New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5958930 = | 55 (1.060) | 5 (0.100) | 5/242 | NT | 10.6% | coding (2334/2856 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
? | NC_002947 | 5958980 = | 33 (0.690) | coding (2384/2856 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
ACAGCCCGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCG > NC_002947/5958782‑5959071 | aCAGCCCGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATtg > 1:169945/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCTGTACCTGGATGACAATGCCCTGCAGGATCACGACGTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTATTGCCTGCAGGTC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑GGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATtg < 1:85994/148‑1 (MQ=255) aGCCCGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATtgtg < 3:251405/149‑1 (MQ=255) aGCCCGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATtgtg < 7:34764/149‑1 (MQ=255) gCCCGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTgg < 4:75694/149‑1 (MQ=255) cccGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGc < 1:167232/149‑1 (MQ=255) cccGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGc < 3:214467/149‑1 (MQ=255) gggccaggcgcggctcgatgctgcgtgccttgcctgggccggtgggcaacagctgcgcgaagtggatatccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaggcgttgcaGt > 7:2114‑M1/148‑149 (MQ=255) gccaggcgcggctcgatgctgcgtgccttgcctgggccggtgggcaacagctgcgcgaagtggatatccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTgg > 3:61822‑M1/146‑149 (MQ=255) caggcgcggctcgatgctgcgtgccttgcctgggccggtgggcaacagctgcgcgaagtggatatccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGc < 6:290563‑M1/5‑1 (MQ=255) tACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCaacaac < 8:166921/148‑1 (MQ=255) tACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACg > 6:78089/1‑149 (MQ=255) gcggctcgatgctgcgtgccttgcctgggccggtgggcaacagctgcgcgaagtggatatccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCaacaac < 8:288998‑M1/11‑1 (MQ=255) cTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCt > 7:63853/1‑149 (MQ=255) gATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGcc > 6:67670/1‑149 (MQ=255) cAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTg > 4:147593/1‑148 (MQ=255) aaTGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCa > 5:4198/1‑149 (MQ=255) tGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATg < 4:129039/149‑1 (MQ=255) cccTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGa < 5:78089/148‑1 (MQ=255) cccTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGAc > 3:106097/1‑149 (MQ=255) tGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGaa > 3:233001/1‑149 (MQ=255) tGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGACAACAACGCCTGCCGCTGCATGACg > 1:302474/1‑147 (MQ=255) tGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCACGACGGGATGGGCCGACAGCGTTTTTGTGGTGGATTAAAAAAACGAATTGTGGCAACAACGCCAGCCGCTGCaag > 1:103681/1‑146 (MQ=255) gCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAg > 2:67711/1‑149 (MQ=255) aGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAgcg < 4:106097/149‑1 (MQ=255) gATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCCGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCa > 4:314601/1‑149 (MQ=255) aTCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGTATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCAt < 1:77049/149‑1 (MQ=255) tCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATc > 7:229207/1‑149 (MQ=255) aCGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATctg > 6:53488/1‑149 (MQ=255) aCGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATct < 3:101575/148‑1 (MQ=255) cgcCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGc < 1:67711/148‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGa > 6:165765/1‑125 (MQ=255) cTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGa < 5:165765/125‑1 (MQ=255) gTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCa < 5:67670/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGACAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTg < 2:302474/147‑1 (MQ=255) cgcgaagtggatatccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAAc > 7:288998‑M1/93‑148 (MQ=255) cAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCt > 5:35801/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTg < 2:169945/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCCGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTgc < 3:314601/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCaacaac > 6:234598/1‑87 (MQ=255) cAGCCTGTATTCAGGTGTTATACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCaacaac < 5:234598/87‑1 (MQ=255) atccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACt < 6:235793‑M1/51‑1 (MQ=255) atccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACt > 5:235793‑M1/81‑131 (MQ=255) cgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCAc > 5:301126‑M1/70‑119 (MQ=255) cgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCAc < 6:301126‑M1/50‑1 (MQ=255) aGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGcgccg < 8:63853/148‑1 (MQ=255) ggTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGcgccgc > 5:78694/1‑148 (MQ=255) tgtTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGAt < 3:147593/149‑1 (MQ=255) cTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGAGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACTAAGCGCATCTGCTGTTGCCa < 3:131638/106‑1 (MQ=255) cTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGAGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACAAAGCGCATCTGCTGTTGCCa > 4:131638/1‑106 (MQ=255) tACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTg > 8:29326/1‑72 (MQ=255) tACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTg < 7:29326/72‑1 (MQ=255) tACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACg > 4:242204/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCt < 8:50056/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGcc < 8:229207/149‑1 (MQ=255) ggc‑ggcTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGa < 2:103681/149‑1 (MQ=255) gggCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTg > 6:15102/1‑149 (MQ=255) ggCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGc > 5:280707/1‑149 (MQ=255) gA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGcc > 4:62017/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGc < 7:155854/149‑1 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCATGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCt > 1:227249/1‑149 (MQ=255) tgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTg < 4:233001/149‑1 (MQ=255) cTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCATGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGa < 2:227249/149‑1 (MQ=255) cTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGa < 3:62017/149‑1 (MQ=255) cTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGa > 3:100974/1‑149 (MQ=255) aTGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATc < 6:321751/149‑1 (MQ=255) gAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTc < 3:48799/137‑1 (MQ=255) gAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTc > 4:48799/1‑137 (MQ=255) aTACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACt > 5:66792/1‑149 (MQ=255) tACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACtt > 8:124831/1‑149 (MQ=255) cGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgcg > 5:290563/1‑148 (MQ=255) gCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgcg > 5:303439/1‑147 (MQ=255) | ACAGCCCGCTGTACCTGGATGCCAATGCCCTGCAGGATCACGACCTGCGCCTGGTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGC‑GGCTGGGCCGA‑‑‑CGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCG > NC_002947/5958782‑5959071 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |