New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4852078 | 42 (0.810) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 8.8% | coding (252/603 nt) | recR | recombination protein RecR |
? | NC_002947 | = 4852106 | 43 (0.870) | coding (224/603 nt) | recR | recombination protein RecR |
GAATACCGATTGCCTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAGGGCCAT > NC_002947/4851960‑4852248 | gAATACCGATTGCCTCAGGCCCCATGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGgg < 1:195136‑M2/149‑3 (MQ=255) aTACCGATTGCCTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGg > 6:155615‑M2/1‑145 (MQ=255) aTACCGATTGCCTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGg < 5:155615‑M2/146‑2 (MQ=255) cGATTGCCTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGgcg > 7:162465/1‑149 (MQ=255) gATTGCCTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGgcgc < 2:228295/149‑1 (MQ=255) cTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCg > 7:138756/1‑149 (MQ=255) aGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCggg < 6:156769/148‑1 (MQ=255) aGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGc < 2:292260/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAg < 8:162465/149‑1 (MQ=255) cccATCCAGCCGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCt < 8:67604/148‑1 (MQ=255) gcgACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAgg < 7:146731/149‑1 (MQ=255) gTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGg < 4:312471‑M2/105‑2 (MQ=255) gTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGg > 3:312471‑M2/1‑104 (MQ=255) cTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTggc < 5:248157/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTggc < 7:76572/149‑1 (MQ=255) gAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGcc > 3:257567/1‑149 (MQ=255) gaaCGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACCTCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTAc < 4:52544/148‑1 (MQ=255) gTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTg < 2:283158/95‑1 (MQ=255) gTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTg > 1:283158/1‑95 (MQ=255) cTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCAAGGCCTGGGTCAAgg > 6:244245/1‑149 (MQ=255) ccACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGcc > 2:229622/1‑149 (MQ=255) cACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCt > 6:44163/1‑149 (MQ=255) ccGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGCCGTCACGGCGCGGGGCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGa < 6:194572/149‑1 (MQ=255) aTACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCt > 7:57101/1‑121 (MQ=255) aTACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCt < 8:57101/121‑1 (MQ=255) tACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAg < 2:195136/149‑1 (MQ=255) tACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAg < 5:257978/149‑1 (MQ=255) cacaTCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGCTCAGGCCTTGACCCAGgc < 5:4650/149‑1 (MQ=255) caTCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGgcg > 1:180081/1‑148 (MQ=255) caTCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGgcg < 2:180081/148‑1 (MQ=255) aTCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGgcg > 4:114555/1‑147 (MQ=255) ggtcggCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGcc > 4:301539/1‑149 (MQ=255) ggtcggCCCCTCGACCACGCACAGCTGAGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCACGCGCAGcc > 6:161421/1‑149 (MQ=255) gCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGggtcgaggggccgaccgatgtgtatgcggtggagcagactggctaccgtggccgttacttcgtgctcaaggggcacctgtcgccgctggatggcctggggcctgcggca < 4:18516‑M2/148‑110 (MQ=255) gCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCa > 5:303012/1‑149 (MQ=255) cccTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGggtcgaggggccgaccgatgtgtatgcggtggagcagactggctaccgtggccgttacttcgtgctcaaggggcacctgtcgccgctggatggcctggggcctgaggcaatc < 4:186971‑M2/149‑113 (MQ=255) ccTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTg > 5:305447/1‑149 (MQ=255) ccTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTg > 7:215185/1‑149 (MQ=255) tCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGggtcgaggggccgaccgatgtgtatgcggtggagcagactggctaccgtggccgttacttcgtgctcaaggggcacctgtcgccgcgggatggcctggggccggaggcaaacgg < 7:203416‑M2/148‑115 (MQ=255) gACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCAt > 7:257260/1‑105 (MQ=255) gACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCAt < 8:257260/105‑1 (MQ=255) gCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCt > 8:251036/1‑149 (MQ=255) acaGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTc > 5:33286/1‑148 (MQ=255) acaGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCg < 7:251036/149‑1 (MQ=255) cTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCTGCCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCGTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAg > 1:69245/1‑148 (MQ=255) cTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAg > 1:116378/1‑147 (MQ=255) tcgtcACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAg > 3:306443/1‑149 (MQ=255) tcgtcACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAg < 6:305447/149‑1 (MQ=255) tcgtcACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAg < 8:215185/149‑1 (MQ=255) gtcACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAggg < 3:114555/149‑1 (MQ=255) gtcACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAggg > 8:116760/1‑149 (MQ=255) tcACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAGGGc > 3:144990/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGggtcgaggggccgaccgatgtgtatgcggtggagcagactggctaccgtggccgttacttcgtgctcaaggggcacctgtcgccgctggatggcctggggcctgaggcaatcggtattccgcagctgatggcgcggatcgaa > 3:186971‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAGGGCCAt < 6:97652/149‑1 (MQ=255) | GAATACCGATTGCCTCAGGCCCCAGGCCATCCAGCGGCGACAGGTGCCCCTTGAGCACGAAGTAACGGCCACGGTAGCCAGTCTGCTCCACCGCATACACATCGGTCGGCCCCTCGACCACGCACAGCTGTGTGTCGTCACGGCGCGGGTCGGCGCACTGCGGGCACAGCT‑CCTGCTCGGTGAGGGTGCGACACTGGCGGCAATGCCCTACCCCTTCCATGGCCTGGGTCAAGGCCTGAGCCAGGCGCAGCCCGCCACTGCGGTCGCGCTCGAGCAGTTGCAGGGCCAT > NC_002947/4851960‑4852248 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |