New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2966245 | 56 (1.010) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.8% | coding (382/1758 nt) | PP_2595 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 2966269 | 55 (1.030) | coding (358/1758 nt) | PP_2595 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
CCCAGGCGTGCGCTGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTGCAGCACCGCTACCGCCAGGCT > NC_002947/2966097‑2966392 | cccAGGCGTGCGCTGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGC < 7:139051‑M1/149‑1 (MQ=255) gCGTGTGCTGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGGTGCTACTGATCA‑AGGGCGTTTGCT‑CATGGGCCGGCa < 4:67293/149‑1 (MQ=255) gcTGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTggg < 8:75037/149‑1 (MQ=255) gcTGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTggg > 6:269712/1‑149 (MQ=255) tGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGc > 6:98096/1‑148 (MQ=255) cagcaCTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTGGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCa > 7:231913/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTGGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTg > 8:231913‑M2/1‑148 (MQ=255) tGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgc < 7:24133‑M2/149‑3 (MQ=255) cagcGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACACGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTggg < 3:206426/149‑1 (MQ=255) agcGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCacgatggctgtggcccaactgccggcccatgtg < 1:256731‑M1/149‑34 (MQ=255) agcGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGt < 5:98096/149‑1 (MQ=255) gcCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCacgatggctgtggcccaactgccggcccatg > 3:119998‑M1/1‑113 (MQ=255) gcCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCacgatggctgtggcccaactgccggcccatg < 4:119998‑M1/144‑32 (MQ=255) gCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCCCCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGATCACCCAGGGCacgatggctgtggcccaactgccggcccatgtgctcacg < 7:189099‑M1/149‑40 (MQ=255) cAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGa < 5:253842/134‑1 (MQ=255) cAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGa > 6:253842/1‑134 (MQ=255) cAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGAGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTgtggga < 5:253847/134‑6 (MQ=255) aGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGC > 6:342917‑M1/1‑98 (MQ=255) aGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGC < 5:342917‑M1/98‑1 (MQ=255) ggCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCcgcg > 6:1943/1‑149 (MQ=255) gACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACACTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCgg > 1:282717/1‑149 (MQ=255) aCAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGgt > 2:180790/1‑149 (MQ=255) aGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgtt < 8:24133/149‑1 (MQ=255) gCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgttg > 7:252569/1‑149 (MQ=255) ccccAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgttgt > 7:173669/1‑149 (MQ=255) cccAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgttgt > 4:115427/1‑148 (MQ=255) cccAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgttgt > 1:295191/1‑148 (MQ=255) ccAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCa < 3:115427/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgcc > 6:363923‑M2/1‑108 (MQ=255) cAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgcc < 5:363923‑M2/111‑4 (MQ=255) cAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAg > 1:116353/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGc < 6:248557/118‑1 (MQ=255) gTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGc > 5:248557/1‑118 (MQ=255) tGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGaacc > 6:32085/1‑148 (MQ=255) aGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGaaccaacc < 8:173669/149‑1 (MQ=255) aGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGaaccaacc > 1:147438/1‑149 (MQ=255) ggATGAACAGCGCAACCAACAGCACCATCGGCGTGACGCTGCTACTTATCACATATCGTGAGCT‑ATTGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGaaccaacc < 1:294682/149‑1 (MQ=255) gATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCa < 6:140134/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTgg < 5:269712/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTg < 2:116353/148‑1 (MQ=255) aaCAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTg < 1:180790/148‑1 (MQ=255) cAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTgg > 3:156725/1‑147 (MQ=255) caaccaacAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCtgt < 5:32085/149‑1 (MQ=255) caacAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACGGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTa > 2:343025/1‑149 (MQ=255) acAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTg > 3:133660/1‑135 (MQ=255) acAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTg < 4:133660/135‑1 (MQ=255) aGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACGGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTg < 1:343025/149‑1 (MQ=255) gcggcgTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCa < 5:54474/107‑1 (MQ=255) gcggcgTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCa > 6:54474/1‑107 (MQ=255) gcggcgTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGcc > 4:131731/1‑148 (MQ=255) gTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAAtgtg < 4:153213/149‑1 (MQ=255) tGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGc < 5:1943/149‑1 (MQ=255) aCGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgtt > 7:234637/1‑95 (MQ=255) aCGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGtgtt < 8:234637/95‑1 (MQ=255) gctgctACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAggg > 2:301672/1‑100 (MQ=255) gctgctACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAggg < 1:301672/100‑1 (MQ=255) gctACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGgtg < 5:102184/88‑1 (MQ=255) gctACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGgtg > 6:102184/1‑88 (MQ=255) aCTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTggcg < 6:57336/144‑1 (MQ=255) aCTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTggcg > 5:57336/1‑144 (MQ=255) aTCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCTGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTg > 5:25767/1‑149 (MQ=255) aTCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTg < 2:147438/149‑1 (MQ=255) tCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTgc < 3:131731/149‑1 (MQ=255) tCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTgc < 8:252569/149‑1 (MQ=255) tCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTgc < 2:295191/149‑1 (MQ=255) aGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATcac > 8:78082/1‑58 (MQ=255) aGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATcac < 7:78082/58‑1 (MQ=255) cGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgccctgggtgatcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggggctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctggggcttgtcgccctgctagcgctgc < 7:189099‑M2/149‑111 (MQ=255) ca‑caTGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCATTCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTGCAGCACCGCTAcc > 1:27577/1‑149 (MQ=255) ca‑caTGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctggggcttgtcgccctgctagcgctgccggcgct < 1:256731‑M2/149‑117 (MQ=255) caTGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctggggcttgtcgccctgctagcgctgccggc > 3:119998‑M2/1‑31 (MQ=255) caTGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTgcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctggggcttgtcgccctgctagcgctgccggc < 4:119998‑M2/144‑114 (MQ=255) ggCacgatggctgtggcccaactgccggcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctg > 6:363923‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCacgatggctgtggcccaactgccggcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctg < 5:363923‑M1/111‑109 (MQ=255) ggCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTGCAGCACCGCTACCGCCAgg < 4:156725/148‑1 (MQ=255) gCacgatggctgtggcccaactgccggcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctggggcttgtcgccctgctagcgctgccggcgctggctgca < 7:24133‑M1/149‑148 (MQ=255) cacgatggctgtggcccaactgccggcccatgtgctcacgcccttgatcagtagcagcgtcacgccgctggtgctgttggttgcgctgttcatcctgcacccgccgctggggcttgtcgccctgccagcgctgccggcgctggctgcag > 8:231913‑M1/1‑1 (MQ=255) | CCCAGGCGTGCGCTGAACAGCAGCACTGCAGCCAGCGCCGGCAGCGCTAGCAGGGCGACAAGCCCCAGCGGCGGGTGCAGGATGAACAGCGCAACCAACAGCACCAGCGGCGTGACGCTGCTACTGATCA‑AGGGCGTGAGCA‑CATGGGCCGGCAGTTGGGCCACAGCCA‑TCGTGCCCTGGGTGATCACATGCCCGAGCCGCGCGGTGTTGTCAGGGGTGAACCAACCCAGTGGCAGCTGTGCTACCTGGGCGCCAATGTGCTGGCGGCCGCCTTGCAGCACCGCTACCGCCAGGCT > NC_002947/2966097‑2966392 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |