New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3864820 | 51 (0.920) | 5 (0.100) | 4/236 | NT | 9.5% | coding (825/1320 nt) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
? | NC_002947 | = 3864855 | 48 (0.940) | coding (790/1320 nt) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
CCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAGCGGTGCGAGTGGTATTC > NC_002947/3864708‑3865002 | ccGCGTCGTTACTGGTCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGTTTAGCTTCACGGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCGCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTGTGCACCGAGCTTGCATGGGCGGCTTGGGCGGCG‑CTTTGCTgt < 3:107843/149‑2 (MQ=255) ccGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGg > 3:206490‑M2/1‑148 (MQ=255) cgcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGgg < 7:177897‑M2/149‑3 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 5:361686‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 4:180236‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 5:203449‑M2/1‑146 (MQ=255) gcgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 8:110762‑M2/1‑146 (MQ=255) cgTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtg < 3:273737‑M2/149‑5 (MQ=255) tACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagacc > 1:150898‑M2/1‑139 (MQ=255) gcgcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGCAGGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGAAGGCAACGGTATGCACCGAGATGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGTTGCAGACCTGa > 1:277292/1‑149 (MQ=255) cgcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGa < 2:256881/147‑1 (MQ=255) gcgcAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg > 2:68624/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGAt < 3:302033/149‑1 (MQ=255) gtTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg > 6:329584/1‑139 (MQ=255) gtTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATgg < 5:329584/139‑1 (MQ=255) tCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCaaa > 1:40482/1‑149 (MQ=255) cTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACt < 2:205927/149‑1 (MQ=255) ggAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACtt < 4:273737/147‑1 (MQ=255) ggAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGa < 2:277292/149‑1 (MQ=255) gAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGAc < 2:198286/149‑1 (MQ=255) tCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACt > 5:214895/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACttt > 2:9707/1‑149 (MQ=255) gCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt > 6:165096‑M2/1‑103 (MQ=255) gCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggt < 5:165096‑M2/106‑4 (MQ=255) cTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACtt < 5:194891/146‑1 (MQ=255) tCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTc < 8:59495/125‑1 (MQ=255) tCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTc > 7:59495/1‑125 (MQ=255) gATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGca > 4:332271/1‑147 (MQ=255) ccTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcgg > 2:191943/1‑149 (MQ=255) cTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc < 8:177897/149‑1 (MQ=255) cTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc > 7:256490/1‑149 (MQ=255) cTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAggcggc > 4:348773/1‑149 (MQ=255) gCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGccc > 8:336656/1‑149 (MQ=255) aCCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCtt < 5:45266/149‑1 (MQ=255) gc‑tgcACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCTTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAAc < 5:177270/116‑1 (MQ=255) gc‑tgcACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAAc > 6:177270/1‑116 (MQ=255) ccacTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATc < 3:332271/149‑1 (MQ=255) ggTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGt < 8:256490/149‑1 (MQ=255) cccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGAt < 6:80685/86‑1 (MQ=255) cccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGAt > 5:80685/1‑86 (MQ=255) acgctGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTagg‑a < 7:241310/145‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTagg‑ag < 1:191943/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTagg‑ag > 5:60706/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTagg‑cgg > 8:195808/1‑149 (MQ=255) cATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACg < 1:68624/149‑1 (MQ=255) aTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCt < 4:21362/107‑1 (MQ=255) aTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCt > 3:21362/1‑107 (MQ=255) aTCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACgg > 4:191663/1‑149 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCGTCTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCt > 1:59450/1‑149 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttccgaggagcttatcgacgctgcgcgcagtat < 6:185824‑M2/149‑106 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtat < 8:137755‑M2/149‑106 (MQ=255) gTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtgcagcaggcggtgcaggtaatcgagcagatttcccaggagcttaacgacgctgcgcgcagtat > 7:137755‑M2/1‑44 (MQ=255) gCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtg > 1:92751‑M2/1‑40 (MQ=255) gCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGggtgcagaccgatgcctgcgcgcgcaaggggaccgaagtggtg < 2:92751‑M2/83‑44 (MQ=255) aCCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTg > 6:243870/1‑149 (MQ=255) aCCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTg > 6:168736/1‑149 (MQ=255) ccGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGc < 7:336656/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGc > 8:55345/1‑149 (MQ=255) cgtggtGGGATGGGGGGGATGGGCGGCG‑CTTTTCTGGGTGGAGAACTGATGGGGGATGGCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACACGCGGCCCTTGCTTTCGAAGATCGGGTTGTAGGTGGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGc < 1:9707/144‑1 (MQ=255) gcatgggcggcatgggcgGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGAc < 5:168736/149‑1 (MQ=255) gcatgggcggcatgggcgGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGAc < 3:348773/149‑1 (MQ=255) cggcatgggcggcG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTc > 4:244110/1‑148 (MQ=255) catgggcggcG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAg < 2:40482/149‑1 (MQ=255) catgggcggcG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTCCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAAAGGTCTGGCCCTGGTTTTTGACTCGTTCGAAg > 4:221377/1‑149 (MQ=255) atgggcggcG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCATACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAGc < 3:221377/149‑1 (MQ=255) g‑cTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCGCAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAGCGGTGCGAGt < 6:214895/149‑1 (MQ=255) cTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTTGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAg < 6:258220/133‑1 (MQ=255) cTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAg > 5:258220/1‑133 (MQ=255) tGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAGCGGTGCGAGTGGTATTc > 3:127045/1‑149 (MQ=255) | CCGCGTCGATACTGCGCGCAGCGTCGTTAAGCTCCTGGGAAATCTGCTCGATTACCTGCACCGCCTGC‑TGCACCACTTCGGTCCCCTTGCGCGCGCAGGCATCGGTCTGCACCGAGCTGGCATGGGCGGCATGGGCGGCG‑CTTTGCTGGGTGCAGACCTGATGGGTGATGTCGCTGGCAAACTTGACCACTTTGCACAGGCGGCCCTTGCTGTCGAAGATCGGGTTGTAGG‑AGGCCTCCAGAAAAACGGTCTGGCCCTGCTTGTTGACGCGTTCGAAGCGGTGCGAGTGGTATTC > NC_002947/3864708‑3865002 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |