| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3940056 = | 63 (1.140) | 4 (0.080) | 3/242 | NT | 6.2% | coding (219/414 nt) | csgF | curli secretion/assembly outer membrane associated protein |
| ? | NC_002947 | 3940101 = | 61 (1.170) | coding (174/414 nt) | csgF | curli secretion/assembly outer membrane associated protein | |||||
CGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAA > NC_002947/3939956‑3940249 | cgatgaGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTcc > 6:4283/1‑149 (MQ=255) aaaCGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGgtcgt > 7:134892/1‑149 (MQ=255) aaccctgcGGTCGCCATGCTGCCGTTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCTACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGgtcgtc < 2:319078/142‑1 (MQ=255) aCGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGtcgtcg < 8:187385/149‑1 (MQ=255) gCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTa < 6:226550/149‑1 (MQ=255) tCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTc > 3:94421/1‑149 (MQ=255) tCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTc > 3:266584/1‑149 (MQ=255) gTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGtcgtcg < 1:243183/141‑1 (MQ=255) gTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGtcgtcg > 2:243183/1‑141 (MQ=255) tCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTc < 2:189750/149‑1 (MQ=255) gCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAGGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTg > 2:59371/1‑149 (MQ=255) gCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTg < 8:184247/149‑1 (MQ=255) cATGCTGCCGGTGTTGACGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTgcg > 6:308357/1‑149 (MQ=255) gcCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTggg < 2:217662/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCg < 6:118973/112‑1 (MQ=255) ccGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCg > 5:118973/1‑112 (MQ=255) ccGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcag > 7:324471/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagca < 4:266584/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagca < 4:94421/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcag > 7:194989/1‑147 (MQ=255) ttGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagcag < 8:137025/149‑1 (MQ=255) cTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCagcagc > 6:44082/1‑147 (MQ=255) tGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 5:4283/149‑1 (MQ=255) gATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCgttg > 7:218194/1‑136 (MQ=255) gATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCgttg < 8:218194/136‑1 (MQ=255) aTGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 8:134892/147‑1 (MQ=255) gttgtCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg > 6:65117/1‑145 (MQ=255) gttgtCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAg < 5:65117/145‑1 (MQ=255) cTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGt > 7:153003/1‑149 (MQ=255) cTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGt < 8:194989/149‑1 (MQ=255) gACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc > 1:321754/1‑149 (MQ=255) gACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc > 4:282071/1‑149 (MQ=255) acaacaTCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAACGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGGGGACGTAGTCTTTATGCGCCGGGGCGTTGTTAAGACGCCGGGTCCCGTTC‑ACCGGGTTgccg > 7:126107/1‑149 (MQ=255) gcgACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagc < 7:96031/113‑1 (MQ=255) gcgACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTcagc > 8:96031/1‑113 (MQ=255) tCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGtt > 2:173473/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGtt > 7:78692/1‑148 (MQ=255) gCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGAcc > 7:275985/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCTGATGCGCTCAAGGGCGGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCTGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGTCGCCAAAGGCCGGGTTGACCg < 6:256426/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGTGCCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCggg > 1:268821/1‑149 (MQ=255) tttcTGAAGCGCTCACGGGCCGTGGTGCCAGTAACGGCCGTGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgt < 2:321754/146‑1 (MQ=255) ttGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGGTGTGCGAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgt < 8:153003/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgtg < 8:324471/148‑1 (MQ=255) cTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAGGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTCAAACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgtgt < 1:59371/149‑1 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc > 7:292287/1‑121 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTgcc < 8:292287/121‑1 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTa > 3:182023/1‑148 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTa > 2:312679/1‑148 (MQ=255) tGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTa > 1:110429/1‑148 (MQ=255) aaGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTacac < 3:82431/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTac < 4:182023/147‑1 (MQ=255) ctcaaggaccgtgcctcggcctttactggcaccacggcccttgagGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCt > 5:157828‑M2/46‑149 (MQ=255) TCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTc < 5:334279‑M1/149‑1 (MQ=255) tcaaggaccgtgcctcggcctttactggcaccacggcccttgagGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgt > 2:190283‑M2/45‑137 (MQ=255) tcaaggaccgtgcctcggcctttactggcaccacggcccttgagGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGgt < 1:190283‑M2/93‑1 (MQ=255) AAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCCGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCgg < 1:349300‑M1/149‑1 (MQ=255) AGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGt < 2:208198‑M1/149‑1 (MQ=255) AGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGt < 7:252047‑M1/149‑1 (MQ=255) GGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTg > 3:253215‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGc < 2:268821/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGc > 1:279761/1‑149 (MQ=255) ccGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGcc > 4:152785/1‑149 (MQ=255) tggtgCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTgg < 1:208198/149‑1 (MQ=255) gtgCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTtgg < 5:308357/148‑1 (MQ=255) gcctcggcctttactggcacggtccttgagGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGgcag > 7:318398‑M2/31‑149 (MQ=255) gTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGgcagca > 2:234058/1‑147 (MQ=255) ctgCCGAGGCACGGT‑CCGTGCGGGCCGGGTCTTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAATGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGCGCAGCACAGgcg < 8:126107/147‑1 (MQ=255) aGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGgc < 8:275985/148‑1 (MQ=255) gCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCt < 2:110429/149‑1 (MQ=255) gCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCt > 4:349080/1‑149 (MQ=255) ccGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTg < 1:173473/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGGCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTg < 3:282071/149‑1 (MQ=255) gCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCcag < 8:78692/149‑1 (MQ=255) aCGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCcag > 3:103080/1‑147 (MQ=255) tgagGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAggcg > 4:137193‑M2/5‑149 (MQ=255) gagGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCaggcaggc < 8:252047‑M2/144‑1 (MQ=255) agGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCg > 7:23240‑M2/3‑82 (MQ=255) agGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCg < 8:23240‑M2/80‑1 (MQ=255) gTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCcagca > 3:41606/1‑137 (MQ=255) gTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCcagca < 4:41606/137‑1 (MQ=255) gTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCaa > 4:293465/1‑149 (MQ=255) | CGATGAGAAACGCATCGGTCGCCATGCTGCCGGTGTTGCCGTTGCTGATGTTGTCCAGCAACTGCGACAACATCCGCGACTCCAGCTGGTTGCTGAAGCGCTCAAGGGCCGTGGTGCCAGTAAAGGCCGAGGCACGGT‑CCTTGAGGTCCGGGTCGTCGTAGTCGTTCTGCGCCTGGGCGTTGTTCAGCAGCCAGGTGCCGTTC‑AACGGGTTGCCGCCAAAGGCCGGGTTGACCGGGGTGTACACCAGCTCGGTGGCCTGGGCAGCACAGGCGCTGGCCAGCAGGCAGGCGGCAA > NC_002947/3939956‑3940249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |