New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 170160 = | 48 (0.870) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.3% | coding (562/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
? | NC_002947 | 170220 = | 42 (0.780) | coding (622/1221 nt) | PP_0159 | family III CoA‑transferase |
CCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCA > NC_002947/170074‑170364 | ccGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATg < 5:367892/149‑1 (MQ=255) ccGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATg > 6:367892/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCTCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATgg > 6:342960/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGc > 4:128036/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGc < 2:74481/149‑1 (MQ=255) ggAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTg < 6:243143/149‑1 (MQ=255) aGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:114154/149‑1 (MQ=255) aGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 3:272399/149‑1 (MQ=255) ncgcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGcc > 8:104530/2‑149 (MQ=255) gcgcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGcc > 8:99539/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCTCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑t < 5:342960/149‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAAc < 1:327276/149‑1 (MQ=255) ggtgggtgTGGCGCTTACCGATATTCTGACGGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAgg > 1:29934/1‑149 (MQ=255) ggtgggtgTGGCGCTTACCGATATTCAGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAgg > 1:60112/1‑149 (MQ=255) tgtgGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTGTGCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGAt > 1:94192/1‑148 (MQ=255) gcgcTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt > 2:347283/1‑111 (MQ=255) gcgcTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGAt < 1:347283/111‑1 (MQ=255) cgcTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTAc > 7:115396/1‑149 (MQ=255) cGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCa > 7:9146/1‑149 (MQ=255) cGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTAGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGAccc > 8:109775/1‑148 (MQ=255) ttCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGGATTGCTTGAGGTGGAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTCACTGACCACGGGc > 8:166408/1‑149 (MQ=255) aCCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCAc < 8:9146/146‑1 (MQ=255) gggtGTAGTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCGATCGGGTTCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTccc < 2:60112/146‑1 (MQ=255) gTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcccc < 7:99539/149‑1 (MQ=255) gTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcccc < 7:104530/149‑1 (MQ=255) gTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTcccc > 6:31571/1‑149 (MQ=255) ttCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGACCATCGGGATCATACAGGTGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTATGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACAACGGACACCCCTCACCCTCGGc > 2:282823/1‑149 (MQ=255) ccGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCt < 5:31571/148‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg > 7:286609/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg < 1:231494/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg > 5:149013/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg < 2:29934/149‑1 (MQ=255) cgcgGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCA‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTgg > 1:310861/1‑149 (MQ=255) TCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAAt > 2:94192‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATg < 7:326233‑M1/149‑1 (MQ=255) GCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGc > 8:286609‑M1/1‑149 (MQ=255) gacatgctggccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagccagcatggcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATgc > 7:70949‑M2/58‑149 (MQ=255) cATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTAc < 6:136370/109‑1 (MQ=255) cATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTAc > 5:136370/1‑109 (MQ=255) g‑gctgCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGCGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCt > 1:33417/1‑148 (MQ=255) gctgCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGAAAGTTGCCATGTCTGGCGACCCAGGCCATGAACTACATCCCCACGGGCCCCCAACCCCGTAGCCTGGGTAATccgaaacaa > 1:286005/1‑142 (MQ=255) gccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagccagcatggcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTaa < 4:326776‑M2/101‑1 (MQ=255) gccgacccctgtctgatcccgatgggcgagggcagccagcatggcgacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTaa > 3:326776‑M2/49‑149 (MQ=255) ctgCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTaa > 6:223211/1‑148 (MQ=255) cccTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAata < 6:149013/147‑1 (MQ=255) gCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTccc < 5:223211/149‑1 (MQ=255) tCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTAcc < 3:128036/149‑1 (MQ=255) ggggTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGAc < 8:115396/149‑1 (MQ=255) ggTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGTGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACgg > 4:329075/1‑149 (MQ=255) ccAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAAt < 6:295647/103‑1 (MQ=255) gCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAAGCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCGCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCg < 2:286005/149‑1 (MQ=255) gacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACTGGCACCGCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGGGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCa < 1:282823‑M2/145‑1 (MQ=255) gacATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCa < 8:326233‑M2/145‑1 (MQ=255) | CCGGCCGTCCGGAGGGTGAAGAAGGCGCAGGGCCGGTCAAGGTGGGTGTGGCGCTTACCGATATTCTGACCGGGTTGTATTCCGCGGTCGCCATGCTG‑GCTGCCCTCGCCCATCGGGATCAGACAGGGGTCGGCCAGCATGTCGACATGGCATTGCTTGATGTGCAGGTGGCC‑TGTCTGGCGAACCAGGCGATGAACTACCTGACCACGGGCACCCCTCCCCGTCGGCTGGGTAATGCGCATCCTAATATAGTCCCTTACCAGGACTTTCCGACGGCAGATGGCGATTTCA > NC_002947/170074‑170364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |