New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3522702 = | 60 (1.080) | 5 (0.100) | 5/226 | NT | 11.6% | intergenic (+489/‑208) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
? | NC_002947 | 3522789 = | 23 (0.470) | intergenic (+576/‑121) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
TGGCCGCGGCCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATT > NC_002947/3522554‑3522849 | tGGCCGCGGCCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTGCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTgg > 2:250457/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCGGCCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTgg > 4:272640/1‑149 (MQ=255) ggCCGCGGCCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCCCATGTTCAAAGTGCTggc > 1:215725/1‑149 (MQ=255) cGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTggcccaggccca < 1:65390/149‑1 (MQ=255) gTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCAt < 8:140707/149‑1 (MQ=255) cccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGc > 2:1285/1‑149 (MQ=255) cAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGtt > 7:168596/1‑147 (MQ=255) aTGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGc < 1:244179/149‑1 (MQ=255) gTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAtgt > 7:71688/1‑149 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTgg < 2:61623/120‑1 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTgg > 1:61623/1‑120 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATgg > 4:191321/1‑133 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATgg < 3:191321/133‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCgg > 5:74087/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCgg > 2:258173/1‑149 (MQ=255) aaGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGc < 8:168596/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGt > 3:99365/1‑148 (MQ=255) cAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAtgtg < 1:195518/138‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAtgtg > 2:195518/1‑138 (MQ=255) cAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGtt > 8:257374/1‑147 (MQ=255) aGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGAGGTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCCGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGtt > 1:286397/1‑148 (MQ=255) aGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAg > 8:80229/1‑149 (MQ=255) aGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAg > 5:263118/1‑149 (MQ=255) aGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAg > 1:346882/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGc < 7:257374/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCcgcg > 3:162821/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAt < 8:171538/126‑1 (MQ=255) cccGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAt > 7:171538/1‑126 (MQ=255) cccGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTg < 6:263118/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGt < 4:162821/149‑1 (MQ=255) ccTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTg < 4:99365/149‑1 (MQ=255) ccTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTg < 1:315381/149‑1 (MQ=255) cTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTgg > 8:190929/1‑149 (MQ=255) gACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGACGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGt < 2:313614/139‑1 (MQ=255) gACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGACGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGt > 1:313614/1‑139 (MQ=255) acacCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTCTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGGcac > 5:279412/1‑149 (MQ=255) cacCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTcacc < 2:215725/149‑1 (MQ=255) acCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTcacca > 5:255294/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTg < 7:79238/140‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTg > 8:79238/1‑140 (MQ=255) ccAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACg > 4:303904/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCa < 2:167416/125‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCa > 1:167416/1‑125 (MQ=255) cAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGACGCGGTGCGTTGGTCACCACg > 8:264012/1‑148 (MQ=255) gCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGcac < 6:138870/149‑1 (MQ=255) tcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAgg < 4:53376‑M1/7‑1 (MQ=255) tcggggatcaggtaagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAgg > 3:53376‑M1/85‑91 (MQ=255) cAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGa > 2:37803/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATg < 2:286397/149‑1 (MQ=255) gTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATg < 3:272640/149‑1 (MQ=255) taagcgctttgaatgtggggttcatggagcgcttacgatccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCAt > 6:90154‑M1/73‑149 (MQ=255) gTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCt > 8:164204/1‑149 (MQ=255) gggCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg < 3:303904/148‑1 (MQ=255) gggCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTgg < 6:255294/148‑1 (MQ=255) ggCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGc < 7:164204/149‑1 (MQ=255) gCAGCGGGGCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCTCCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCa < 1:37803/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGc < 7:80229/149‑1 (MQ=255) gggTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCCAGGCCCATGGCATCGGCATgtgc < 7:190929/149‑4 (MQ=255) ggTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACAt < 2:71304/121‑1 (MQ=255) ggTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACAt > 1:71304/1‑121 (MQ=255) ggTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCCAGGCCCATGGCATCGGCATgtgcg < 1:258173/149‑5 (MQ=255) catggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGcc > 1:52420‑M1/51‑125 (MQ=255) catggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGcc < 2:52420‑M1/75‑1 (MQ=255) ggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCAT‑CGGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTcacca < 3:147808‑M1/58‑1 (MQ=255) ggagcgcttacgagccaatgccaggcctgttgcgcctgctggagcatGCCCAGGCCCATGGCAT‑CGGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTcacca > 4:147808‑M1/48‑105 (MQ=255) cGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGc > 5:215589/1‑149 (MQ=255) gCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTc < 1:250457/149‑1 (MQ=255) accaGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGt > 5:362077/1‑148 (MQ=255) tGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCa > 6:259487/1‑149 (MQ=255) ttCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATgg < 3:319391/91‑1 (MQ=255) ttCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATgg > 4:319391/1‑91 (MQ=255) cAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTAGGCGTTAAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCTCTCCATGaa > 8:8814/1‑149 (MQ=255) GCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACAtt > 5:71660‑M1/1‑148 (MQ=255) GCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACAtt < 6:71660‑M1/148‑1 (MQ=255) | TGGCCGCGGCCGTCCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCG‑‑GTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATT > NC_002947/3522554‑3522849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |