New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1407830 = | 47 (0.910) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 9.9% | coding (283/1509 nt) | PP_1230 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1407882 = | 28 (0.570) | coding (335/1509 nt) | PP_1230 | hypothetical protein |
TCTTCAGCAGCACTGCCCAGTACCGGCTCAAGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGTCAGCCAGGTTC > NC_002947/1407747‑1408028 | tctTCAGCAGCACTGCCCAGTACCGGCTCAAGGCTCGCGACATCAGATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGcc > 1:69006/1‑149 (MQ=255) cacccgcagcggcgaaccatggcgcaacggcgtcatccttctgcagcgtgctgttgctgaccgccattaccggcatcagcttcaGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGc > 6:39819‑M1/85‑148 (MQ=255) ttCAGCAGCACTGCCCAGTACCGGCTCAAGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCg < 3:272725/147‑1 (MQ=255) cagcaCTGCCCAGTACCGGCTCAAGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGCCGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATgg > 3:226692/1‑149 (MQ=255) agcaCTGCCCAGTACCGGCTCAAGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGc > 7:67077/1‑149 (MQ=255) aaGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCt > 6:228788/1‑113 (MQ=255) aaGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCt < 5:228788/113‑1 (MQ=255) aaGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTg > 3:187183/1‑147 (MQ=255) cTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAg > 4:47439/1‑149 (MQ=255) gcgACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGAt < 2:6294/149‑1 (MQ=255) aTCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCa > 1:2586/1‑121 (MQ=255) aTCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCa < 2:2586/121‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTg > 1:302885/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGtt > 4:201123/1‑149 (MQ=255) aatttttGACGTGGGGGTGCCCGACAAGATCGAGCACGGCCGGTTTCGGTGTTCGTGGGTCAGGTCAGTGAAGCTTTTGCCGGAAATGGGGGTCAGAAAGGGAACGCTTCATATGTATGAGGCCTTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCg < 2:36209/145‑1 (MQ=255) aTTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGt > 1:19051/1‑149 (MQ=255) ttttGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGt > 8:42155/1‑148 (MQ=255) gcatcagcttcagtgacctgaccctcgaccacggaaacgggccgtgctcgatctggtcggtcacTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTg > 6:39819‑M2/65‑148 (MQ=255) gggCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGccc < 2:302885/149‑1 (MQ=255) gCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGcccc > 8:163554/1‑148 (MQ=255) gtgacctgaccctcgaccacggaaacgggccgtgctcgatctggtcggtcacTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGc < 8:123444‑M2/91‑1 (MQ=255) gtgacctgaccctcgaccacggaaacgggccgtgctcgatctggtcggtcacTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGCATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGc > 7:123444‑M2/53‑143 (MQ=255) GTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGAt < 6:240515‑M1/149‑1 (MQ=255) GACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCa > 4:187183‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCa > 3:47439‑M1/1‑148 (MQ=255) gaccAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAgcgc > 4:22771/1‑149 (MQ=255) aGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAg < 8:67077/149‑1 (MQ=255) gATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATCGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGa > 4:153591/1‑149 (MQ=255) ctcgaccacggaaacgggccgtgctcgatctggtcggtcacTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGa < 5:39819‑M2/108‑1 (MQ=255) cGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTgg < 7:42155/149‑1 (MQ=255) cGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTgg < 2:69006/149‑1 (MQ=255) cGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTgg < 3:201123/149‑1 (MQ=255) cccGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTgg > 7:162221/1‑146 (MQ=255) cccGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTgg < 8:162221/146‑1 (MQ=255) ccGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTAcggcg < 5:240515/148‑1 (MQ=255) gAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAAtgtg < 3:22771/148‑1 (MQ=255) ggtcaggtcaCTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGt > 8:18128/1‑147 (MQ=255) gtcacTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGTCAGCCAgg > 7:132260‑M2/6‑149 (MQ=255) acTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGTCAGCCAGGTTc > 8:205321‑M2/3‑149 (MQ=255) cTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGTCAGCCAGGtt > 4:289134‑M2/2‑147 (MQ=255) cTGAAGCTGATGCAGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGTCAGCCAGGtt > 8:141250‑M2/2‑147 (MQ=255) | TCTTCAGCAGCACTGCCCAGTACCGGCTCAAGGCTCGCGACATCA‑ATGTGGGGCAGGGCGAGGTGATCAATTTTGACGTGGGCGTGACCGACCAGATCGAGCACGGCCCGTTTCCGTGGTCGAGGGTCAGGTCACTGAAGCTGATGCCGGTAATGGCGGTCAGCAACAGCACGCTGCAGAAGGATGACGCCGTTGCGCCATGGTTCGCCGCTGCGGGTGAAAAGGCCCCGATCAGCGCGCAGACCAGCCTGGGTTACGGCGGCAATGTGGTCAGCCAGGTTC > NC_002947/1407747‑1408028 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |