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tCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactggg < 4:39970‑M2/74‑53 (MQ=255) aCCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcat > 7:310665/1‑149 (MQ=255) aCCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcat < 3:70518/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGca < 1:136816/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGGGGTGCCTTCctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaaggg < 7:273539‑M2/81‑63 (MQ=255) ccAGCAGCGGGGTGCCTTCctgctggtgattgccggccaggagtacggcaccggttcgagccgcgactgggctgccaaggg > 8:273539‑M2/1‑19 (MQ=255) cagcagCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcatca < 7:189108/149‑1 (MQ=255) cagcagCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcatca > 4:24878/1‑149 (MQ=255) gcagcGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATTCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGcatcat > 8:59868/1‑148 (MQ=255) gTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGCATCATCACTTCGTg < 7:59868/149‑1 (MQ=255) tGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGCATCATCACTTCGTgg > 8:241504/1‑149 (MQ=255) ttCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGCATCATCACTTCGTGGTTGc > 5:180598/1‑149 (MQ=255) | ATGCCCACCAGGTTGGAGCGGTGAATACGCTCGAAGCTTTCTGCCAGCACGGCCTTGACCCCCAGCAGGTTGGTACCCTTGGCAGCCCAGTCGCGGCTCGAACCGGTGCCGTACTCCTGGCCGGCAATCACCAGCAGCGGGGTGCCTTCCTGCTGGTAACGCATGGCCGCGTCGTAGATCGACAGCTTCTCGCCAGTGGGCACATGCAAGGTGTTGCCGCCTTCTTCACCTGCCAGCATCTCGTTGCGAATACGGATGTTGGCGAAGGTGCCGCGCATCATCACTTCGTGGTTGC > NC_002947/2408965‑2409259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |