New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1764244 | 43 (0.760) | 5 (0.090) | 3/244 | NT | 11.0% | coding (152/735 nt) | PP_1573 | major tail protein |
? | NC_002947 | = 1764290 | 40 (0.750) | coding (198/735 nt) | PP_1573 | major tail protein |
GCTCAGGGTACCCAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTGGGTGGTCGGTTG > NC_002947/1764105‑1764391 | gCTCAGGGTACCCAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGt < 6:164949/146‑1 (MQ=255) aGGGTACCCAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCaa < 7:92234/148‑1 (MQ=255) gggTACCCAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGt < 6:188218/149‑1 (MQ=255) ggccccccACGGCTCTGCCCTGCGCCCCACAGCTGCAAACCGCACCGTAATCGCAGCCATGGAGCTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCCGACCAGGTTGAACCCACCTGTCTCAGCGACACCGCGCGCAAGt < 8:228382/144‑1 (MQ=255) tACCCAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTAcc < 2:191757/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGc > 8:111494/1‑149 (MQ=255) aGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGt < 7:111494/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCg > 3:290302/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCa > 3:73111/1‑149 (MQ=255) gCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCgg > 8:109081/1‑149 (MQ=255) ccACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGc < 5:228894/149‑1 (MQ=255) acaGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCa < 5:318983/149‑1 (MQ=255) gCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGGACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtc > 5:295067‑M1/1‑101 (MQ=255) gCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtc > 5:306489‑M1/1‑101 (MQ=255) gCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtc < 3:31921‑M2/149‑3 (MQ=255) cAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtcg > 1:47066‑M2/1‑146 (MQ=255) cAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTt > 3:222275‑M2/1‑146 (MQ=255) aaaCCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtcgc > 7:109081‑M2/1‑145 (MQ=255) gtaccgtaTTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGAcc < 4:73111/149‑1 (MQ=255) cgtaTTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGAagcctggcccggggtgctaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacagg < 8:203307‑M1/149‑60 (MQ=255) gtaTTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGGACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacaggt < 6:295067‑M1/149‑61 (MQ=255) gtaTTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacaggt < 6:306489‑M1/149‑61 (MQ=255) aGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGAcc < 4:128432/149‑1 (MQ=255) gTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGAccc < 4:290302/149‑1 (MQ=255) aTGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACg > 2:173886/1‑149 (MQ=255) tGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGCCCCTCAACGTCGACCCACg > 1:309002/1‑148 (MQ=255) ggAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGc > 7:104083/1‑148 (MQ=255) gAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCt < 7:92659/148‑1 (MQ=255) aaTGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTc < 5:295920/148‑1 (MQ=255) aTGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCg > 6:119177/1‑148 (MQ=255) aCCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTgcg > 2:199449/1‑149 (MQ=255) ccgtCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCGCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCtt < 6:157393/146‑1 (MQ=255) ttCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTtca > 5:325325/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTtcat > 8:107823/1‑145 (MQ=255) gCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCg > 1:156141/1‑149 (MQ=255) ggAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGaa < 2:156141/149‑1 (MQ=255) gAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCgg > 2:254367/1‑146 (MQ=255) cccGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCt > 8:103602/1‑115 (MQ=255) cccGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCt < 7:103602/115‑1 (MQ=255) cccGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAgacga > 7:1000/1‑149 (MQ=255) cTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGccac > 8:159745/1‑148 (MQ=255) cAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCga < 7:107823/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCga > 4:278623/1‑149 (MQ=255) ggTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCgaga < 6:325325/149‑1 (MQ=255) gACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGGCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGtt < 4:31921/149‑1 (MQ=255) aCCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatac < 6:306489‑M2/149‑90 (MQ=255) aCCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggtccccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatac < 6:295067‑M2/149‑90 (MQ=255) aCCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGtt < 1:173886/148‑1 (MQ=255) aCCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGtt < 8:104083/148‑1 (MQ=255) ccTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTgg < 1:254367/149‑1 (MQ=255) ccTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTAGCACCCCGGGCCAGGCTtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacg < 8:203307‑M2/149‑91 (MQ=255) cTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATTAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTggg < 5:119177/149‑1 (MQ=255) cTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTggg > 1:242284/1‑149 (MQ=255) tctcAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTGggtgg > 3:345686/1‑149 (MQ=255) tcAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCgaga > 8:151982/1‑132 (MQ=255) gCGAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacggtacggttt > 7:109081‑M1/1‑4 (MQ=255) cGAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacggtacggtttg > 1:47066‑M1/1‑3 (MQ=255) cGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTGGGTGGTCGGtt > 1:357424/1‑149 (MQ=255) gAagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacggtacggtttgc < 3:31921‑M1/149‑148 (MQ=255) gACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacggtacggtttgc > 5:306489‑M2/1‑48 (MQ=255) gACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggtccccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacggtacggtttgc > 5:295067‑M2/1‑48 (MQ=255) aagcctggcccggggtgcgaaggccacgcaggtacttgcgcacggtgtcgctgagacaggtcacttcaacctggtcagcggggttcccgcctggactgaaggcggtggcgcattcaacctccatgacttcgaatacggtacggtttg > 3:222275‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCTCAGGGTACCCAGGTCTATGCCCTGGTGCCCACAGCTGCAAACCGTACCGTATTCGAAGTCATGGAGGTTGAATGCGCCACCGCCTTCAGTCCAGGCGGGAACCCCGCTGACCAGGTTGAAGTGACCTGTCTCAGCGACACCGTGCGCAAGTACCTGCGTGGCCTTCGCACCCCGGGCCAGGCTTCGCTGACCCTCAACGTCGACCCACGCAACGCCTCGCACGTGCGCCTTCATCAGATCTCGGAAGACGACACCATCGAGAGCATTCGTTGGGTGGTCGGTTG > NC_002947/1764105‑1764391 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |