New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2959898 = | 50 (0.900) | 5 (0.090) | 5/244 | NT | 10.1% | coding (1294/2316 nt) | PP_2590 | ferric siderophore receptor |
? | NC_002947 | 2959939 = | 41 (0.780) | coding (1253/2316 nt) | PP_2590 | ferric siderophore receptor |
CAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATAGGCCAGC > NC_002947/2959793‑2960073 | gacggactatcgctacagcggcgcactcacagcaacggtgaacaacagcgccggtgatttcaccaccgcgatgggccagttgcagatggagatccacaagacttcTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGaa > 2:136689‑M1/106‑149 (MQ=255) aGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAg > 6:243191/1‑146 (MQ=255) aGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGaa < 5:243191/148‑1 (MQ=255) tAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTtgt > 4:240958/1‑148 (MQ=255) tAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTtgt < 3:240958/148‑1 (MQ=255) atTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGAtct > 2:124845/1‑149 (MQ=255) ttGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGAtctc > 1:320681/1‑149 (MQ=255) tcgtcCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATc > 1:138196/1‑149 (MQ=255) gtcCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTg > 4:214678/1‑149 (MQ=255) tcCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTg > 6:267644/1‑148 (MQ=255) cAGTTCGAGCCGGCCGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGATCTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTCATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGACACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTAGTGGATATCCAACTGCaa > 6:322991/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTgg < 2:320681/148‑1 (MQ=255) cggcgcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGTCCCATcgcg < 5:322991/149‑1 (MQ=255) cggcgcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATcgcg < 1:209127/149‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCAt < 7:317542/126‑1 (MQ=255) gcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCAt > 8:317542/1‑126 (MQ=255) gcggcgGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCggtgg < 1:124845/149‑1 (MQ=255) cGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCa > 3:7884/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCa > 5:176252/1‑149 (MQ=255) cTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGgcgc < 8:26389/149‑1 (MQ=255) ttttGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGgtggtg > 5:24898/1‑135 (MQ=255) ttttGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGgtggtg < 6:24898/135‑1 (MQ=255) gCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCtgttg > 3:12922/1‑149 (MQ=255) gtgtCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTgttgtt < 3:86330/149‑1 (MQ=255) tCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGTCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCa < 3:214678/148‑1 (MQ=255) gTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTgg > 6:185867/1‑106 (MQ=255) gTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTgg < 5:185867/106‑1 (MQ=255) tACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTg < 5:267644/148‑1 (MQ=255) ggTGGCGTTGCCCGACCATTGGTGGATGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCAATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCtgt > 8:91013/1‑147 (MQ=255) tGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGt > 1:163496/1‑149 (MQ=255) gTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAATGGGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTgcg > 1:249702/1‑149 (MQ=255) gTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTgcgc > 6:279247/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGa < 6:176252/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGa < 2:138196/149‑1 (MQ=255) ttctgccgaggtggggctgcgtggccatttcgacaccttcggcaGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTc > 2:136689‑M2/45‑149 (MQ=255) gATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTc < 2:249702/148‑1 (MQ=255) aTGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCt < 3:36283/148‑1 (MQ=255) gccgaggtggggctgcgtggccatttcgacaccttcggcaGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGc > 1:185993‑M2/41‑149 (MQ=255) ccgaggtggggctgcgtggccatttcgacaccttcggcaGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTg < 4:99405‑M2/108‑1 (MQ=255) ccgaggtggggctgcgtggccatttcgacaccttcggcaGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTg > 3:99405‑M2/40‑147 (MQ=255) GAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTgg > 4:12922‑M1/1‑149 (MQ=255) tgtCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCg < 4:7884/149‑1 (MQ=255) gtCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGa > 4:329948/1‑149 (MQ=255) gccatttcgacaccttcggcaGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATa < 1:136689‑M2/128‑1 (MQ=255) cACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATAg > 4:138049/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCgcgc > 2:64259/1‑141 (MQ=255) gCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCgcgc < 1:64259/141‑1 (MQ=255) cAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATAGGCCa < 7:91013/149‑1 (MQ=255) cAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATAGGCCa < 5:279247/149‑1 (MQ=255) gCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATAGGCCAGc < 3:329948/149‑1 (MQ=255) ccACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGa > 6:363284/1‑107 (MQ=255) ccACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGa < 5:363284/107‑1 (MQ=255) | CAGGGTTGTAGATATTGGTCGTCCAGTTCGAGCCGGCGGCGCGGCGGCCGAAGTCCTTTTGCGTGTCGCTGTACTGGGTGGCGTTGACCGACCATTGGTGGTTGATGCCGAAGGTGTCGAAAT‑GGCCACGCAGCCCCACCTCGGCAGAAGTCTTGTGGATCTCCATCTGCAACTGGCCCATCGCGGTGGTGAAATCACCGGCGCTGTTGTTCACCGTTGCTGTGAGTGCGCCGCTGTAGCGATAGTCCGTCTTGCTGGTGCCGACCGCGCCATAGGCCAGC > NC_002947/2959793‑2960073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |