New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3940056 = | 63 (1.140) | 4 (0.080) | 3/242 | NT | 6.2% | coding (219/414 nt) | csgF | curli secretion/assembly outer membrane associated protein |
? | NC_002947 | 3940101 = | 61 (1.170) | coding (174/414 nt) | csgF | curli secretion/assembly outer membrane associated protein |
ACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACAC > NC_002947/3939909‑3940199 | aCGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCt > 4:126394/1‑149 (MQ=255) cgcctgcctgctggccagcgcctgtgctgcccaggccaccgagctggtgtacaccccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCa > 4:137193‑M1/146‑149 (MQ=255) gcctgcctgctggccagcgcctgtgctgcccaggccaccgagctggtgtacaccccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTc < 8:252047‑M1/3‑1 (MQ=255) aTCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCaa < 1:152769/149‑1 (MQ=255) ggTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAggg < 2:23175/149‑1 (MQ=255) tGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGcc < 3:126394/148‑1 (MQ=255) cTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAg > 1:189750/1‑148 (MQ=255) aaGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTaaa < 2:134918/149‑1 (MQ=255) aaGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTa > 1:319078/1‑147 (MQ=255) cccGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGcc > 7:187385/1‑148 (MQ=255) cccGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGcc > 1:217662/1‑148 (MQ=255) ctgcccaggccaccgagctggtgtacaccccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGACCGTG‑‑‑CCAGTAAAGGCCGAGGc > 7:318398‑M1/120‑149 (MQ=255) ccGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGcc > 7:184247/1‑147 (MQ=255) ggAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGTCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAgg < 6:368448/149‑1 (MQ=255) aaTCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGACCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCa < 1:11013/149‑1 (MQ=255) cgatgacgtcgatgaGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGAGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGAGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑cc > 5:256426/1‑149 (MQ=255) tgacgtcgatgaGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCtt > 4:82431/1‑148 (MQ=255) agctggtgtacaccccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAg > 5:157828‑M1/105‑149 (MQ=255) tcgatgaGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGc > 5:278499/1‑118 (MQ=255) tcgatgaCAAACGCAACGGTCGCCATGCTGCCTGTGTTGCCGTGGCTTATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACTTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGc < 6:278499/118‑1 (MQ=255) cgatgaGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTcc > 6:4283/1‑149 (MQ=255) accccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGa > 2:190283‑M1/94‑137 (MQ=255) accccggtcaacccggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGa < 1:190283‑M1/44‑1 (MQ=255) aaaCGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGgtcgt > 7:134892/1‑149 (MQ=255) aaccctgcGGTCGCCATGCTGCCGTTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCTACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGgtcgtc < 2:319078/142‑1 (MQ=255) aCGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGtcgtcg < 8:187385/149‑1 (MQ=255) gCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTa < 6:226550/149‑1 (MQ=255) tCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTc > 3:266584/1‑149 (MQ=255) tCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTc > 3:94421/1‑149 (MQ=255) gTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGtcgtcg < 1:243183/141‑1 (MQ=255) gTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGtcgtcg > 2:243183/1‑141 (MQ=255) tCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTc < 2:189750/149‑1 (MQ=255) gCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAGGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTg > 2:59371/1‑149 (MQ=255) gCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTg < 8:184247/149‑1 (MQ=255) cggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCt < 8:23240‑M1/2‑1 (MQ=255) cggcctttggcggcaacccgttgaacggcacctggctgctgaacaacgcccaggcgcagaacgactacgacgacccggacCt > 7:23240‑M1/81‑82 (MQ=255) cATGCTGCCGGTGTTGACGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTgcg > 6:308357/1‑149 (MQ=255) gcCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTggg < 2:217662/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCg < 6:118973/112‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCg > 5:118973/1‑112 (MQ=255) ccGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcag > 7:324471/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagca < 4:94421/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagca < 4:266584/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcag > 7:194989/1‑147 (MQ=255) ttGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagcag < 8:137025/149‑1 (MQ=255) cTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCagcagc > 6:44082/1‑147 (MQ=255) tGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 5:4283/149‑1 (MQ=255) gATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCgttg < 8:218194/136‑1 (MQ=255) gATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCgttg > 7:218194/1‑136 (MQ=255) aTGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 8:134892/147‑1 (MQ=255) gttgtCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 5:65117/145‑1 (MQ=255) gttgtCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg > 6:65117/1‑145 (MQ=255) cTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGt < 8:194989/149‑1 (MQ=255) cTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGt > 7:153003/1‑149 (MQ=255) gACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc > 1:321754/1‑149 (MQ=255) gACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc > 4:282071/1‑149 (MQ=255) acaacaTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAACGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGGGGACGTAGTCTTTATGCGCCGGGGCGTTGTTAAGACGCCGGGTCCCGTTC‑ACCGGGTTgccg > 7:126107/1‑149 (MQ=255) gcgACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagc < 7:96031/113‑1 (MQ=255) gcgACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagc > 8:96031/1‑113 (MQ=255) tCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGtt > 2:173473/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGtt > 7:78692/1‑148 (MQ=255) gCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGAcc > 7:275985/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCTGATGCGCTCAAGGGCGGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCTGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGTCGCCAAAGGCCGGGTTGACCg < 6:256426/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTGCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCggg > 1:268821/1‑149 (MQ=255) tttcTGAAGCGCTCACGGGCCGTGGTGCCAGTAACGGCCGTGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgt < 2:321754/146‑1 (MQ=255) ttGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGGTGTGCGAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgt < 8:153003/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgtg < 8:324471/148‑1 (MQ=255) cTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAGGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgtgt < 1:59371/149‑1 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc > 7:292287/1‑121 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc < 8:292287/121‑1 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTa > 3:182023/1‑148 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTa > 2:312679/1‑148 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTa > 1:110429/1‑148 (MQ=255) aaGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTacac < 3:82431/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTac < 4:182023/147‑1 (MQ=255) | ACGATCGGTGACCTTGATGCTCAAGGCCCCGGAATCGTCGATGACGTCGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACAC > NC_002947/3939909‑3940199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |