New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3677188 = | 48 (0.930) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 5.9% | coding (191/1569 nt) | PP_3242 | GGDEF domain‑containing protein |
? | NC_002947 | 3677237 = | 50 (1.020) | coding (240/1569 nt) | PP_3242 | GGDEF domain‑containing protein |
TCATGCTGGTGGTGATGCTGGCATTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTACGGCCCGGACGGCAGC > NC_002947/3677089‑3677384 | cgtttttgctgggccagcaaggcatgcaggcggggccggtcgatgtgatcgaaaccatcgccttccaggcgctcggccaaggcaccggtaatggcgtcgACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTc > 5:237109‑M1/100‑149 (MQ=255) ttttgctgggccagcaaggcatgcaggcggggccggtcgatgtgatcgaaaccatcgccttccaggcgctcggccaaggcaccggtaatggcgtcgACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGAc < 3:203780‑M1/53‑1 (MQ=255) tttgctgggccagcaaggcatgcaggcggggccggtcgatgtgatcgaaaccatcgccttccaggcgctcggccaaggcaccggtaatggcgtcgACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGAc > 4:203780‑M1/96‑148 (MQ=255) gtgATGCTGGCATTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTa < 7:169981/148‑1 (MQ=255) tgATGCTGGCATTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTAcc > 5:238284/1‑149 (MQ=255) tgATGCTGGCATTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTAcc > 5:199325/1‑149 (MQ=255) gCTGGCATTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTg > 1:282092/1‑149 (MQ=255) aTTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTgg > 5:221656/1‑149 (MQ=255) tttGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGc < 5:309802/149‑1 (MQ=255) gcgcATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATg < 8:157096/149‑1 (MQ=255) gcgcATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATg < 6:71337/149‑1 (MQ=255) aTCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCt > 4:127979/1‑134 (MQ=255) aTCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCt < 3:127979/134‑1 (MQ=255) tGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCAtt > 4:115312/1‑108 (MQ=255) tGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCAtt < 3:115312/108‑1 (MQ=255) gcgcGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGAt < 2:282092/148‑1 (MQ=255) gcgACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATc < 3:166065/147‑1 (MQ=255) gcgACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATc > 4:166065/1‑147 (MQ=255) tACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGa > 3:194051/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGAcc > 7:269412/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGAc < 6:9181/148‑1 (MQ=255) cGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCg < 6:238284/149‑1 (MQ=255) ccTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCATCCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGc > 1:27408/1‑149 (MQ=255) cTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTAc > 4:192653/1‑90 (MQ=255) cTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTAc < 3:192653/90‑1 (MQ=255) cTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGcc > 5:327312/1‑149 (MQ=255) tataACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCt > 5:117808/1‑149 (MQ=255) taACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTg > 1:53170/1‑148 (MQ=255) aaCAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATg > 3:218229/1‑118 (MQ=255) aaCAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATg < 4:218229/118‑1 (MQ=255) aCAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCAt < 4:194051/149‑1 (MQ=255) ccGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTg < 6:199325/149‑1 (MQ=255) cGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGc > 6:87646/1‑149 (MQ=255) agaACATGGGCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTg < 2:271948/149‑1 (MQ=255) aTGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑cc > 8:52124/1‑147 (MQ=255) gtcgacctggcggatagcgtcctcggcgtgctgcgccgtggcccgggccaggtCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCaaaa < 3:203780‑M2/96‑1 (MQ=255) gtcgacctggcggatagcgtcctcggcgtgctgcgccgtggcccgggccaggtCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCaaa > 4:203780‑M2/54‑148 (MQ=255) aGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCaaa > 8:82991/1‑148 (MQ=255) gacctggcggatagcgtcctcggcgtgctgcgccgtggcccgggccaggtCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACg > 5:237109‑M2/51‑149 (MQ=255) ACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACg < 2:75906‑M1/148‑1 (MQ=255) CTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGcat < 3:221522‑M1/149‑1 (MQ=255) CTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGca < 7:217082‑M1/148‑1 (MQ=255) cGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGTCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGcc < 2:27408/149‑1 (MQ=255) cGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGAcc < 5:134239/103‑1 (MQ=255) cGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGAcc > 6:134239/1‑103 (MQ=255) gggCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCg > 2:190164/1‑149 (MQ=255) cACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGt > 5:117701/1‑149 (MQ=255) cGGCGCAGCACGCCGAGGTCGCTATCCGCCAGGTCGACTCCATTACCGGGGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTg < 6:313580/149‑1 (MQ=255) ggCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGc < 3:271789/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCa > 2:229650/1‑149 (MQ=255) cagcaCGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACgg < 6:117701/149‑1 (MQ=255) cGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCttt < 5:87646/149‑1 (MQ=255) ccGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTc < 2:53170/149‑1 (MQ=255) cGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCg < 3:251711/149‑1 (MQ=255) aCGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGGCCCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTa < 1:229650/149‑1 (MQ=255) aCGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTAc < 6:51767/149‑1 (MQ=255) aCGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTAc < 7:52124/149‑1 (MQ=255) aCGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTAc < 6:221656/149‑1 (MQ=255) cTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTACGGc < 7:82991/149‑1 (MQ=255) tCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTACGGCCCGGACGGCAGc < 4:238354‑M2/148‑1 (MQ=255) | TCATGCTGGTGGTGATGCTGGCATTTGTACTGGTGGAAGGTTGGCGCATCTGGCGCGACTACCGCTTTGCCTATAACAATGCCGAGAACATGGTCAGCAACCTGGCCCGGGCCACGGCGCAGCACGCCGAGGACGCTATCCGCCAGGTCGACGCCATTACCGGTGCCTTGGCCGAGCGCCTGGAAGGCGATGGTTTCGATCACATCGACCGGCCCCGCCTGCATGCCTTGCTGG‑CCCAGCAAAAACGCATCATGCCGCAGTTGCACGGGCTTTTCGTTTACGGCCCGGACGGCAGC > NC_002947/3677089‑3677384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |