New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1976704 = | 67 (1.180) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.9% | coding (368/2241 nt) | PP_1770 | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
? | NC_002947 | 1976760 = | 44 (0.810) | coding (424/2241 nt) | PP_1770 | 3‑phosphoshikimate 1‑carboxyvinyltransferase |
CCTGGCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGGACGCCGATGTGGAGCACATGTCGGTCGAGCGCCATGA > NC_002947/1976612‑1976908 | ccTGGCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCgggg < 2:305559/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCgggg > 4:183475/1‑148 (MQ=255) ggCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCgggg > 5:12537/1‑146 (MQ=255) gCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTa < 7:31339/147‑1 (MQ=255) gCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTa < 4:131820/147‑1 (MQ=255) ccTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCCTCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCTGGGTAGAgg > 3:37273/1‑149 (MQ=255) cTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTc > 2:243114/1‑149 (MQ=255) gACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCaa < 3:183475/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAAt < 1:294369/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAAt < 4:42358/149‑1 (MQ=255) gCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGtt > 6:223679/1‑149 (MQ=255) tcatcaCCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTccgc > 5:59299/1‑149 (MQ=255) tcaCCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTg < 6:238144/140‑1 (MQ=255) tcaCCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTg > 5:238144/1‑140 (MQ=255) caCCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTccgcc > 5:88123/1‑146 (MQ=255) caCCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTccgcc < 6:88123/146‑1 (MQ=255) ccGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGca > 5:78841/1‑148 (MQ=255) cGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTACAGGCGGCCAAAGCAACCGTGTTCCGCCGGccca > 4:203047/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGACGCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTc < 1:89653/148‑1 (MQ=255) gCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATc > 2:189389/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATc < 2:185161/149‑1 (MQ=255) gcgcCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCt > 5:155057/1‑148 (MQ=255) gcCTAGGGCAACGGCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGAGCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCAGCGCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGTGCGGGGTATAGGCGTCCAATTCCAGCTTGTTCCTCCGGCACAAGGTCATCCTCAc < 4:203046/149‑1 (MQ=255) gcCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCAc < 6:155057/149‑1 (MQ=255) gcCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCAc > 2:195560/1‑149 (MQ=255) cAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCAcgc < 3:307532/149‑1 (MQ=255) aGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCAcgccg > 3:274554/1‑149 (MQ=255) ggCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCt < 1:195560/149‑1 (MQ=255) gtgcgtgAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGaaa < 5:151669/148‑1 (MQ=255) gtgcgtgAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGaaa < 4:338915/148‑1 (MQ=255) cgtgAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGa < 1:243114/149‑1 (MQ=255) gtgAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGAc < 6:231409/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCcc‑g > 4:268450/1‑149 (MQ=255) gCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTcc > 6:369820/1‑81 (MQ=255) gCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTcc < 5:369820/81‑1 (MQ=255) ggTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTgg < 8:184352/148‑1 (MQ=255) tGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGC‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGtt > 5:274316/1‑148 (MQ=255) CCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGa > 5:223679‑M1/1‑148 (MQ=255) CCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGAc < 5:350584‑M1/149‑1 (MQ=255) cccgctctgctcggaaccggcgatggggtggcccgggacgaagcgcggcaggcgggGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGcc < 1:356022‑M2/60‑1 (MQ=255) cccgctctgctcggaaccggcgatggggtggcccgggacgaagcgcggcaggcgggGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGcc > 2:356022‑M2/57‑116 (MQ=255) CCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTc < 1:337356‑M1/66‑1 (MQ=255) CCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTc > 2:337356‑M1/1‑66 (MQ=255) ccgctctgctcggaaccggcgatggggtggcccgggacgaagcgcggcaggcgggGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAACGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCATGGTTGAcc > 2:235787‑M2/56‑149 (MQ=255) GCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGc > 6:78841‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCtgt > 3:248993/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCtgt < 4:274554/148‑1 (MQ=255) gcTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGt < 5:323681/149‑1 (MQ=255) cTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGACCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCt < 7:66950/141‑1 (MQ=255) cTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGACCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCt > 8:66950/1‑141 (MQ=255) aaccggcgatggggtggcccgggacgaagcgcggcaggcgggGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACATGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCCTGCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTg < 1:235787‑M2/107‑1 (MQ=255) ggcccGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCt < 3:203047/147‑1 (MQ=255) tCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTg > 2:337318/1‑149 (MQ=255) ccGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTgg < 1:189389/148‑1 (MQ=255) cACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGGACGCCGa < 3:320056/149‑1 (MQ=255) cACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGGACGCCGa > 4:320056/1‑149 (MQ=255) ggTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCt > 7:38802/1‑128 (MQ=255) ggTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCt < 8:38802/128‑1 (MQ=255) cgggGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGGACGCCGATGTGGAGCACATGTCGGTCGAGCGcc < 1:337318‑M2/145‑1 (MQ=255) gTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCtgtg < 3:341418/101‑1 (MQ=255) gTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCtgtg > 4:341418/1‑101 (MQ=255) gTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGGACGCCGATGTGGAGCACATGTCGGTCGAGCGCCATGa < 4:164600/149‑1 (MQ=255) gTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGAACGCCGATGTGGAGCACATGTCGGTCGAGCGCCAGGa > 8:105137/1‑149 (MQ=255) | CCTGGCCCTGCTCGACCTGGGTGATGCAATCATCACCGACGTCGGCAGCGCCAAGGGCAACGTCGTGCGTGAGGCGCGTGCCGTCTTCGGTGCCCGCCTGCCGCGCTTCGTCCCGGGCCACCCCATCGCCGGTTCCGA‑GCAGAGCGGGGTAGAGGCGTCCAATGCCACCTTGTTCCGCCGGCACAAGGTCATCCTCACGCCGCTGGCCGAAACCGACCCC‑GCCGCGCTGGTCCTGGTTGACCGCCTGTGGCGTGCGCTGGACGCCGATGTGGAGCACATGTCGGTCGAGCGCCATGA > NC_002947/1976612‑1976908 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |