New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4502497 = | 53 (1.030) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.9% | coding (126/1380 nt) | xanP | xanthine permease |
? | NC_002947 | 4502554 = | 45 (0.910) | coding (183/1380 nt) | xanP | xanthine permease |
CTTCCGGGGCGGCTTTCAGCAATGAGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTCCAGTGCAAACGCTTCGGCCCATTTGGCGCGGGG > NC_002947/4502351‑4502644 | cgccggcaatcagcgggccgacgaagttgaagctggtgccctgaacgatcagcagccccgcgccaaatgggccgaagcgtttgcactggacgaaggtggcgatacccgagatcaccagcgacatcgaaacgatcaaattggtatcaCGt < 6:224766‑M1/3‑1 (MQ=255) ggggCGGCTTTCAGCAATGAGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGa > 2:222808/1‑149 (MQ=255) cggcTTTCAGCAATGAGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGt > 4:33256/1‑149 (MQ=255) gcTTTCAGCAATGAGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCa < 5:21583/149‑1 (MQ=255) aaTGAGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGcc > 7:62870/1‑149 (MQ=255) aGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCctgct < 1:222808/149‑1 (MQ=255) gCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCctgct > 2:243893/1‑148 (MQ=255) acacGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCa > 2:205332/1‑131 (MQ=255) acacGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCa < 1:205332/131‑1 (MQ=255) acacGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGAt < 2:222856/147‑1 (MQ=255) acacGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCt > 1:245540/1‑149 (MQ=255) acacGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCt > 3:92612/1‑149 (MQ=255) cGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGcc < 6:124297/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTg < 1:45772/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGcc < 4:50782/110‑1 (MQ=255) ccAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGcc > 3:50782/1‑110 (MQ=255) cAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGgt < 4:281745/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTAGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGgt < 1:146652/149‑1 (MQ=255) aGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGgtg > 6:131178/1‑149 (MQ=255) gcAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTAt < 2:317090/148‑1 (MQ=255) gcagccccgcgccaaatgggccgaagcgtttgcactggacgaaggtggcgatacccgagatcaccagcgacatcgaaacgatcaaattggtatcaCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGc > 8:263082‑M1/96‑134 (MQ=255) gcagccccgcgccaaatgggccgaagcgtttgcactggacgaaggtggcgatacccgagatcaccagcgacatcgaaacgatcaaattggtatcaCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGc < 7:263082‑M1/39‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCctgc > 6:236267/1‑118 (MQ=255) ccTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGa < 3:75245/149‑1 (MQ=255) tGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATa > 3:190399/1‑149 (MQ=255) tGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATa > 6:28888/1‑149 (MQ=255) gcgccaaatgggccgaagcgtttgcactggacgaaggtggcgatacccgagatcaccagcgacatcgaaacgatcaaattggtatcaCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATa > 3:286237‑M1/88‑149 (MQ=255) ccAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATAc < 5:131178/148‑1 (MQ=255) aTGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGGGAGACCaag > 8:117049/1‑148 (MQ=255) aTGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCAGATCGTCACGCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAAt < 4:190399/149‑1 (MQ=255) tGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTg > 3:300552/1‑146 (MQ=255) tGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTg < 4:300552/146‑1 (MQ=255) tGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATc > 5:137634/1‑149 (MQ=255) tGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGtt < 3:33256/149‑1 (MQ=255) tGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGa > 5:224766/1‑149 (MQ=255) ggTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGa < 4:92612/148‑1 (MQ=255) tCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGt < 6:137634/149‑1 (MQ=255) aaGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGAt > 5:333374/1‑149 (MQ=255) aaGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGATGGTGAt > 6:242886/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGGTTCGATGTCGCTGGTGAtct > 6:191132/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAAtt > 2:152691/1‑119 (MQ=255) aCGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAAtt < 1:152691/119‑1 (MQ=255) aCGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCgg < 6:333374/149‑1 (MQ=255) ttGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGc < 3:90977/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCa < 8:62870/148‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCAc < 5:28888/149‑1 (MQ=255) tCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCAcc > 7:252150/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGACCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCg > 2:127981/1‑136 (MQ=255) cGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGACCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCg < 1:127981/136‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTc < 8:252150/149‑1 (MQ=255) tgctgGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTc > 8:159797/1‑149 (MQ=255) ctgGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTc < 8:215566/147‑1 (MQ=255) gCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCt < 4:229734/139‑1 (MQ=255) gCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCt > 3:229734/1‑139 (MQ=255) gCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTCCAGt < 2:245540/148‑1 (MQ=255) caCCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTCCAGTGCAAACGCTTCgg > 7:145509/1‑149 (MQ=255) gATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTCCAGTGCAAACGCTTCGGCCCATTTGgcg > 5:39497/1‑149 (MQ=255) tcGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTCCAGTGCAAACGCTTCGGCCCATTTGGCGCgggg > 3:92998/1‑149 (MQ=255) | CTTCCGGGGCGGCTTTCAGCAATGAGCTCACACGAACACAGCCCAGGCGCAGGGGCGCCTGCCAATGAACTGGTGCTTGGTCTGGAGGACAAGCCACGGCTGTTGATCGGCCTGCTGGCAGCCCTGCAGCACCTGCTGGCGATCATCGTGCCGATCGTCACCCCTGGCCTGCTGATCTGCCAGGCGTTGGGTGTATCTGCACGTGATACCAATTTGATCGTTTCGATGTCGCTGGTGATCTCGGGTATCGCCACCTTCGTCCAGTGCAAACGCTTCGGCCCATTTGGCGCGGGG > NC_002947/4502351‑4502644 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |