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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
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aGCGGTGAATACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGAGCCTTc > 4:77728/1‑133 (MQ=255) aGCGGTGAATACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGAGCCTTc < 3:77728/133‑1 (MQ=255) tGAATACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCcgc > 7:255920/1‑149 (MQ=255) aTACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGcgtc < 8:218272/149‑1 (MQ=255) tACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGcgtcg < 1:208272/149‑1 (MQ=255) tACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGcgt < 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ccAGCAGCGGGGTGCCTTCctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaaggg < 7:273539‑M2/81‑63 (MQ=255) ccAGCAGCGGGGTGCCTTCctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaaggg > 8:273539‑M2/1‑19 (MQ=255) cagcaggaaggcaccccgctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaagggtaccaacctgctgggggtcaaggccgtgctggcagaaagcttcga < 7:184053‑M1/125‑120 (MQ=255) cagcagCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcatca < 7:189108/149‑1 (MQ=255) cagcagCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcatca > 4:24878/1‑149 (MQ=255) agcaggaaggcaccccgctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaagggtaccaacctgctgggggtcaaggccgtgctggcagagagcttcgagcgtattcaccgctccaacctggtg > 7:165297‑M1/1‑5 (MQ=255) agcaggaaggcaccccgctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaagggtaccaacctgctgggggtcaaggccgtgctggcagaaagcttcgagcgtattcaccgctccaacctggtg < 2:106481‑M1/149‑145 (MQ=255) gcagcGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATTCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcatcat > 8:59868/1‑148 (MQ=255) ggaaggcaccccgctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaagggtaccaacctgctgggggtcaaggccgtgctggcagaaagcttcgagcgtattcaccgctccaacctggtgggca > 8:330733‑M1/1‑1 (MQ=255) | TAATACGCCCATGCCCACCAGGTTGGAGCGGTGAATACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGCATCATCACT > NC_002947/2408955‑2409249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |