New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3471591 = | 53 (1.030) | 5 (0.100) | 4/248 | NT | 9.9% | coding (941/2460 nt) | PP_3084 | ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | 3471661 = | 40 (0.810) | coding (871/2460 nt) | PP_3084 | ferric siderophore receptor |
AGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGACCCGCTCGAGT > NC_002947/3471513‑3471806 | aGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGt > 6:68529/1‑149 (MQ=255) gggCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTg < 6:132537/149‑1 (MQ=255) catcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTg > 7:140175‑M1/78‑149 (MQ=255) tcggaggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGc > 1:177669‑M1/76‑149 (MQ=255) aggggcgatcaacctggtgcccaagcgtgccgaagatagcgccacgcggcatgtcaccctcgactacgccaCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGc > 8:82465‑M1/72‑145 (MQ=255) aaGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTc > 6:133997/1‑147 (MQ=255) gCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAgg < 5:120755/149‑1 (MQ=255) gCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAgg < 4:236955/149‑1 (MQ=255) cAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAggg < 7:157060/149‑1 (MQ=255) gCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGgc < 5:133997/149‑1 (MQ=255) gTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGTCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTa < 8:112126/148‑1 (MQ=255) gTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCt < 6:94840/147‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCtt < 8:200880/149‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCtt < 6:63821/149‑1 (MQ=255) gCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCt > 3:285679/1‑149 (MQ=255) gCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCt > 3:99569/1‑149 (MQ=255) ccACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTggg > 1:20276/1‑149 (MQ=255) ccGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCAc < 2:20276/149‑1 (MQ=255) aTGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCCCCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGt < 4:28723/149‑1 (MQ=255) tGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCCCCAGGTTGAt > 6:303927/1‑149 (MQ=255) tGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGAt > 3:145425/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATc < 5:68529/148‑1 (MQ=255) gCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGc < 4:285679/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGccc > 6:314854/1‑149 (MQ=255) ttGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTcc > 5:299705/1‑149 (MQ=255) gccacgggcgacaacgtgggtggccacctcgacctgggccagcgttttggtgaagacaaccgttttggcgcccgTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCt > 8:82465‑M2/75‑145 (MQ=255) gccacgggcgacaacgtgggtggccacctcgacctgggccagcgttttggtgaagacaaccgttttggcgcccgTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGa > 1:177669‑M2/75‑149 (MQ=255) gATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGa > 1:10070/1‑149 (MQ=255) cacgggcgacaacgtgggtggccacctcgacctgggccagcgttttggtgaagacaaccgttttggcgcccgTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATg > 7:140175‑M2/73‑149 (MQ=255) CGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTa > 4:145425‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTAc > 1:165361‑M1/1‑149 (MQ=255) cAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCgg < 6:105542/105‑1 (MQ=255) cAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCgg > 5:105542/1‑105 (MQ=255) cAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTAccc > 2:214086/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCt < 7:279504/149‑1 (MQ=255) aaaaCGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCt > 3:228876/1‑149 (MQ=255) tgggtggccacctcgacctgggccagcgttttggtgaagacaaccgttttggcgcccgTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTgg < 7:82465‑M2/91‑1 (MQ=255) ttGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCCGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGgcgc > 7:251045/1‑149 (MQ=255) cTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGCGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGAcc > 3:49048/1‑149 (MQ=255) ccAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCgg < 3:18709/88‑1 (MQ=255) ccAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCgg > 4:18709/1‑88 (MQ=255) cAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCAcc > 2:11251/1‑101 (MQ=255) cAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCAcc < 1:11251/101‑1 (MQ=255) aCGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGaa < 5:314854/149‑1 (MQ=255) gcgttttggtgaagacaaccgttttggcgcccgTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTg < 2:177669‑M2/116‑1 (MQ=255) cAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCATAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTg > 7:18817/1‑148 (MQ=255) gCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCAc < 6:322567/134‑1 (MQ=255) gCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCAc > 5:322567/1‑134 (MQ=255) acGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGAc > 7:300849/1‑149 (MQ=255) acGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGAc < 4:228876/149‑1 (MQ=255) acGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGAc > 4:88240/1‑149 (MQ=255) cGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGAcc < 6:299705/149‑1 (MQ=255) ccgTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGACCCGCTCGAGt < 1:214086‑M2/146‑1 (MQ=255) gTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTAcc > 3:219426‑M2/2‑86 (MQ=255) gTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTAcc < 4:219426‑M2/85‑1 (MQ=255) | AGGGCTACGGCAAGCAGGGTGGAATGCTGGGCCTCGTCATCGATGCCGCTGCCACCGTCATGCTGAGCCAGGTTGATGCGGGCGCCAAAACGGTTGTCTTCACCAAAACGCTGGCCCAGGTCGAGGTGGCCACCCACGTTGTCGCCCGTGGCGTAGTCGAGGGTGACATGCCGCGTGGCGCTATCTTCGGCACGCTTGGGCACCAGGTTGATCGCCCCTCCGATGCCGCTACCCTGTGGCGCGACCCCATTGAGAAAAGCACTGGAACCCTTGAATACTTCGACCCGCTCGAGT > NC_002947/3471513‑3471806 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |