New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5958930 = | 55 (1.060) | 5 (0.100) | 5/242 | NT | 10.6% | coding (2334/2856 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
? | NC_002947 | 5958980 = | 33 (0.690) | coding (2384/2856 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
GTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACGCAGCATCGAGCCGCGCCTGGCCC > NC_002947/5958835‑5959126 | gTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCa < 5:67670/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGACAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTg < 2:302474/147‑1 (MQ=255) cgcgaagtggatatccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAAc > 7:288998‑M1/93‑148 (MQ=255) cAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCt > 5:35801/1‑149 (MQ=255) aaGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTg < 2:169945/149‑1 (MQ=255) aGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCCGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTgc < 3:314601/149‑1 (MQ=255) atccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACt < 6:235793‑M1/51‑1 (MQ=255) atccagcgaggcgggccgcaggctatcgaggggcaggcgtgcatcgcggcgcatcaccaccgagcgcagaaagcgttgcaGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACt > 5:235793‑M1/81‑131 (MQ=255) aGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGcgccg < 8:63853/148‑1 (MQ=255) ggTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGcgccgc > 5:78694/1‑148 (MQ=255) tgtTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGAt < 3:147593/149‑1 (MQ=255) tACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACg > 4:242204/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCt < 8:50056/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGcc < 8:229207/149‑1 (MQ=255) ggcggcTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGa < 2:103681/149‑1 (MQ=255) gggCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTg > 6:15102/1‑149 (MQ=255) ggCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGc > 5:280707/1‑149 (MQ=255) gACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGcc > 4:62017/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGc < 7:155854/149‑1 (MQ=255) gtgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCATGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCt > 1:227249/1‑149 (MQ=255) tgCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTg < 4:233001/149‑1 (MQ=255) cTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCATGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGa < 2:227249/149‑1 (MQ=255) cTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGa > 3:100974/1‑149 (MQ=255) cTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGa < 3:62017/149‑1 (MQ=255) aTGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATc < 6:321751/149‑1 (MQ=255) gAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTc > 4:48799/1‑137 (MQ=255) gAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTc < 3:48799/137‑1 (MQ=255) aTACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACt > 5:66792/1‑149 (MQ=255) tACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACtt > 8:124831/1‑149 (MQ=255) gttgcagtggcaacagcagatgcgcttcgtcatgcagcggcaggcgttgttgccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgcg > 7:288998‑M2/57‑148 (MQ=255) cGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgcg > 5:290563/1‑148 (MQ=255) gCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTcgcg > 5:303439/1‑147 (MQ=255) agtggcaacagcagatgcgcttcgtcatgcagcggcaggcgttgttgccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGat < 6:235793‑M2/80‑1 (MQ=255) agtggcaacagcagatgcgcttcgtcatgcagcggcaggcgttgttgccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGat > 5:235793‑M2/52‑131 (MQ=255) gtggcaacagcagatgcgcttcgtcatgcagcggcaggcgttgttgccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCg < 6:301126‑M2/69‑1 (MQ=255) gtggcaacagcagatgcgcttcgtcatgcagcggcaggcgttgttgccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCg > 5:301126‑M2/51‑119 (MQ=255) GGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTg < 7:288181‑M1/149‑1 (MQ=255) GCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTg > 5:53488‑M1/1‑148 (MQ=255) AACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTc < 8:60650‑M1/134‑1 (MQ=255) AACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTc > 7:60650‑M1/1‑134 (MQ=255) AACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGcc < 7:77657‑M1/148‑1 (MQ=255) ccGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCagg < 8:288181/149‑1 (MQ=255) cTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCa < 3:113250/144‑1 (MQ=255) cTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCa > 4:113250/1‑144 (MQ=255) cATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCaggcaaggc < 6:35801/149‑1 (MQ=255) aTGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCaggcaaggca > 6:223657/1‑149 (MQ=255) aCGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACgc < 5:15102/149‑1 (MQ=255) aCGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACgc < 6:66792/149‑1 (MQ=255) gttgttgccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACGCAGCATCGAGCcgc < 8:288998‑M2/138‑1 (MQ=255) gccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACGCAGCATCGAGCCGCGCCTg < 6:290563‑M2/143‑1 (MQ=255) ccacTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACGCAGCATCGAGCCGCGCCTGGc > 3:61822‑M2/5‑149 (MQ=255) acTGCAACGCCTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACGCAGCATCGAGCCGCGCCTGGccc > 7:2114‑M2/3‑149 (MQ=255) | GTGCTGGAGCAAGGCCGGCCAGCCTGTATTCAGGTGTTCTACCGCCTGCAGGGCGGCTGGGCCGACGTGTATGTGCTGGATGAATACAACGCATTGTGGCAACAACGCCTGCCGCTGCATGACGAAGCGCATCTGCTGTTGCCACTGCAACGCTTTCTGCGCTCGGTGGTGATGCGCCGCGATGCACGCCTGCCCCTCGATAGCCTGCGGCCCGCCTCGCTGGATATCCACTTCGCGCAGCTGTTGCCCACCGGCCCAGGCAAGGCACGCAGCATCGAGCCGCGCCTGGCCC > NC_002947/5958835‑5959126 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |