New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4096282 = | 50 (0.970) | 5 (0.100) | 5/250 | NT | 10.6% | coding (614/651 nt) | PP_5607 | membrane protein |
? | NC_002947 | 4096343 = | 36 (0.730) | intergenic (+24/‑51) | PP_5607/PP_5608 | membrane protein/hypothetical protein |
TCCCTGGCTTGCGTGGTGTTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGAGTACTTCTAGCAACGATGGCCGG > NC_002947/4096134‑4096422 | aggtgtggcgatcgttctggctcagtgccctggcctgggcgccgaaagcgagggtggccagcaggcagccggccatcgttgctagaagtactcgcatgttgctgtcctaagcatctgaaagaaaacggagtttgccttcgctttcggca > 6:74775‑M1/149‑149 (MQ=255) cccTGGCTTGCGTGGTGTTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAGGTCTGCGGaa < 4:159215/148‑1 (MQ=255) ccTGGCTTGCGTGGTGTTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGc > 1:75022/1‑149 (MQ=255) tGGCTTGCGTGGTGTTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGcc > 7:256503/1‑148 (MQ=255) cTTGCGTGGTGTTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAg < 4:209925/149‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTccc < 2:75022/149‑1 (MQ=255) tcagtgccctggcctgggcgccgaaagcgagggtggccagcaggcagccggccatcgttgctagaagtactcgcatgttgctgtcctaagcatctgaaagaaaacggagtttgccttcgctttccgcAGCCGTGGGCCAGTCCCCTgcg < 2:221225‑M1/22‑1 (MQ=255) gCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTgc < 8:256503/148‑1 (MQ=255) gATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAATTCTGCGGAAGCCGACGGCCAGTCCCCTgcgcc > 4:25138/1‑148 (MQ=255) tcatcaCCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATg > 4:212257/1‑149 (MQ=255) catcaCCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATgg > 2:191264/1‑149 (MQ=255) atcaCCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGc > 6:262098/1‑149 (MQ=255) atcaCCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGc < 1:191264/149‑1 (MQ=255) atcaCCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGGTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTGTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGATGGCCAGTCCCCGGCGCGTGGc > 4:243186/1‑149 (MQ=255) caCCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCtg > 5:90828/1‑149 (MQ=255) cGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGcc > 8:102639/1‑120 (MQ=255) cGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGcc < 7:102639/120‑1 (MQ=255) tCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGccc > 5:105266/1‑149 (MQ=255) gTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGAc > 3:276939/1‑149 (MQ=255) gTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGAc < 6:105266/149‑1 (MQ=255) ttGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACg < 3:36693/149‑1 (MQ=255) gATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACgg < 3:243186/148‑1 (MQ=255) aTGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGc > 4:287558/1‑148 (MQ=255) ggCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAAt > 2:10494/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGc < 4:276939/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTg < 2:184911/149‑1 (MQ=255) gcggcgCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTgg < 3:212257/149‑1 (MQ=255) gccagcaggcagccggccatcgttgctagaagtactcgcatgttgctgtcctaagcatctgaaagaaaacggagtttgccttcgctttccgcAGCCGTGGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCAc > 1:221225‑M1/93‑149 (MQ=255) cagcaggcagccggccatcgttgctagaagtactcgcatgttgctgtcctaagcatctgaaagaaaacggagtttgccttcgctttccgcAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACgg < 4:131943‑M1/59‑1 (MQ=255) gcaggcagccggccatcgttgctagaagtactcgcatgttgctgtcctaagcatctgaaagaaaacggagtttgccttcgctttccgcAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCt > 3:50350‑M1/89‑149 (MQ=255) gTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTg > 5:227932/1‑149 (MQ=255) caggcagccggccatcgttgctagaagtactcgcatgttgctgtcctaagcatctgaaagaaaacggagtttgccttcgctttccgcAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTg > 3:131943‑M1/88‑149 (MQ=255) cAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGa > 3:14745/1‑148 (MQ=255) aGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGaaa < 2:39474/149‑1 (MQ=255) aGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGaaa < 5:262098/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCGGCCTGTATCTCCGCCTTAACTATGCTGTATCCGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACACGTCTGCGGAACCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGACCAGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCGGCGGaaa > 8:118486/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGcc < 8:255168/130‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGcc > 7:255168/1‑130 (MQ=255) cGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCAAAg < 8:96581/148‑1 (MQ=255) cGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGtttt < 1:10494/149‑1 (MQ=255) gCCTTACATATTGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTTCCAGCATGGCCTGGACATGTCTGCGGAAGCCGAAGGCGAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCGCTGACGGCAAATTGCTGGCCCAGGGCTGCGGAAAGCGATGGCAAACTCCGTtttc < 7:118486/149‑1 (MQ=255) gCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCt < 8:236338/110‑1 (MQ=255) gCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCt > 7:236338/1‑110 (MQ=255) ccTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTtttct < 3:25138/149‑1 (MQ=255) tATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTtttc > 7:111960/1‑141 (MQ=255) tATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTtttc < 8:111960/141‑1 (MQ=255) tATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGAt > 8:298001/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACa < 6:90828/149‑1 (MQ=255) gTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGc < 3:287558/149‑1 (MQ=255) ctctGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCTCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGAt < 3:79785/134‑1 (MQ=255) ctctGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGAt > 4:79785/1‑134 (MQ=255) ctGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACAt > 8:77714/1‑149 (MQ=255) gTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGa < 4:14745/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTcc > 1:120717/1‑110 (MQ=255) ccAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTcc < 2:120717/110‑1 (MQ=255) ctggACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCtt > 4:246718/1‑118 (MQ=255) ctggACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCtt < 3:246718/118‑1 (MQ=255) gACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGAGTACTTCTAGCAACGAt > 3:105827/1‑149 (MQ=255) tCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGAGTACTTCTAGCAACGATGGCCgg > 1:69970/1‑149 (MQ=255) tCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGAGTACTTCTAGCAACGATGGCCgg > 2:205343/1‑149 (MQ=255) tCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACAGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGAGTACTTCTAGCAACGATGGCCgg > 3:194618/1‑149 (MQ=255) | TCCCTGGCTTGCGTGGTGTTGGCGATCATCACCGTCGCGTTGATGGGCCAAGCGGCGCAGAGTGGCCAGCTGTTCGGCCTGTATCAACGCCTTAACTATGGTGTTTCGGTGCTCTGGGTTGCCAGCCTGGCCTGGACAAGTCTGCGGAAGCCGAAGGCCAGTCCCCTGCGCATGGCTGTGCCCTGACGGCAAATTGCTGGCCCACGGCTGCGGAAAGCGAAGGCAAACTCCGTTTTCTTTCAGATGCTTAGGACAGCAACATGCGAGTACTTCTAGCAACGATGGCCGG > NC_002947/4096134‑4096422 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |