| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2392868 = | 83 (1.610) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 5.0% | coding (1397/2403 nt) | PP_2097 | sensory box protein |
| ? | NC_002947 | 2392908 = | 72 (1.470) | coding (1437/2403 nt) | PP_2097 | sensory box protein | |||||
CTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTACCAATATC > NC_002947/2392761‑2393053 | cTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGc > 3:119874/1‑149 (MQ=255) gAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCGTTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTc < 7:197482/148‑1 (MQ=255) cagcaaccggtcacgcgctgccaacgcctcatgcacccggcgccgctcggtcacgtcaatgcagatggccaggtagccaacccacaacccctgttcgtcgagcATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTcga > 4:147661‑M1/104‑149 (MQ=255) gCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTgga < 6:297385/148‑1 (MQ=255) gCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGaa < 6:17149/148‑1 (MQ=255) gTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGAGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAg > 7:205424/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTtg > 2:107078/1‑149 (MQ=255) gcgcCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTgg < 3:270325/149‑1 (MQ=255) agcaatGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTgg < 4:133602/144‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTgg < 7:8947/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTgg > 3:273569/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGc > 5:96867/1‑149 (MQ=255) atggcgcggcCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCGCCCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGc < 1:81974/144‑1 (MQ=255) gCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCt < 7:83125/148‑1 (MQ=255) caggcggcCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTCTTTAAGGCCCAAGGCACCCCCCAAGTCG‑CCAACAAGCGGGGGACAGCCCAGCTCGACCCACAAGGGGTTTGGGTTggggac > 1:103561/3‑145 (MQ=255) cTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTgg > 5:112636/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTgg < 6:112636/140‑1 (MQ=255) gcCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGcc < 5:135246/149‑1 (MQ=255) 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gAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCg > 3:56404/1‑149 (MQ=255) cACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGt < 6:265453/149‑1 (MQ=255) cACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGt < 5:44072/149‑1 (MQ=255) gggCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCAt < 5:332510/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATg < 4:56404/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTg > 5:272842/1‑149 (MQ=255) aCGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGAc > 6:9914/1‑97 (MQ=255) aCGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGAc < 5:9914/97‑1 (MQ=255) cGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGc < 7:117232/148‑1 (MQ=255) cGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGc < 5:149773/148‑1 (MQ=255) cGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCt < 4:321385/149‑1 (MQ=255) 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atggcagtcaccagcatgttggcgaccagctggctgccatGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAgcgc < 5:326534‑M2/89‑1 (MQ=255) atggcagtcaccagcatgttggcgaccagctggctgccatGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAgcgc > 6:326534‑M2/41‑129 (MQ=255) CAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCa > 7:246596‑M1/1‑149 (MQ=255) AGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAg < 7:163037‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGt > 8:251377‑M1/1‑149 (MQ=255) ccagcTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGCCGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTg > 7:49996/1‑149 (MQ=255) ccagcTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTg > 2:260684/1‑149 (MQ=255) ccagcTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTg > 1:219497/1‑149 (MQ=255) agcTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGcc > 1:292873/1‑149 (MQ=255) ggcagTCA‑CCAGCATGTTGGCGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGGTGGAAAAGCTCAGTGCCg > 7:240678/5‑149 (MQ=255) 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tGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGggcggc < 1:260684/149‑1 (MQ=255) tGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTAGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGGGAACGGTTGCTGGAAATGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGAAt > 8:226252/1‑148 (MQ=255) gTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATc < 4:273569/147‑1 (MQ=255) gTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTa > 4:120001/1‑149 (MQ=255) aCTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTAcc < 2:292873/148‑1 (MQ=255) tgccatGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTACCaa > 4:274004‑M2/7‑148 (MQ=255) tgccatGCTAGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACAGAGCGGCGCCGGGTGAATGAGGCGTTGGCAGCTCGTGACCGGTTGCTGGATAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGAGGCATCTACCaa > 6:276851‑M2/7‑148 (MQ=255) ccatGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTACCAat < 3:132849‑M2/143‑1 (MQ=255) catGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTACCAATATc < 2:109809‑M2/146‑1 (MQ=255) | CTTGAGCTTGCGTTTTGGCCGCGCCATTGCTGGCGGCCAGGCGATGTTCGCTGAAACGGTGCAGGAGCACGGGGCCGAGCCTGGCGAGTGGACCTTGCTACGGGCCGATGGCAGCCAGCTGGTCG‑CCAACATGCTGGTGACTGCCATGCTCGACGAACAGGGGTTGTGGGTTGGCTACCTGGCCATCTGCATTGACGTGACCGAGCGGCGCCGGGTGCATGAGGCGTTGGCAGCGCGTGACCGGTTGCTGGAAAAGCTCAGTGCCGAGGTGCCGGGCGGCATCTACCAATATC > NC_002947/2392761‑2393053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |