New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2774442 = | 46 (0.830) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.6% | coding (1070/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2774487 = | 41 (0.770) | coding (1025/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
CAGCGTTTGCCCGTCGGCGCTGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCAC > NC_002947/2774300‑2774589 | caGCGTTTGCCCGTCGGCGCTGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCa > 5:335298/1‑148 (MQ=255) gTTTGCCCGTCGGCGCTGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATacac > 2:39044/1‑149 (MQ=255) ccGTCGGCGCTGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTgc > 1:328296/1‑149 (MQ=255) ccGTCGGCGCTGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTgc < 6:271638/149‑1 (MQ=255) tGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTg > 8:26501/1‑148 (MQ=255) atatCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCAc < 2:328296/149‑1 (MQ=255) cACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTa > 5:347905/1‑149 (MQ=255) cTGATGGGCGCGCCCTGGTAATGCTGCCAATGCTCCTTACCCTCTTCGCCAACCGCCCGCTGGTAGCAATAGGCATCACCCACATTGTCCTCCCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCTGGGGGGTAcg < 6:347905/149‑1 (MQ=255) ggTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGt > 3:276555/1‑149 (MQ=255) cagttgatcgtcaatgcctgccatttctacagcggtgccacgctggccgtgagggtggcagacctgcacgggctggataccgattactacagccaggaCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTgg > 6:306026‑M1/99‑149 (MQ=255) aGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCTCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTgg < 4:276555/149‑1 (MQ=255) aGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTgg < 1:39044/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCggg < 2:278260/133‑1 (MQ=255) gCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGACATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCggg > 1:278260/1‑133 (MQ=255) aaTGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCTCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTaa > 7:157419/1‑149 (MQ=255) ctgcCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCAGCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCg < 6:335298/148‑1 (MQ=255) tgcCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCg > 7:244772/1‑118 (MQ=255) tgcCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCg < 8:244772/118‑1 (MQ=255) ccAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATc < 8:16786/105‑1 (MQ=255) ccAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATc > 7:16786/1‑105 (MQ=255) aaTGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATcc < 4:271294/149‑1 (MQ=255) aTGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCa < 7:18430/149‑1 (MQ=255) acagcggtgccacgctggccgtgagggtggcagacctgcacgggctggataccgattactacagccaggaCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGt < 3:240648‑M1/46‑1 (MQ=255) acagcggtgccacgctggccgtgagggtggcagacctgcacgggctggataccgattactacagccaggaCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTCCACCAGCGGGGTACGCGGGt > 4:240648‑M1/71‑116 (MQ=255) tctTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCg < 7:282047/129‑1 (MQ=255) tctTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCg > 8:282047/1‑129 (MQ=255) aaaCGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCAccc > 5:297378/1‑149 (MQ=255) ccGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACgg > 4:113616/1‑149 (MQ=255) gTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTa > 5:367147/1‑112 (MQ=255) gTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTa < 6:367147/112‑1 (MQ=255) ccATCGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACGCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCGTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCGCGTGCAGGTCTGCCAACCTGACGGCCAGCGTGGc > 8:291798/1‑149 (MQ=255) tAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAAAAAACAGTATACACCCCATTCAAGTAATCCACCCGACCGGCCCGCCTTGCAcc > 1:115109/1‑149 (MQ=255) cATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTgc < 5:98065/52‑1 (MQ=255) cATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTgc > 6:98065/1‑52 (MQ=255) tCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTg > 7:295981/1‑147 (MQ=255) cccACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCTCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGaa < 8:157419/149‑1 (MQ=255) cccACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCACCGCATACAACCTTGCGCCATCCTCCACCAGCGCGGTACGCGGGTCCTGGCTGAAGTAATCGGt > 6:220531/1‑95 (MQ=255) cccACAATCTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCTGATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGTTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGt < 5:220531/95‑1 (MQ=255) cacaATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt < 4:129149/110‑1 (MQ=255) cacaATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt > 3:129149/1‑110 (MQ=255) aaTGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATggc < 6:297378/149‑1 (MQ=255) aTGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATggca < 3:113616/149‑1 (MQ=255) tACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTAACCAGCCCGAGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCCGCCTGCCACCGCTGTAGAACTggcagg > 8:283975/1‑148 (MQ=255) tCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTgta < 7:296255/74‑1 (MQ=255) tCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCAAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCAtt > 7:187232/1‑149 (MQ=255) tCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCAGGCTgta > 8:296255/1‑74 (MQ=255) gCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGa > 5:112321/1‑149 (MQ=255) gCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGa > 8:297125/1‑149 (MQ=255) cgcgcTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCaa > 5:321894/1‑149 (MQ=255) cccccGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt < 1:112307/84‑1 (MQ=255) cccccGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt > 2:112307/1‑84 (MQ=255) ccccGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCAc < 7:26501/149‑1 (MQ=255) | CAGCGTTTGCCCGTCGGCGCTGATATCCATCGCACTGATGGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCAC > NC_002947/2774300‑2774589 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |