New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3457526 | 27 (0.520) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 8.1% | coding (1165/1392 nt) | bhbP | D‑beta‑hydroxybutyrate permease |
? | NC_002947 | = 3457565 | 42 (0.850) | coding (1126/1392 nt) | bhbP | D‑beta‑hydroxybutyrate permease |
CCGCGCCATTGTGCGGCAGGGTGTCCATGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAGCCGTATTCCGA > NC_002947/3457430‑3457712 | ccGCGCCATTGTGCGGCAGGGTGTCCATGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCg < 8:203964/149‑1 (MQ=255) tgCGGCAGGGTGTCCATGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGAt < 6:69105/149‑1 (MQ=255) gCGGCAGGGTGTCCATGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATg > 3:20919/1‑149 (MQ=255) cATGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAgg > 3:121064/1‑149 (MQ=255) aagCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGccc < 2:130178/115‑1 (MQ=255) aTGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGccc > 1:130178/1‑117 (MQ=255) gCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATg < 5:140671‑M2/99‑2 (MQ=255) gCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATg > 6:140671‑M2/1‑98 (MQ=255) aTGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTc > 5:260064/1‑149 (MQ=255) ggcTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCa < 4:235062/149‑1 (MQ=255) ggcTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCa < 4:20919/149‑1 (MQ=255) aCCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCAcc > 2:322930/1‑147 (MQ=255) cccGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGTTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAg < 1:272427/149‑1 (MQ=255) cccGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCaa < 7:176065/148‑1 (MQ=255) gCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGGTGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTggg < 2:135612/148‑1 (MQ=255) gCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGc > 4:98526/1‑118 (MQ=255) gCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGc < 3:98526/118‑1 (MQ=255) ggATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAgg < 4:307870/149‑1 (MQ=255) gATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAggg < 3:238904/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATc > 1:312101/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCg > 3:159947/1‑149 (MQ=255) gCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACg > 6:289932/1‑99 (MQ=255) gCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACg < 5:289932/99‑1 (MQ=255) gCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGc > 5:32996/1‑149 (MQ=255) cgcgTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCa < 4:121064/149‑1 (MQ=255) ggcggcggcGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATgccgccgcccacgcggccgatatcccgctggaagtgctacaccgggtagccgccatggccagcggtggcatggacaccctgccgcacaatggcgcggtgat < 5:141987‑M2/149‑102 (MQ=255) gcggcggcgATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATgccgccgcccacgcggccgatatcccgctggaagtgctacaccgggtagccgccatggccagcggtggcatggacaccctgccgcacaatggcgcggtgat < 2:43321‑M2/148‑102 (MQ=255) ggcggcgATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGaa < 4:159947/149‑1 (MQ=255) ggcgATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATgccgccgcccacgcggccgatatcccgctggaagtgctacaccgggtagccgccatggccagcggtggcatggacaccctgccgcacaatggcgcggtgatcacctt > 1:43321‑M2/1‑42 (MQ=255) gcgATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAAcc > 6:248611/1‑149 (MQ=255) gATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCg < 5:175557/149‑1 (MQ=255) gATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCg < 5:248611/149‑1 (MQ=255) gATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCg > 2:327568/1‑149 (MQ=255) gATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCg > 6:175557/1‑149 (MQ=255) tCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGc < 2:312101/149‑1 (MQ=255) ccATGGCTGCCATGGCGATGGTCATGCCGCCCGTATCGGAGCCGGTGATGCCGTCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGTGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCg < 4:2347/116‑1 (MQ=255) ccATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTCGGGATGCTGCGAAGGGCATCg > 3:2347/1‑116 (MQ=255) ccATGGCTGCCAAGGCGATGATCATGCAGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGAAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCAAAAGAAAAACCGTCAGCGAGGCGAt > 7:69531/1‑148 (MQ=255) gCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATgg < 7:277662/70‑1 (MQ=255) gCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATgg > 8:277662/1‑70 (MQ=255) gCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACcgc < 4:311689/149‑1 (MQ=255) cAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCa > 1:257139/1‑148 (MQ=255) aaGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGcc < 6:256359/108‑1 (MQ=255) aaGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGcc > 5:256359/1‑108 (MQ=255) gCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAGcc < 6:32996/149‑1 (MQ=255) gCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAGcc > 1:285988/1‑149 (MQ=255) gATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCTGcc < 8:187664/103‑1 (MQ=255) gATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGcc > 7:187664/1‑103 (MQ=255) tGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAGCCGTAt < 1:322930/149‑1 (MQ=255) tCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAg > 6:167194/1‑140 (MQ=255) tCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAg < 5:167194/140‑1 (MQ=255) tCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAGCCGTATTcc > 6:283932/1‑149 (MQ=255) aTgccgccgcccacgcggccgatatcccgctggaagtgctacaccgggtagccgccatggccagcggtggcatggacaccctgccgcacaatcgcgcggtgatcaccttgctggcggtgaccggcctcacccaccgcgaggcctacaag > 6:141987‑M2/1‑2 (MQ=255) | CCGCGCCATTGTGCGGCAGGGTGTCCATGCCACCGCTGGCCATGGCGGCTACCCGGTGTAGCACTTCCAGCGGGATATCGGCCGCGTGGGCGGCGGCGATGAACGTGTCGCCCATGGCTGCCAAGGCGATGCTCATGCCGCCCGAAGCGGAGCCGGTGATGCCGGCCAGCAAGGTCACGGTGATGGCTTCGTTCACCAAGGGGTTGGGGATGCTGCGCAGGGCATCGGCCAGCACCAGAAAACCCGGCAGCGAGGCGATTACCGCGCCAAAGCCGTATTCCGA > NC_002947/3457430‑3457712 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |