New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 43823 = | 46 (0.810) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 6.4% | coding (1702/1998 nt) | cadA‑I | cadmium translocating P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 43868 = | 45 (0.860) | coding (1657/1998 nt) | cadA‑I | cadmium translocating P‑type ATPase |
GCAAATGGGAGTTGCCTGATGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCC > NC_002947/43720‑44015 | gCAAATGGGAGTTGCCTGATGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCAc > 1:261934/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGATGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTaa < 6:32250/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAg < 3:322021/148‑1 (MQ=255) aTGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGgcgc < 3:158040/147‑1 (MQ=255) tGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAgg < 5:284662/149‑1 (MQ=255) ccATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATg > 7:308237/1‑149 (MQ=255) cATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCCGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATgg > 1:69864/1‑149 (MQ=255) cATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTg < 6:44216/145‑1 (MQ=255) cATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTg > 5:44216/1‑145 (MQ=255) aTAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCACCA‑ATTGCGATAACACCGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGTCGCATGTTTTTGATg > 2:246852/1‑147 (MQ=255) tAAGCGCTATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGcc < 5:241073/149‑1 (MQ=255) aGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCtt < 2:288221/149‑1 (MQ=255) gcgcGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCtt > 7:10699/1‑148 (MQ=255) gATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCCTATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGAcc > 1:250138/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGTGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATCGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGt < 8:111862/148‑1 (MQ=255) tCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTc < 2:334384/149‑1 (MQ=255) gCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCCACGCTCGCACTGGCCATGGCAGGGGCAGCATTGATGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTc < 7:209794/149‑1 (MQ=255) gCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTc < 2:250138/149‑1 (MQ=255) gCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTc > 5:90020/1‑149 (MQ=255) cGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCg < 2:261934/149‑1 (MQ=255) cGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCg < 6:214265/149‑1 (MQ=255) ggCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGt > 1:185981/1‑149 (MQ=255) aCATCAGATCCAGCAGCCACC‑ATTGCGATACCAACGCTCCAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTcc < 5:244279/149‑1 (MQ=255) aGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACg > 8:91545/1‑149 (MQ=255) cagcagCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTc < 6:90020/148‑1 (MQ=255) cccc‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGc < 8:308237/149‑1 (MQ=255) cc‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGcc > 6:137484/1‑148 (MQ=255) aTTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAAc > 3:115555/1‑149 (MQ=255) gATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTg < 8:189058/147‑1 (MQ=255) gATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGtt > 5:127890/1‑149 (MQ=255) gATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGtt < 5:137484/149‑1 (MQ=255) gATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTGGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTg > 7:189058/1‑147 (MQ=255) cAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATAATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGc > 8:98447/1‑148 (MQ=255) aCTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTg < 4:115555/149‑1 (MQ=255) tggccatggtgggtgacggcgtcaatgatgcccctgccatggccaCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGc > 1:208024‑M2/46‑148 (MQ=255) ctcatggtgggtgacggcgtcaatgatgcccctgccatggccaCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAAc < 7:338796‑M2/106‑1 (MQ=255) GCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAAc < 6:15562‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAAATTGTTTGGCTACAGCCTCTGCa < 8:110589‑M1/147‑1 (MQ=255) atggtgggtgacggcgtcaatgatgcccctgccatggccaCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGGCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCTAc > 8:338796‑M2/41‑146 (MQ=255) TGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCgg > 7:91545‑M1/1‑149 (MQ=255) GCAGGGGCATCATTGACGCAGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGtt > 7:186940‑M1/1‑149 (MQ=255) aGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTtgg > 6:227028/1‑148 (MQ=255) aGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCATCTGCAACGAGGTtgg > 6:232278/1‑148 (MQ=255) ggggCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTtgtg < 5:15562/149‑1 (MQ=255) ggCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGt < 7:110589/149‑1 (MQ=255) gCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGtc < 7:98447/149‑1 (MQ=255) catcatTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGtct > 1:194174/1‑149 (MQ=255) atcatTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTtgtg < 2:286127/144‑1 (MQ=255) atcatTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGtctc > 8:176124/1‑149 (MQ=255) atcatTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGAATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTtgtg > 1:286127/1‑144 (MQ=255) ttGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGa < 7:176124/149‑1 (MQ=255) tGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGc < 4:42248/102‑1 (MQ=255) tGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGc > 3:42248/1‑102 (MQ=255) ccaccaTGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGt > 2:238598/1‑123 (MQ=255) ccaccaTGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGAAATCATGACCATg > 5:61552/1‑149 (MQ=255) ccaccaTGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGAAGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGt < 1:238598/123‑1 (MQ=255) ccaCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATg > 7:94259‑M2/4‑149 (MQ=255) ccaCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCGTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCGTGATCTAAGCGAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCACCGGGGTTGTGGGCTCCCGAATTGAAGaccatgcggtgggtg > 2:67710‑M2/4‑142 (MQ=255) caCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGc < 8:10699‑M2/147‑1 (MQ=255) aCCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGcc < 8:94259‑M2/148‑1 (MQ=255) | GCAAATGGGAGTTGCCTGATGTCGTCAGCCATAAGCGCGATATCAGCCGTTTCCAGGGCAACATCAGATCCAGCAGCCCCC‑ATTGCGATACCAACGCTCGAACTGGCCATGGCAGGGGCATCATTGACGCCGTCACCCACCATGGCCACCTTGGCGCTAAGGCGCAGGTTTTTGATGGCCTTGACCTTGTCTTCCGGCATCAGGTCTCCCCACGCTTCATCTAAGCCAACTTGTTTGGCTACAGCCTCTGCAACGCGGTTGTGGTCTCCAGAAATCATGACCATGCGTTCGATGCC > NC_002947/43720‑44015 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |