| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2392868 = | 83 (1.610) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 5.0% | coding (1397/2403 nt) | PP_2097 | sensory box protein |
| ? | NC_002947 | 2392908 = | 72 (1.470) | coding (1437/2403 nt) | PP_2097 | sensory box protein | |||||
ACCTGGTACTGCCGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAA > NC_002947/2392721‑2393015 | aCCTGGTACTGCCGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGAt < 7:44928/149‑1 (MQ=255) gatattggtagatgccgcccggcacctcggcactgagcttttccagcaaccggtcacgcgctgccaacgcctcatgcacccggcgccgctcggtcacgtcaatgcagatggccaggtagccaacccacaacccctgttcgtcgagcATg < 2:109809‑M1/3‑1 (MQ=255) ccTGGTACTGCCGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATg < 4:319930/149‑1 (MQ=255) attggtagatgccgcccggcacctcggcactgagcttttccagcaaccggtcacgcgctgccaacgcctcatgcacccggcgccgctcggtcacgtcaatgcagatggccaggtagccaacccacaacccctgttcgtcgagcATgg < 3:132849‑M1/4‑1 (MQ=255) ttggtagatgcctcccggcacctcggcactgagcttatccagcaaccggtcacgagctgccaacgcctcattcacccggcgccgctctgtcacgtcaatgcagatggccaggtagccaacccacaacccctgttcgtctagcATGGca > 6:276851‑M1/143‑148 (MQ=255) ttggtagatgccgcccggcacctcggcactgagcttttccagcaaccggtcacgcgctgccaacgcctcatgcacccggcgccgctcggtcacgtcaatgcagatggccaggtagccaacccacaacccctgttcgtcgagcATGGca > 4:274004‑M1/143‑148 (MQ=255) gtccTGCCGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGTCCTTGAGCTTGCGTTGTGGACGCTCCATTGCTGGCTGCCAGGCGATGTTCGCTGACACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCTATGGca < 6:48122/145‑1 (MQ=255) gTACTGCCGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGc < 3:213179/147‑1 (MQ=255) ccGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGcagccagc < 4:196457/148‑1 (MQ=255) ccGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGcagccagc > 3:196457/1‑148 (MQ=255) ccGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGcagccagc < 1:224239/148‑1 (MQ=255) ccGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCt > 6:9159/1‑149 (MQ=255) ggaggaGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTgg < 1:135267/149‑1 (MQ=255) aggagCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTc < 3:229308/149‑1 (MQ=255) aggagCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTc < 2:326176/149‑1 (MQ=255) ggagCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATgg > 7:156596/1‑135 (MQ=255) ggagCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATgg < 8:156596/135‑1 (MQ=255) gagCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑c < 8:171356/149‑1 (MQ=255) 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gCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTgg > 4:295928/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTg < 7:285868/147‑1 (MQ=255) tGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGa < 6:18612/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGAc < 5:253213/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTg > 6:306699/1‑149 (MQ=255) 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ggCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTgg > 1:153944/1‑148 (MQ=255) gCGAGTGGAGCTTGCTACGGGCGTATGGCAGGCAGCTGGTAT‑CCAACATGCTGGTGACTTCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGAGCGAGCGGCGACGGGTGAATGAGGGGTTgg < 2:103561/147‑1 (MQ=255) gCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTgg > 8:246596/1‑147 (MQ=255) gCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTgg < 6:96867/147‑1 (MQ=255) tGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGcgcg > 4:132849/1‑149 (MQ=255) gACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGt < 2:153944/148‑1 (MQ=255) gACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTg > 6:149773/1‑149 (MQ=255) cTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCgg < 4:40600/121‑1 (MQ=255) cTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCgg > 3:40600/1‑121 (MQ=255) ttGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCg > 7:127276/1‑149 (MQ=255) tACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTg > 5:272842/1‑149 (MQ=255) aCGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGAc > 6:9914/1‑97 (MQ=255) aCGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGAc < 5:9914/97‑1 (MQ=255) cGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGc < 7:117232/148‑1 (MQ=255) cGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGc < 5:149773/148‑1 (MQ=255) cGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCt < 4:321385/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTgg > 1:45969/1‑148 (MQ=255) gCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTgg > 3:4521/1‑148 (MQ=255) cGATGGCAGCCAGCTGGTCT‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGaaa < 7:189810/149‑1 (MQ=255) gATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGaaaa < 2:45969/149‑1 (MQ=255) | ACCTGGTACTGCCGGAGGAGCTGAACCTGCGTGCCCAGGCCTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAA > NC_002947/2392721‑2393015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |