New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3864820 | 51 (0.920) | 5 (0.100) | 4/236 | NT | 9.5% | coding (825/1320 nt) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
? | NC_002947 | = 3864855 | 48 (0.940) | coding (790/1320 nt) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
TGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGC > NC_002947/3864680‑3864967 | tGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTgg > 1:256881/1‑148 (MQ=255) cccGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggca < 5:340425/148‑1 (MQ=255) cccGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTgg < 1:58541/146‑1 (MQ=255) gATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatggg > 3:180236/1‑149 (MQ=255) aTCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCg < 5:61723/136‑1 (MQ=255) aTCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCg > 6:61723/1‑136 (MQ=255) tCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatg < 3:280328/149‑1 (MQ=255) tCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatg > 1:198286/1‑149 (MQ=255) gACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatgggc > 1:205927/1‑149 (MQ=255) cTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑AGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑Ct > 6:361686/1‑149 (MQ=255) tGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑Ctt > 4:206490/1‑149 (MQ=255) aCCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCt < 4:79001/148‑1 (MQ=255) ccGCGTCGTTACTGGTCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGTTTAGCTTCACGGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCGCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTGTGCACCGAGCTTGCATGGGCGGCTTGGGCGGCG‑CTTTGCTgt < 3:107843/149‑2 (MQ=255) ccGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGg > 3:206490‑M2/1‑148 (MQ=255) cgcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGgg < 7:177897‑M2/149‑3 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 5:203449‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 5:361686‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 4:180236‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 8:110762‑M2/1‑146 (MQ=255) cgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtg < 3:273737‑M2/149‑5 (MQ=255) aTACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagac > 7:137755‑M1/1‑105 (MQ=255) aTACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagac < 8:137755‑M1/149‑45 (MQ=255) aTACTGCGCGCAGCGTCGATAAGCTCCTCGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagac < 6:185824‑M1/149‑45 (MQ=255) tACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagacc > 1:150898‑M2/1‑139 (MQ=255) gcgcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCAGGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGAAGGCAACGGTATGCACCGAGATGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGTTGCAGACCTGa > 1:277292/1‑149 (MQ=255) cgcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGa < 2:256881/147‑1 (MQ=255) gcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg > 2:68624/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGAt < 3:302033/149‑1 (MQ=255) gtTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg < 5:329584/139‑1 (MQ=255) gtTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg > 6:329584/1‑139 (MQ=255) tCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCaaa > 1:40482/1‑149 (MQ=255) cTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACt < 2:205927/149‑1 (MQ=255) ggAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACtt < 4:273737/147‑1 (MQ=255) ggAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGa < 2:277292/149‑1 (MQ=255) gAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGAc < 2:198286/149‑1 (MQ=255) tCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACt > 5:214895/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACttt > 2:9707/1‑149 (MQ=255) gCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatgg < 2:311749/89‑1 (MQ=255) gCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTggcatgggcggcatgg > 1:311749/1‑89 (MQ=255) gCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 6:165096‑M2/1‑103 (MQ=255) gCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt < 5:165096‑M2/106‑4 (MQ=255) cTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACtt < 5:194891/146‑1 (MQ=255) tCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTc < 8:59495/125‑1 (MQ=255) tCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTc > 7:59495/1‑125 (MQ=255) gATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGca > 4:332271/1‑147 (MQ=255) ccTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcgg > 2:191943/1‑149 (MQ=255) cTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc < 8:177897/149‑1 (MQ=255) cTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc > 7:256490/1‑149 (MQ=255) cTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc > 4:348773/1‑149 (MQ=255) gCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGccc > 8:336656/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCtt < 5:45266/149‑1 (MQ=255) gc‑tgcACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCTTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAAc < 5:177270/116‑1 (MQ=255) gc‑tgcACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAAc > 6:177270/1‑116 (MQ=255) caccacTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgc < 2:92751‑M1/83‑41 (MQ=255) caccacTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgc > 1:92751‑M1/1‑43 (MQ=255) ccacTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATc < 3:332271/149‑1 (MQ=255) ggTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGt < 8:256490/149‑1 (MQ=255) cccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGAt < 6:80685/86‑1 (MQ=255) cccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGAt > 5:80685/1‑86 (MQ=255) acgctGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTagga < 7:241310/145‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTaggag < 1:191943/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTaggag > 5:60706/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTaggcgg > 8:195808/1‑149 (MQ=255) cATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACg < 1:68624/149‑1 (MQ=255) aTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCt > 3:21362/1‑107 (MQ=255) aTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCt < 4:21362/107‑1 (MQ=255) aTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACgg > 4:191663/1‑149 (MQ=255) ggTCTGCACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagta > 1:150898‑M1/1‑10 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGTCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCt > 1:59450/1‑149 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttccgaggagcttatcgacgctgcgcgcagtat < 6:185824‑M2/149‑106 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtat > 7:137755‑M2/1‑44 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtat < 8:137755‑M2/149‑106 (MQ=255) gCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtg > 1:92751‑M2/1‑40 (MQ=255) gCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtg < 2:92751‑M2/83‑44 (MQ=255) cACCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacg < 3:273737‑M1/149‑146 (MQ=255) aCCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacgc > 8:110762‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacgc > 5:203449‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacgc > 4:180236‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacgc > 5:361686‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagc > 6:165096‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCcagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagc < 5:165096‑M1/106‑104 (MQ=255) aCCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTg > 6:168736/1‑149 (MQ=255) aCCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTg > 6:243870/1‑149 (MQ=255) cccagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacgcg < 7:177897‑M1/149‑148 (MQ=255) ccGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGc < 7:336656/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGc > 8:55345/1‑149 (MQ=255) ccagcaaagcgccgcccatgccgcccatgccagctcggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtatcgacgcgg > 3:206490‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGCCCGATCACATCCGACTGCCTGTTTACCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGGAGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGC > NC_002947/3864680‑3864967 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |