New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2774442 = | 46 (0.830) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.6% | coding (1070/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2774487 = | 41 (0.770) | coding (1025/1353 nt) | PP_5521 | hypothetical protein |
GGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAGGCAAAGTGTGG > NC_002947/2774339‑2774617 | ggTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGt > 3:276555/1‑149 (MQ=255) cagttgatcgtcaatgcctgccatttctacagcggtgccacgctggccgtgagggtggcagacctgcacgggctggataccgattactacagccaggaCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTgg > 6:306026‑M1/99‑149 (MQ=255) aGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCTCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTgg < 4:276555/149‑1 (MQ=255) aGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTgg < 1:39044/149‑1 (MQ=255) aaTGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCTCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTaa > 7:157419/1‑149 (MQ=255) ctgcCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCAGCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCg < 6:335298/148‑1 (MQ=255) aaTGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATcc < 4:271294/149‑1 (MQ=255) aTGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCa < 7:18430/149‑1 (MQ=255) acagcggtgccacgctggccgtgagggtggcagacctgcacgggctggataccgattactacagccaggaCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGt < 3:240648‑M1/46‑1 (MQ=255) acagcggtgccacgctggccgtgagggtggcagacctgcacgggctggataccgattactacagccaggaCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTCCACCAGCGGGGTACGCGGGt > 4:240648‑M1/71‑116 (MQ=255) tctTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCg > 8:282047/1‑129 (MQ=255) tctTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCg < 7:282047/129‑1 (MQ=255) aaaCGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCAccc > 5:297378/1‑149 (MQ=255) ccGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACgg > 4:113616/1‑149 (MQ=255) gTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTa < 6:367147/112‑1 (MQ=255) gTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTa > 5:367147/1‑112 (MQ=255) ccATCGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACGCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCGTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCGCGTGCAGGTCTGCCAACCTGACGGCCAGCGTGGc > 8:291798/1‑149 (MQ=255) tAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAAAAAACAGTATACACCCCATTCAAGTAATCCACCCGACCGGCCCGCCTTGCAcc > 1:115109/1‑149 (MQ=255) tCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTg > 7:295981/1‑147 (MQ=255) cccACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCTCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGaa < 8:157419/149‑1 (MQ=255) cccACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCACCGCATACAACCTTGCGCCATCCTCCACCAGCGCGGTACGCGGGTCCTGGCTGAAGTAATCGGt > 6:220531/1‑95 (MQ=255) cccACAATCTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCTGATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGTTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGt < 5:220531/95‑1 (MQ=255) cacaATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt > 3:129149/1‑110 (MQ=255) cacaATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt < 4:129149/110‑1 (MQ=255) aaTGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATggc < 6:297378/149‑1 (MQ=255) aTGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATggca < 3:113616/149‑1 (MQ=255) tACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTAACCAGCCCGAGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCCGCCTGCCACCGCTGTAGAACTggcagg > 8:283975/1‑148 (MQ=255) tCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTgta < 7:296255/74‑1 (MQ=255) tCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCAAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCAtt > 7:187232/1‑149 (MQ=255) tCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCAGGCTgta > 8:296255/1‑74 (MQ=255) gCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGa > 5:112321/1‑149 (MQ=255) gCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGa > 8:297125/1‑149 (MQ=255) cgcgcTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCaa > 5:321894/1‑149 (MQ=255) ccaggacccgcgtaccccgctggtgcaggatggcgcaagggtgtatgcgggTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTg > 6:306026‑M2/52‑149 (MQ=255) cccccGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt > 2:112307/1‑84 (MQ=255) cccccGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGt < 1:112307/84‑1 (MQ=255) ccccGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCAc < 7:26501/149‑1 (MQ=255) acccgcgtaccccgctggtggaggatggcgcaagggtgtatgcgggTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGt > 4:240648‑M2/47‑116 (MQ=255) acccgcgtaccccgctggtgcaggatggcgcaagggtgtatgcgggTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGt < 3:240648‑M2/70‑1 (MQ=255) CATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGgcg < 5:86811‑M1/149‑1 (MQ=255) CATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCAAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGgcg > 8:187232‑M1/1‑149 (MQ=255) aTACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGgcgc < 6:86811/149‑1 (MQ=255) cacCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGt > 6:339057/1‑149 (MQ=255) ccTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGGCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTg > 7:316498/1‑148 (MQ=255) cgcCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACaa < 2:115109/148‑1 (MQ=255) cgcCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAg < 6:112321/149‑1 (MQ=255) tCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACTGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAGGCa > 2:67653/1‑147 (MQ=255) cTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAGGCAAAgt > 2:163242/1‑149 (MQ=255) cACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAGGCAAAGtgtg < 7:297125/149‑1 (MQ=255) aCCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGGCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAGGCAAAGTGTgg < 8:316498/149‑1 (MQ=255) | GGTCGAGCCCAGGTAATGCTGCCAATGCTCCGTACCCTCTTCGCCAAACGCCCGCAGGTAGCCATAGGCATCACCCACAATGTACTCGCCATCGCGCGCTACCCCCGCATACACCCTTGCGCCATCCTGCACCAGCGGGGTACGCGGGTCCTGGCTGTAGTAATCGGTATCCAGCCCGTGCAGGTCTGCCACCCTCACGGCCAGCGTGGCACCGCTGTAGAAATGGCAGGCATTGACGATCAACTGGTCACCGGCGCGGTTGAACAAGGCAAAGTGTGG > NC_002947/2774339‑2774617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |