New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4247728 | 43 (0.830) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.8% | coding (189/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
? | NC_002947 | = 4247766 | 42 (0.870) | coding (151/1608 nt) | aruI | 2‑ketoarginine decarboxylase AruI |
ACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGT > NC_002947/4247621‑4247909 | aCCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcg < 8:218574‑M2/149‑4 (MQ=255) ccAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGTACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgg < 4:216227‑M2/149‑5 (MQ=255) aGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggt > 6:127286‑M2/1‑143 (MQ=255) gCATCGGCACCGTGTCGGCATAGGGTTGGCCGATGGGGGTGGCGAGGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCGACTGTCCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtc > 8:54219‑M2/1‑142 (MQ=255) tCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAAt < 6:297206/149‑1 (MQ=255) ggCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATa > 6:323151/1‑148 (MQ=255) cACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACAt > 1:121119/1‑149 (MQ=255) ccGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATgg < 6:24007/149‑1 (MQ=255) tCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCGATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAAt < 2:220041/149‑1 (MQ=255) ggCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGc > 2:238565/1‑149 (MQ=255) tAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCt > 8:133931/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGcc > 6:63194/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGcc > 2:17924/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGcc > 2:46009/1‑149 (MQ=255) gCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGTACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCa < 3:216227/149‑1 (MQ=255) gCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCa < 7:183860/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACgg < 7:218574/149‑1 (MQ=255) tGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTAc < 2:273088/149‑1 (MQ=255) tGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAgg < 8:215171/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt < 2:284401/148‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt < 1:28381/148‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt > 1:284401/1‑148 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGgt < 5:307313/146‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGgt > 6:307313/1‑146 (MQ=255) aCGCCTGGGCCGGTGAGGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGAGGAGCCGGCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGgtgt < 7:242622/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCAc < 5:323151/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACg > 7:100387/1‑149 (MQ=255) ccGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCggg < 7:133931/149‑1 (MQ=255) ccGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCggg < 1:46009/149‑1 (MQ=255) atgaCGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGc < 1:17924/148‑1 (MQ=255) aGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg < 5:63194/149‑1 (MQ=255) aGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg < 8:100387/149‑1 (MQ=255) gCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAGCGCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg < 1:238565/149‑1 (MQ=255) acacCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGtc > 4:311289/1‑149 (MQ=255) acacCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCACGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGtc > 3:64492/1‑149 (MQ=255) ccccGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg < 8:77721/142‑1 (MQ=255) ccccGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACg > 7:77721/1‑142 (MQ=255) ccGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACg > 4:97850/1‑149 (MQ=255) ccGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACg > 4:170071/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGcc < 3:170071/149‑1 (MQ=255) cACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtcagtggcaagccgggggtgtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccacgcctatgccgactaggtgccg < 5:314346‑M2/149‑101 (MQ=255) gACCCGCGCGTAGCCGTCAGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtcagtggcaagccgggggtgtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccaa > 2:39458‑M2/1‑45 (MQ=255) gACCCGCGCGTAGCCGTCAGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGgcgggtcagtggcaagccgggggtgtgcttcgtcatcaccggcccaggcgtgaccaacgtcgccacccccatcggccaa < 1:39458‑M2/124‑80 (MQ=255) ccGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCcaac > 7:249613/1‑148 (MQ=255) gTAGCCGTCGGCCATGGAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGaa > 6:158653/1‑114 (MQ=255) tAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCAc < 2:38027/149‑1 (MQ=255) ccATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGTGCCTgg > 8:103655/1‑149 (MQ=255) aTGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGcc > 6:276276/1‑149 (MQ=255) ggCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCa < 8:249613/149‑1 (MQ=255) cTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGt > 4:305839/1‑147 (MQ=255) tGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAg > 4:174670/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGCTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGt > 6:147775/1‑148 (MQ=255) | ACCAGCATCGGCACCGAGTCGGCATAGGCTTGGCCGATGGGGGTGGCGACGTTGGTCACGCCTGGGCCGGTGATGACGAAGCACACCCCCGGCTTGCCACTGACCCGCGCGTAGCCGTCGGCCATGAAGCCGGCGCCCTGCTCGTGGCGGGTCAATACATGGCGAATGCCGCTGCCCGGCAG‑GCCACGGTACAGCTCCAGGGTGTGCACGCCGGGGATGCCGAACACGGTCTCCACGCCGTAGTTGGCCAACAACCGCACCAGCGCCTGGCCGGCTGTCAGGGTAAGGT > NC_002947/4247621‑4247909 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |