New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3664357 = | 42 (0.760) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.8% | coding (247/966 nt) | PP_3228 | aliphatic sulfonate‑binding protein |
? | NC_002947 | 3664409 = | 42 (0.800) | coding (299/966 nt) | PP_3228 | aliphatic sulfonate‑binding protein |
GAAGGGTAACATGCGCGCCCAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAGGGCAAGCGCATCGCGACCGGGCG > NC_002947/3664209‑3664505 | gAAGGGTAACATGCGCGCCCAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGTGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATgcgc < 1:259989/149‑1 (MQ=255) ggTAACATGCGCGCCCAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCAct < 8:329589/149‑1 (MQ=255) ctgcctgggccagcgccttgagcgccaggtggtgcccgatcgaccctcgcccggtcgcgatgcgcttgcccttgagttcggccgcactgcgcagcggcgcctccggccgcaccagcaacgccgtgccataagggtcggacttgtCCAct > 3:189266‑M1/145‑149 (MQ=255) ccAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCActg > 1:358552/1‑136 (MQ=255) ccAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCActg < 2:358552/136‑1 (MQ=255) cAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTgac > 2:317601/1‑147 (MQ=255) gccgccGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAg < 6:53772/148‑1 (MQ=255) ccgccgACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCa > 7:46451/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTc > 1:83946/1‑147 (MQ=255) ccTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAgg > 7:63332/1‑149 (MQ=255) gcgcGACCCGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCa > 4:149838/1‑149 (MQ=255) cTGCCCTACGTCATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCTTCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCGGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGt < 6:294938/149‑1 (MQ=255) cccTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTg < 2:83946/147‑1 (MQ=255) cccggtcgcgatgcgcttgcccttgagttcggccgcactgcgcagcggcgcctccggccgcaccagcaacgccgtgccataagggtcggacttgtCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGa < 7:333080‑M1/53‑1 (MQ=255) cTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAg > 3:233841/1‑133 (MQ=255) cTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAg < 4:233841/133‑1 (MQ=255) cggtcgcgatgcgcttgcccttgagttcggccgcactgcgcagcggcgcctccggccgcaccagcaacgccgtgccataagggtcggacttgtCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACaa > 8:232635‑M1/94‑149 (MQ=255) gtcgcgatgcgcttgcccttgagttcggccgcactgcgcagcggcgcctccggccgcaccagcaacgccgtgccataagggtctgacttgtCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGt > 8:333080‑M1/92‑149 (MQ=255) gACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCTCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTc < 3:334775/149‑1 (MQ=255) cGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGTATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGc < 8:272697/104‑1 (MQ=255) cGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGTATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGc > 7:272697/1‑104 (MQ=255) gCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGc > 4:108224/1‑99 (MQ=255) gCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGc < 3:108224/99‑1 (MQ=255) gggCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTAt < 8:46451/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGAc < 8:166197/132‑1 (MQ=255) ccTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGAc > 7:166197/1‑132 (MQ=255) ccgccgCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTg > 2:198432/1‑149 (MQ=255) ccgccgCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGACCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGc < 1:317601/147‑1 (MQ=255) gccgcgccgcTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGCCCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGt > 6:44992/1‑149 (MQ=255) gcTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCgg < 3:149838/149‑1 (MQ=255) tGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTg > 6:70983/1‑137 (MQ=255) tGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTg < 5:70983/137‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGgc > 7:78664/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATCCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTGCGTGCGGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAg < 4:173437/147‑1 (MQ=255) cGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGgcgc > 8:320439/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTg < 8:78664/149‑1 (MQ=255) gggCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGcc < 8:63332/149‑1 (MQ=255) ggCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGcc > 2:191928/1‑148 (MQ=255) cgatcgatGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGaa < 7:320439/149‑1 (MQ=255) atcgatGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACt > 6:89507/1‑149 (MQ=255) atGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAg > 1:205042/1‑149 (MQ=255) gCCGGCATCAACGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAggg > 6:193098/1‑149 (MQ=255) ggCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGc > 8:221255/1‑134 (MQ=255) ggCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGc < 7:221255/134‑1 (MQ=255) cataatCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAGGGCAAgc > 6:69716/1‑149 (MQ=255) tcGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGAACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTAAGACCCTTATGGCAAGGCGTTGCTGGTGCGGCAGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTAAAGGGCAAGCGCATc > 3:206651/1‑149 (MQ=255) gCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAGGGCAAgcg > 2:355770/1‑142 (MQ=255) gCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAGGGCAAgcg < 1:355770/142‑1 (MQ=255) gcCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGt > 8:164554/1‑87 (MQ=255) gcCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGt < 7:164554/87‑1 (MQ=255) gcCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAGGGCAAGCGCATCGCGACCGGGc > 6:347606/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCGGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCGCCGGTCAAGGCCATGGCAGTGGAGAAGTCCGACGCGTATGGCGCGGCGGTGGTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGGGCGGCGGTGCTCAGGGGCATGCGCATCGCGGCCGGGCg > 8:313139/1‑149 (MQ=255) | GAAGGGTAACATGCGCGCCCAGCTGGAGGCCGCCGACGCCCTGCGCGACCTGCCCTACGACATCCGCTGGGCCGAGTTCCCTGCCGCCGCGCCGCTGGCCGAGGCGCTCAACGCTGGGGCGATCGATGCCGGCATCATCGGCGATGCGCCACTGCTGTTCGTGCTGGCCTCCGGAGCACCGGTCAAGGCCATCGCAGTGGACAAGTCCGACCCTTATGGCACGGCGTTGCTGGTGCGGCCGGAGGCGCCGCTGCGCAGTGCGGCCGAACTCAAGGGCAAGCGCATCGCGACCGGGCG > NC_002947/3664209‑3664505 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |