New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1720832 = | 49 (0.880) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 8.6% | coding (572/1101 nt) | PP_1516 | RND membrane fusion protein |
? | NC_002947 | 1720890 = | 38 (0.710) | coding (630/1101 nt) | PP_1516 | RND membrane fusion protein |
CTCTACCGTGCAGGCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGGCGCGTTTCCAGGGGCGCA > NC_002947/1720684‑1720975 | ctctACCGTGCAGGCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCgg > 5:20809/1‑149 (MQ=255) tctACCGTGCAGGCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCggg > 7:190115/1‑149 (MQ=255) aaggcgatgcgcgccgcgaacgtgcgcgagcgcgggtcggcggccggtgacagctcgcgaatgcgcccctggaaacgcgcctgcgggtgcgaccacagctccacgctcaccggttggcccacagcgaagcgggcgaactgctgctccgg < 1:21506‑M1/2‑1 (MQ=255) ggcgatgcgcgccgcgaacgtgcgcgagcgcgggtcggcggccggtgacagctcgcgaatgcgcccctggaaacgcgcctgcgggtgcgaccacagctccacgctcaccggttggcccacagcgaagcgggcgaactgctgctccGGCa > 7:42369‑M1/146‑149 (MQ=255) tGCAGGCCTTGCCCGTCTGGAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCACCCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCg > 7:2997/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTAATGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGAACGCCAAGGCCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCgt > 3:42724/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCgtg < 3:214656/149‑1 (MQ=255) gcgccgcgaacgtgcgcgagcgcgggtcggcggccggtgacagctcgcgaatgcgcccctggaaacgcgcctgcgggtgcgaccacagctccacgctcaccggttggcccacagcgaagcgggcgaactgctgctccGGCAGACCgtgt < 2:355125‑M1/12‑1 (MQ=255) ggCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGtt > 5:209035/1‑149 (MQ=255) cccGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCtt < 3:46552/149‑1 (MQ=255) cGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTgc < 1:184336/149‑1 (MQ=255) gAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCAcc > 5:56308/1‑139 (MQ=255) gAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCAcc < 6:56308/139‑1 (MQ=255) gCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCATGCCGACTATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTCGACGTGGGCCTGGTGGGCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATg < 3:28074/149‑1 (MQ=255) aGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGgcgagcga < 6:209035/149‑1 (MQ=255) ccGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGCTCGCGAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGaa < 7:228944/149‑1 (MQ=255) cGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAg > 5:180178/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAg > 8:157287/1‑149 (MQ=255) gAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGt < 7:308582/149‑1 (MQ=255) aGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTg > 1:291089/1‑149 (MQ=255) aGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTg < 3:153476/149‑1 (MQ=255) ttCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTgg < 2:333477/148‑1 (MQ=255) ttCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGc > 7:283882/1‑149 (MQ=255) tCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGc > 5:8926/1‑148 (MQ=255) aTGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCACCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATc > 6:112197/1‑149 (MQ=255) tgGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGc < 2:291089/149‑1 (MQ=255) gCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTgg < 1:342182/139‑1 (MQ=255) gCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTgg > 2:342182/1‑139 (MQ=255) gggCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGGGAAGTGGCCATCGGCCTGc > 3:88277/1‑149 (MQ=255) gcgaatgcgcccctggaaacgcgcctgcgggtgcgaccacagctccacgctcaccggttggcccacagcgaagcgggcgaactgctgctccGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGc > 1:355125‑M1/92‑148 (MQ=255) cAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCg > 5:223957/1‑148 (MQ=255) aCCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGag < 6:8926/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCACCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGagc < 5:112197/149‑1 (MQ=255) aGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCTCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGagcag < 6:327845/149‑1 (MQ=255) aGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGagcag < 6:74534/149‑1 (MQ=255) tGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGtt > 5:225247/1‑144 (MQ=255) tGCCGTATTGCGGGCTCCGCAGGCCGGGGTGAGCGCCAAGCGCCTGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGtt < 6:225247/144‑1 (MQ=255) gCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCg > 6:72648/1‑149 (MQ=255) gtgcgCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGGGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCtgtg < 4:88277/149‑1 (MQ=255) cgcAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCaa > 3:229513/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCg < 6:223957/149‑1 (MQ=255) acagctccacgctcaccggttggcccacagcgaagcgggcgaactgctgctccGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGcc < 1:244878‑M1/58‑1 (MQ=255) acagctccacgctcaccggttggcccacagcgaagcgggcgaactgctgctccGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGcc > 2:244878‑M1/54‑111 (MQ=255) ggTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCg > 4:7086/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTgg < 6:180178/148‑1 (MQ=255) cGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGCGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTTTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAg < 8:283882/148‑1 (MQ=255) gCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCt < 7:157287/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCt < 4:229513/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGt < 5:72648/149‑1 (MQ=255) gTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGgc > 6:290908/1‑149 (MQ=255) gTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGgc > 6:286065/1‑149 (MQ=255) ggtggtCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCAc < 1:148021/133‑1 (MQ=255) ggtggtCGCCGCCGGGCAGAACGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCAc > 2:148021/1‑133 (MQ=255) gtCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAgcagca > 4:137861/1‑77 (MQ=255) gtCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAgcagca < 3:137861/77‑1 (MQ=255) ccgccgGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGGCGCGTTTCCAGGGgcgc < 5:290908/149‑1 (MQ=255) ccgccgGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGGCGCGTTTCCAGGGgcgc < 5:286065/149‑1 (MQ=255) cgccgGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGGCGCGTTTCCAGGGGCGCa > 8:189704/1‑149 (MQ=255) cgccgGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGGCGCGTTTCCAGGGGCGCa > 8:79432/1‑149 (MQ=255) | CTCTACCGTGCAGGCCTTGCCCGTCTGAAGCAGGCCAAGGCCGAGTTCGATGTGGCGGGCAACCAGGCCGAATATGCCGTATTGCGTGCGCCGCAGGCCGGGGTGATCGCCAAGCGCCAGGTTGAAGTGGGCCAGGTGGTCGCCGCCGGGCAGACCGTGTTCACCCTTGCCGCCGATGGCGAGCGAGAAGTGGCCATCGGCCTGCCGGAGCAGCAGTTCGCCCGCTTCGCTGTGGGCCAACCGGTGAGCGTGGAGCTGTGGTCGCACCCGCAGGCGCGTTTCCAGGGGCGCA > NC_002947/1720684‑1720975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |