New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 673259 = | 43 (0.830) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 7.6% | coding (261/777 nt) | PP_0574 | LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 673325 = | 56 (1.140) | coding (195/777 nt) | PP_0574 | LuxR family transcriptional regulator |
TCGGCTTCTGGTAGTAATCGGCAAAACCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAGCTGTTCGACAATGACCGGT > NC_002947/673180‑673472 | aaccgacgaagccatcgagcactatgtggcagacccgaccatcggcttgctcatctgtgacctgcacatgcccgatcggGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATcc > 3:284297‑M1/80‑146 (MQ=255) gtagtaATCGGCAAAACCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCATCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCAt < 7:200947/147‑1 (MQ=255) aaaaCCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTca > 2:224877/1‑145 (MQ=255) aaaCCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGAt < 5:140926/149‑1 (MQ=255) aaaCCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGAt < 2:98532/149‑1 (MQ=255) aCCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTCAGATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATg < 1:224877/149‑1 (MQ=255) cTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAg > 5:135854/1‑148 (MQ=255) tCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTcac < 8:197268/139‑1 (MQ=255) tCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTcac > 7:197268/1‑139 (MQ=255) cgcgTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCGCGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCa < 6:215653/147‑1 (MQ=255) gcgTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGc < 7:195390/149‑1 (MQ=255) gCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGt > 6:215435/1‑149 (MQ=255) cccGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTc > 2:14823/1‑149 (MQ=255) gATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGt > 6:166465/1‑149 (MQ=255) tCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCt > 6:25940/1‑149 (MQ=255) aaGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGc < 5:215435/149‑1 (MQ=255) cTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCcaca > 2:85453/1‑148 (MQ=255) tttCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAg < 2:309740/148‑1 (MQ=255) tttCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGt > 2:172693/1‑149 (MQ=255) ctcGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCt > 6:275103/1‑149 (MQ=255) ctcGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCt > 6:270663/1‑149 (MQ=255) cGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTc > 2:150881/1‑148 (MQ=255) gCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGAt > 6:239597/1‑149 (MQ=255) gCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGAt < 1:85453/149‑1 (MQ=255) tccTATCTACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCGGTTGATTTCGTTCAATGCGCGCAGCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTGACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCt < 4:304045/147‑1 (MQ=255) aaCATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGt > 4:220707/1‑149 (MQ=255) aCATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGtt < 5:303250/149‑1 (MQ=255) cATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGCCTGCCGTTGATATCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GAAGCCATCCCGATCGGGCATGTGAAGGTCACAGATGAGCAAGCAGAAGGTCGCGAATGCCACATAGTGCTCGAAGGCt > 3:304045/1‑139 (MQ=255) ggatggcatcgagctggtgcgcgccttgaaggaaatcaacggcagccagcgcacgttcgaagccatcCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGtt > 3:284297‑M2/68‑146 (MQ=255) GATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTga < 4:132376‑M1/147‑1 (MQ=255) gatggcatcgagctggtgcgcgccttgaaggaaatcaacggcagccagcgcacgttcgaagccatcCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTga > 6:248313‑M2/67‑147 (MQ=255) ATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCt < 2:26594‑M1/114‑1 (MQ=255) ATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGCTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCt > 1:26594‑M1/1‑114 (MQ=255) GGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAggg < 7:6471‑M1/149‑1 (MQ=255) ttCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCta > 7:150636/1‑148 (MQ=255) ttCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTg > 4:206590/1‑149 (MQ=255) cGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGt > 6:87329/1‑148 (MQ=255) aaCGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAAc > 6:154693/1‑149 (MQ=255) aCGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACg < 5:239597/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACg > 1:129133/1‑148 (MQ=255) gTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCa < 3:132376/149‑1 (MQ=255) gccttgaaggaaatcaacggcagccagcgcacgttcgaagccatcCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGc < 5:248313‑M2/104‑1 (MQ=255) ctgCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGcc < 2:274455/149‑1 (MQ=255) tgCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATa > 5:216264/1‑100 (MQ=255) tgCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATa < 6:216264/100‑1 (MQ=255) cGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTg < 2:129133/149‑1 (MQ=255) cGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTg < 5:270663/149‑1 (MQ=255) cGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTg < 5:275103/149‑1 (MQ=255) gTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTgg < 6:151867/149‑1 (MQ=255) gATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGttt > 4:37430/1‑149 (MQ=255) ttCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTc > 5:149237/1‑147 (MQ=255) tCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGa < 4:313067/148‑1 (MQ=255) tCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGa < 5:25940/148‑1 (MQ=255) tCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGa < 1:172693/148‑1 (MQ=255) tCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGa < 1:150881/148‑1 (MQ=255) atcaacggcagccagcgcacgttcgaagccatcCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGa < 4:284297‑M2/116‑1 (MQ=255) ccTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAg < 3:37430/148‑1 (MQ=255) cgcgcACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTc < 8:6471/149‑1 (MQ=255) cgcgcACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTc < 3:206590/149‑1 (MQ=255) cgcACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTATGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAg < 5:154693/149‑1 (MQ=255) gcACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAGc > 8:284715/1‑149 (MQ=255) cAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGt < 4:280103/105‑1 (MQ=255) cAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGt > 3:280103/1‑105 (MQ=255) gCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAGCTGTTc > 2:212747/1‑148 (MQ=255) gCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAGCTGTTc < 1:212747/148‑1 (MQ=255) ccGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAGCTGTTCGACAATGACCGGt < 1:14823/148‑1 (MQ=255) | TCGGCTTCTGGTAGTAATCGGCAAAACCTTCGCGTATCGCCCGGATCAAGTCCTGTTTCTCGGCACGCCCTGTCAACATGATGGCTTCGAACGTGCGCTGGCTGCCGTTGATTTCCTTCAAGGCGCGCACCAGCTC‑GATGCCATCCCGATCGGGCATGTGCAGGTCACAGATGAGCAAGCCGATGGTCGGGTCTGCCACATAGTGCTCGATGGCTTCGTCGGTTGAGAGGGCTGTAACGCAGGCATAGCCCTTGGTTTCGAGGAATTCACTCAGCTGTTCGACAATGACCGGT > NC_002947/673180‑673472 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |