New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2959898 = | 50 (0.900) | 5 (0.090) | 5/244 | NT | 10.1% | coding (1294/2316 nt) | PP_2590 | ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | 2959939 = | 41 (0.780) | coding (1253/2316 nt) | PP_2590 | ferric siderophore receptor |
GGCAATCAGTGGCCAGGCCTCCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCT > NC_002947/2959752‑2960044 | ggCAATCATGGTCCAGGCCTCCGATACCTTCGGGCCGCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCTAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGc < 8:320243/149‑1 (MQ=255) cAATCAGTGGCCAGGCCACCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCTGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCg < 8:49067/149‑1 (MQ=255) aTCAGTGGCCAGGCCTCCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGaa < 6:124064/149‑1 (MQ=255) tatggcgcggtcggcaccagcaagacggactatcgctacagcggcgcactcacagcaacggtgaacaacagcgccggtgatttcaccaccgcgatgggccagttgcagatggagatccacaagacttcTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGc < 1:136689‑M1/21‑1 (MQ=255) ctacgttACCTTGGGGCCCATGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGTCTCGTGGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTAGTGTGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGTTGCGGAAGGTGTCGAATT‑GGc < 8:149133/143‑1 (MQ=255) cTCCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGc > 2:209127/1‑149 (MQ=255) tCCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑g < 5:151213/146‑1 (MQ=255) tCCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑g > 6:151213/1‑146 (MQ=255) cGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCAc < 2:194997/149‑1 (MQ=255) cTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATg < 4:257843/121‑1 (MQ=255) cTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATg > 3:257843/1‑121 (MQ=255) ttCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGccc > 4:86330/1‑149 (MQ=255) ggCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCAcc > 4:36283/1‑149 (MQ=255) ggCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCAcc > 2:335508/1‑149 (MQ=255) ccAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCgg < 1:335508/149‑1 (MQ=255) gcaagacggactatcgctacagcggcgcactcacagcaacggtgaacaacagcgccggtgatttcaccaccgcgatgggccagttgcagatggagatccacaagacttcTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGc > 1:185993‑M1/110‑149 (MQ=255) caagacggactatcgctacagcggcgcactcacagcaacggtgaacaacagcgccggtgatttcaccaccgcgatgggccagttgcagatggagatccacaagacttcTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCgg < 4:99405‑M1/39‑1 (MQ=255) caagacggactatcgctacagcggcgcactcacagcaacggtgaacaacagcgccggtgatttcaccaccgcgatgggccagttgcagatggagatccacaagacttcTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCgg > 3:99405‑M1/109‑147 (MQ=255) aGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCa < 6:205561/149‑1 (MQ=255) gACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTAGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑gg < 6:320185/127‑1 (MQ=255) gACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTAGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑gg > 5:320185/1‑127 (MQ=255) gacggactatcgctacagcggcgcactcacagcaacggtgaacaacagcgccggtgatttcaccaccgcgatgggccagttgcagatggagatccacaagacttcTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGaa > 2:136689‑M1/106‑149 (MQ=255) aGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAg > 6:243191/1‑146 (MQ=255) aGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGaa < 5:243191/148‑1 (MQ=255) tGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAt < 6:123232/117‑1 (MQ=255) tGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAt > 5:123232/1‑117 (MQ=255) tAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTtgt < 3:240958/148‑1 (MQ=255) tAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTtgt > 4:240958/1‑148 (MQ=255) atTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGAtct > 2:124845/1‑149 (MQ=255) ttGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGAtctc > 1:320681/1‑149 (MQ=255) tcgtcCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATc > 1:138196/1‑149 (MQ=255) gtcCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTg > 4:214678/1‑149 (MQ=255) tcCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTg > 6:267644/1‑148 (MQ=255) cAGTTCGAGCCGGCCGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGATCTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTCATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGACACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTAGTGGATATCCAACTGCaa > 6:322991/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTgg < 2:320681/148‑1 (MQ=255) cggcgcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGTCCCATcgcg < 5:322991/149‑1 (MQ=255) cggcgcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATcgcg < 1:209127/149‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCAt > 8:317542/1‑126 (MQ=255) gcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCAt < 7:317542/126‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCggtgg < 1:124845/149‑1 (MQ=255) gcggcCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAg < 5:244263/90‑1 (MQ=255) gcggcCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAg > 6:244263/1‑90 (MQ=255) cGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCa > 3:7884/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCa > 5:176252/1‑149 (MQ=255) cTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGgcgc < 8:26389/149‑1 (MQ=255) ttttGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGgtggtg > 5:24898/1‑135 (MQ=255) ttttGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGgtggtg < 6:24898/135‑1 (MQ=255) gCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCtgttg > 3:12922/1‑149 (MQ=255) gtgtCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTgttgtt < 3:86330/149‑1 (MQ=255) tCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGTCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCa < 3:214678/148‑1 (MQ=255) gTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTgg > 6:185867/1‑106 (MQ=255) gTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTgg < 5:185867/106‑1 (MQ=255) tACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTg < 5:267644/148‑1 (MQ=255) ggTGGCGTTGCCCGACCATTGGTGGATGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCAATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCtgt > 8:91013/1‑147 (MQ=255) tGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGt > 1:163496/1‑149 (MQ=255) gTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAATGGGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTgcg > 1:249702/1‑149 (MQ=255) gTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTgcgc > 6:279247/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGa < 6:176252/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGa < 2:138196/149‑1 (MQ=255) gATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTc < 2:249702/148‑1 (MQ=255) aTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCt < 3:36283/148‑1 (MQ=255) | GGCAATCAGTGGCCAGGCCTCCGATACCTTCGGGCCCCAGACAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCT > NC_002947/2959752‑2960044 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |