New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 170160 = | 48 (0.870) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.3% | coding (562/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
? | NC_002947 | 170220 = | 42 (0.780) | coding (622/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
CTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGG > NC_002947/170012‑170304 | cTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCgg > 8:80011/1‑149 (MQ=255) tgaaatcgccatctgccgtcggaaagtcctggtaagggactatattaggatgcgcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTc < 8:326233‑M1/3‑1 (MQ=255) tgaaatcgccatctgccgtcggaaagtcctggtaagggactatattaggatgcccattacccagccgacggggagcggtgccagtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTc < 1:282823‑M1/3‑1 (MQ=255) cgcTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATgctg‑g < 6:211550/149‑1 (MQ=255) cTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATgctg‑gct > 2:327276/1‑149 (MQ=255) gatATGACTTCATGATCGTGGGGTTGGGTGGGCTGATGTGTCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGTAGAAGGCGCAGTGCCGGTC‑AAGGTGTGTGTGGC‑GCTTACCGATATTGTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGcc < 1:94933/147‑1 (MQ=255) aTGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTc > 2:79526/1‑149 (MQ=255) ctttaataTCCCGGGGGTGGGTTGGGGGAATACCCTGACCGGCCGTCCGGTCGGGGTATCACGCGCATGGCCGGTT‑AATGTGGGGTTGGCTGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGc < 1:98122/141‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCg < 7:80011/149‑1 (MQ=255) aTGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCg > 7:328259/1‑149 (MQ=255) gggtgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAggg < 8:199978/148‑1 (MQ=255) ggtgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATgctg‑g < 1:158443/118‑1 (MQ=255) ggtgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATgctg‑g > 2:158443/1‑118 (MQ=255) gtgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTc > 5:340193/1‑149 (MQ=255) tgggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCg < 8:328259/149‑1 (MQ=255) gggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGcc < 4:231085/120‑1 (MQ=255) gggCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGcc > 3:231085/1‑120 (MQ=255) ttaggatgcgcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGc < 4:326776‑M1/48‑1 (MQ=255) ttaggatgcgcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGc > 3:326776‑M1/102‑149 (MQ=255) tgaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCAt > 2:231494/1‑149 (MQ=255) gaGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATg > 5:243143/1‑149 (MQ=255) gCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGt > 1:74481/1‑149 (MQ=255) gCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTc < 6:340193/149‑1 (MQ=255) gcattacccagccgacggggaggggtgcccgtggtcaggtagttcatcgcctggttcgccagacaggccacctgcacatcaagcaatgccatGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTc > 7:70949‑M1/93‑149 (MQ=255) cTGACCGGCCGTCCGGATGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGa < 2:220834/149‑1 (MQ=255) gACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGt > 8:218952/1‑144 (MQ=255) gACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGt < 7:218952/144‑1 (MQ=255) ccGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATg > 6:367892/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATg < 5:367892/149‑1 (MQ=255) cGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCTCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg > 6:342960/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGc < 2:74481/149‑1 (MQ=255) tCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGc > 4:128036/1‑149 (MQ=255) ggAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTg < 6:243143/149‑1 (MQ=255) aGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 3:272399/149‑1 (MQ=255) aGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:114154/149‑1 (MQ=255) ncgcAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGcc > 8:104530/2‑149 (MQ=255) gcgcAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGcc > 8:99539/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCTCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCt < 5:342960/149‑1 (MQ=255) tC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAAc < 1:327276/149‑1 (MQ=255) ggtgggtgTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACGGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAgg > 1:29934/1‑149 (MQ=255) ggtgggtgTGGC‑GCTTACCGATATTCAGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAgg > 1:60112/1‑149 (MQ=255) tgtgGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGTGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGAt > 1:94192/1‑148 (MQ=255) gc‑gcTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt > 2:347283/1‑111 (MQ=255) gc‑gcTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:347283/111‑1 (MQ=255) c‑gcTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTAc > 7:115396/1‑149 (MQ=255) cGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCa > 7:9146/1‑149 (MQ=255) cGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTAGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGAccc > 8:109775/1‑148 (MQ=255) ttCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGGATTGCTTGAGGTGGAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTCACTGACCACGGGc > 8:166408/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCAc < 8:9146/146‑1 (MQ=255) gggtGTAGTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCGATCGGGTTCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTccc < 2:60112/146‑1 (MQ=255) gTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcccc > 6:31571/1‑149 (MQ=255) gTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcccc < 7:99539/149‑1 (MQ=255) gTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcccc < 7:104530/149‑1 (MQ=255) ttCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGACCATCGGGATCATACAGGTGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTATGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACAACGGACACCCCTCACCCTCGGc > 2:282823/1‑149 (MQ=255) ccGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCt < 5:31571/148‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg > 7:286609/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg < 2:29934/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg > 5:149013/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg < 1:231494/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCATGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg > 1:310861/1‑149 (MQ=255) | CTATGCCAAGCGCGCTGGCTATGACTTCATGATCCAGGGGTTGGGTGGGCTGATGAGCCTGACCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTC‑AAGGTGGGTGTGGC‑GCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCCTGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGG > NC_002947/170012‑170304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |