1 (MQ=255) ggaAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGCCCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAggtgg > 8:6405/1‑149 (MQ=255) gggCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctac < 6:258894‑M2/148‑70 (MQ=255) gggCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGGGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGa < 6:271661/149‑1 (MQ=255) cttggcttCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaag < 5:184934‑M2/149‑74 (MQ=255) cttggcttCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaagc < 1:49263‑M2/149‑74 (MQ=255) ttCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTg > 2:220087/1‑149 (MQ=255) ttCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTg > 1:38637/1‑149 (MQ=255) aaCGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATg < 3:180709/73‑1 (MQ=255) aaCGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATg > 4:180709/1‑73 (MQ=255) aaCGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAg > 2:161182/1‑149 (MQ=255) aaCGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAg < 4:66705/149‑1 (MQ=255) aCGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGc > 4:2095/1‑149 (MQ=255) cGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCg < 8:272552/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGt < 1:161182/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCCAGGCACGAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTc > 7:163085/1‑91 (MQ=255) ggTGGCCCAGGCACCAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTc < 8:163085/91‑1 (MQ=255) ccAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAg > 5:159780/1‑94 (MQ=255) ccAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAg < 6:159780/94‑1 (MQ=255) ccAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCa < 6:158754/143‑1 (MQ=255) ccAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAgagatc > 5:158754/1‑144 (MQ=255) cAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCAt > 3:4199/1‑149 (MQ=255) aGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATc < 8:107399/149‑1 (MQ=255) acaAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGa > 7:308578/1‑147 (MQ=255) caAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAg < 2:38637/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGgtggtg > 3:214116/1‑71 (MQ=255) aaGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGgtggtg < 4:214116/71‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTa < 3:15328/148‑1 (MQ=255) gCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGgccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaagcccgcgcccgccagggtctggcgcgccatacgcagcaccggtgt > 5:258894‑M2/1‑31 (MQ=255) ccGAGGCTGACGCGACCGCCGATTTGGAAGGCCTTGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCAt < 2:186384/127‑1 (MQ=255) ccGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGccaagcccttcctccatgcgcgtgagcacatagttagaggtaccgttgagaatgccctcgaaacctaccaagcccgcgcccgccagggtctggcgcgccatacgcagcaccggtgtgc > 2:49263‑M2/1‑30 (MQ=255) ccGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTCCGCCTGAAGGTGCTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCAt > 1:186384/1‑127 (MQ=255) ggCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCAc > 4:322358/1‑149 (MQ=255) ccGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCgg > 2:186878/1‑127 (MQ=255) ccGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCgg < 1:186878/127‑1 (MQ=255) ccGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGggcggc > 4:163198/1‑149 (MQ=255) gACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGcggcgg < 3:322358/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGGGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGcggcgg < 8:308578/149‑1 (MQ=255) gccgATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGa < 3:163198/149‑1 (MQ=255) cgATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGAgc > 5:130892/1‑149 (MQ=255) cgATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGAgc > 3:36209/1‑149 (MQ=255) cgATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGAgc > 2:176825/1‑149 (MQ=255) aGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGAGCGCTGGAAGc < 4:4199/149‑1 (MQ=255) | CGCGGGCTTGGTAGGTTTCGAGGGCATTCTCAACGGTACCTCTAACTATGTGCTCACGCGCATGGAGGAAGGGCTTGGCTTCAACGAGGCGGTGGCCCAGGCACAAGCGCTTGGCTTTGCCGAGGCTGACCCGACCGCCGATGTGGAAGGCCATGACGTACGCCTGAAGGTGGTGATCCTCGCCAATGAGTTGCTCGGCGCCTGTCTGCAGGTGGGTGATGTGGCCTGCAGCGGTATCAGTGCCATCGACAGCGCGGCTATCGAGCGGGCACGGGCGGCGGGCGAGCGCTGGAAGC > NC_002947/772850‑773145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |