New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3767345 | 38 (0.690) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 7.4% | coding (778/1290 nt) | PP_3329 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 3767379 | 39 (0.740) | coding (812/1290 nt) | PP_3329 | membrane protein |
AGACCGGCTATGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTTCTCCAGCGGTAAATGA > NC_002947/3767199‑3767490 | aGACCGGCTATGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCat < 6:220055‑M1/149‑3 (MQ=255) gACCGGCTATGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGc > 4:279074/1‑149 (MQ=255) ggCTATGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGa < 1:142459/149‑1 (MQ=255) ggCTATGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGa < 2:37699/149‑1 (MQ=255) tGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCt < 2:307500/141‑1 (MQ=255) tGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCt > 1:307500/1‑141 (MQ=255) tACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACt < 5:357583/149‑1 (MQ=255) gCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGgcg > 3:30483/1‑149 (MQ=255) caTCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTg > 1:284487/1‑143 (MQ=255) caTCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTg < 2:284487/143‑1 (MQ=255) tCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTg < 2:121390/149‑1 (MQ=255) tCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATc < 4:83154/149‑1 (MQ=255) cTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGaca > 2:259691/1‑130 (MQ=255) cTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATc > 1:313663/1‑147 (MQ=255) cTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATc < 2:313663/147‑1 (MQ=255) aGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCatctcgatgtccagcgcgccagtgtcatcgagcggctcgc < 6:296609‑M1/149‑41 (MQ=255) aaGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCatctcgatgtccagcgcgccagtgtcatcgagcggctcgcca < 8:155673‑M1/148‑43 (MQ=255) aaGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCatctcgatgtccagcgcgccagtgtcatcgagcggctcgcca > 7:155673‑M1/1‑106 (MQ=255) aTTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGt < 3:279074/149‑1 (MQ=255) gcgcACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCGGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCg < 2:313308/149‑1 (MQ=255) cGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCa < 7:106121/149‑1 (MQ=255) gagaTTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAg < 5:135120/149‑1 (MQ=255) tttCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCg > 3:320587/1‑149 (MQ=255) ttCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCg < 4:30483/148‑1 (MQ=255) aGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGAcc > 6:324643/1‑149 (MQ=255) tGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCg > 2:276922/1‑149 (MQ=255) cTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGt > 8:44909/1‑122 (MQ=255) cTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGt < 7:44909/122‑1 (MQ=255) gAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCATGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGtgttgt > 3:122121/1‑148 (MQ=255) gggTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCag < 5:324643/149‑1 (MQ=255) ggtggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGa < 1:134474/83‑1 (MQ=255) ggtggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGa > 2:134474/1‑83 (MQ=255) gtggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATc < 2:163817/147‑1 (MQ=255) gtggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATc > 1:163817/1‑147 (MQ=255) tggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTTGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCTcc > 4:195197/1‑149 (MQ=255) tggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGTATCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCg < 1:209171/132‑1 (MQ=255) tggtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCtttag > 2:209171/1‑129 (MQ=255) gtggCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTc > 2:106414/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCtt > 3:208430/1‑148 (MQ=255) gCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTtctc < 2:53540/148‑1 (MQ=255) gCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTtctc < 4:173932/148‑1 (MQ=255) gCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTTCTcc > 1:167260/1‑149 (MQ=255) ccGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTtctc > 2:187395/1‑147 (MQ=255) aaTGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTTCTCCAGCgg < 4:320587/148‑1 (MQ=255) aaTGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTTCTCCAGCGGt < 2:167260/149‑1 (MQ=255) tGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATgctcgccattcacggccaaggcccgtgccaccaccataccctcatgtacaaaggtgccaggcagaacttcgaggaaaattcgaatctcggtgcgcgttgcaatctt > 7:155673‑M2/1‑42 (MQ=255) tGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATgctcgccattcacggccaaggcccgtgccaccaccataccctcatgtacaaaggtgccaggcagaacttcgaggaaaattcgaatctcggtgcgcgttgcaatctt < 8:155673‑M2/148‑107 (MQ=255) gCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATgctcgccattcacggccaaggcccgtgccaccaccataccctcatgtacaaaggtgccaggcagaacttcgaggaaaattcgaatctcggtgcgcgttgcaatcttgct < 6:296609‑M2/149‑110 (MQ=255) gAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTTCTCCAGCGGTAAATGa > 7:90762/1‑149 (MQ=255) | AGACCGGCTATGTACAGCACATCGATGTCCTCACGCTGAGCAAGATTGCAACGCGCACCGAGATTCGAATTTTCCTCGAAGTTCTGCCTGGCACCTTTGTACATGAGGGTATGGTGGTGGCACGGGCCTTGGCCGTGAATGGCGAGCCGCTCGATGACACTGGCGCGCTGGACATCGAGATGCTCGCTGCCGTGACCGTCGGCCTCAGGAGAACGT‑TCGAGCATGACCCGCGCTTCGGGCTTTCGGTGTTGTCAGAGATCGCCTCGCGAGCGCTTTCTCCAGCGGTAAATGA > NC_002947/3767199‑3767490 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |