New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3471591 = | 53 (1.030) | 5 (0.100) | 4/248 | NT | 9.9% | coding (941/2460 nt) | PP_3084 | ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | 3471661 = | 40 (0.810) | coding (871/2460 nt) | PP_3084 | ferric siderophore receptor |
CCTGGTTGATACGCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGA > NC_002947/3471445‑3471735 | actcgagcgggtcgaagtattcaagggttccagtgcttttctcaatggggtcgcgccacagggtagcggcatcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCgg < 1:214086‑M1/3‑1 (MQ=255) cTGGTTGATACGCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCggg > 2:165361/1‑149 (MQ=255) aCGCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAAc > 8:157060/1‑149 (MQ=255) cGCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACg < 5:66985/149‑1 (MQ=255) cGCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACg < 5:146047/149‑1 (MQ=255) agCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACg < 5:211640/148‑1 (MQ=255) ctctTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAACCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGt > 3:236955/1‑149 (MQ=255) tctTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGtt < 8:154508/149‑1 (MQ=255) tttCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGtt < 1:127415/147‑1 (MQ=255) ttCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTc > 8:58710/1‑149 (MQ=255) cTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCtt > 5:63821/1‑149 (MQ=255) ggaagccAGGTCGTTGGACAGGGGCAGCCGTTCACCACTGTATTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCa < 8:261982/143‑1 (MQ=255) gTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCa < 8:222274/148‑1 (MQ=255) aCCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCa > 5:94840/1‑148 (MQ=255) cagtgcttttctcaatggggtcgcgccacagggtagcggcatcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGc < 2:177669‑M1/33‑1 (MQ=255) tCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTg < 7:58710/149‑1 (MQ=255) ggTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTTCGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGc < 3:102098/149‑1 (MQ=255) ggTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGc > 7:200880/1‑149 (MQ=255) gTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAAc > 3:85818/1‑124 (MQ=255) gTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAAc < 4:85818/124‑1 (MQ=255) ggACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTg > 2:342/1‑127 (MQ=255) ggACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTg < 1:342/127‑1 (MQ=255) gcgcAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTc > 6:120755/1‑147 (MQ=255) gCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTgg < 4:286895/149‑1 (MQ=255) cGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTgg > 7:89873/1‑147 (MQ=255) cGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTgg < 8:89873/147‑1 (MQ=255) ccacagggtagcggcatcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGccaccca < 7:82465‑M1/58‑1 (MQ=255) ggtagcggcatcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccac < 4:219426‑M1/1‑1 (MQ=255) ggtagcggcatcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccac > 3:219426‑M1/86‑86 (MQ=255) cAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGccc > 8:279504/1‑149 (MQ=255) aaGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCg > 8:193346/1‑149 (MQ=255) aGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGt > 6:68529/1‑149 (MQ=255) gggCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTg < 6:132537/149‑1 (MQ=255) catcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTg > 7:140175‑M1/78‑149 (MQ=255) tcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGc > 1:177669‑M1/76‑149 (MQ=255) aggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGc > 8:82465‑M1/72‑145 (MQ=255) cAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGccacc > 1:102685/1‑124 (MQ=255) cAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGccacc < 2:102685/124‑1 (MQ=255) aaGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTc > 6:133997/1‑147 (MQ=255) gCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAgg < 4:236955/149‑1 (MQ=255) gCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAgg < 5:120755/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAggg < 7:157060/149‑1 (MQ=255) ggTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACgg < 7:103966/76‑1 (MQ=255) ggTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACgg > 8:103966/1‑76 (MQ=255) gCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGgc < 5:133997/149‑1 (MQ=255) gTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGTCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTa < 8:112126/148‑1 (MQ=255) gTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCt < 6:94840/147‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCtt < 6:63821/149‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCtt < 8:200880/149‑1 (MQ=255) gCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCt > 3:99569/1‑149 (MQ=255) gCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCt > 3:285679/1‑149 (MQ=255) ccACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTggg > 1:20276/1‑149 (MQ=255) ccGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAATGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGccacccac > 2:180414/1‑83 (MQ=255) ccGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAATGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGccacccac < 1:180414/83‑1 (MQ=255) ccGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCAc < 2:20276/149‑1 (MQ=255) aTGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCCCCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGt < 4:28723/149‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCCCCAGGTTGAt > 6:303927/1‑149 (MQ=255) tGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGAt > 3:145425/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATc < 5:68529/148‑1 (MQ=255) gCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGc < 4:285679/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGccc > 6:314854/1‑149 (MQ=255) ttGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTcc > 5:299705/1‑149 (MQ=255) gATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGa > 1:10070/1‑149 (MQ=255) | CCTGGTTGATACGCTCTTTCTGGTAACCCAGGTCGGTGGACAGGCGCAGCCGTTCACCACGGTAGTCAAGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGA > NC_002947/3471445‑3471735 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |