New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4282722 | 57 (1.030) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 7.3% | coding (508/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4282759 | 48 (0.930) | coding (471/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator |
GTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGC > NC_002947/4282575‑4282870 | gTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCCGGCGg < 6:2705‑M1/149‑2 (MQ=255) gCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGAAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGa > 5:47846/1‑149 (MQ=255) cACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGCTTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGgcgc < 1:102891/148‑1 (MQ=255) cgcAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACcgc > 2:263752/1‑149 (MQ=255) gAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGc < 8:333988/149‑1 (MQ=255) gAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGc > 2:326389/1‑149 (MQ=255) ccgTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCCCCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGGCCGGCCCCCACAGCAGCAAGGCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTcc < 6:196131/147‑1 (MQ=255) aGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTcc > 7:9042/1‑149 (MQ=255) gTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCCCAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGt < 1:263752/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGAt < 6:249750/149‑1 (MQ=255) cccGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATgg < 4:210091/147‑1 (MQ=255) ccGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGTG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATg > 7:291329/1‑145 (MQ=255) ccGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGTG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATg < 8:291329/145‑1 (MQ=255) gATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATc > 8:27425/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATcc > 2:289770/1‑149 (MQ=255) cTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc < 5:143905‑M2/149‑2 (MQ=255) gcagcaCCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCATGTCGTCTTCCTGTGACGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATcc < 1:261909/144‑1 (MQ=255) gCACCACCGGCAGGATCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCAAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGACGATGGCAATcc > 2:261909/1‑144 (MQ=255) caccacCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgc > 6:143905‑M2/1‑145 (MQ=255) accaccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgccc > 4:291388‑M2/1‑144 (MQ=255) ccaccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccg < 5:295121‑M2/149‑7 (MQ=255) caccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccgg < 5:354487‑M2/149‑8 (MQ=255) accGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggc < 4:21614‑M1/149‑46 (MQ=255) cGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggccc < 8:172651‑M1/149‑48 (MQ=255) cGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgcca < 8:42146/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgcca < 1:289770/149‑1 (MQ=255) aGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccgg > 2:343094‑M1/1‑98 (MQ=255) aGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccgg < 1:343094‑M1/142‑45 (MQ=255) gtgcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCcagccagc < 6:2879/147‑1 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgccagc < 6:302677/143‑1 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgccagc > 5:302677/1‑143 (MQ=255) ggTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcacagc < 7:27425/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCAGAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGc < 1:333132/148‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCAGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGcc > 8:333340/1‑149 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatcatc < 6:295121/148‑1 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatcat > 7:51289/1‑147 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGa > 6:81130/1‑143 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGa < 5:81130/143‑1 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGAtcatca > 4:306497/1‑149 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGAtcatca < 6:47846/149‑1 (MQ=255) aaCTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAg > 3:27170/1‑149 (MQ=255) cACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCgg < 4:254001/94‑1 (MQ=255) cACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCgg > 3:254001/1‑94 (MQ=255) cACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac > 4:2745/1‑127 (MQ=255) cACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac < 3:2745/127‑1 (MQ=255) cACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatca > 7:337797/1‑140 (MQ=255) cACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatca < 8:337797/140‑1 (MQ=255) aCCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatc > 6:287954/1‑138 (MQ=255) aCCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatc < 5:287954/138‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCt < 6:354487/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCgg > 7:2742/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCgg > 7:24911/1‑149 (MQ=255) aGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGAc < 3:306497/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg < 8:9042/149‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCaa < 8:2742/149‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCaa < 4:27170/149‑1 (MQ=255) cGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAgg < 8:51289/149‑1 (MQ=255) ggCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg < 3:28307/141‑1 (MQ=255) ggCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg > 4:28307/1‑141 (MQ=255) ggCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAggg < 7:321363/149‑1 (MQ=255) cccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac > 3:310598/1‑91 (MQ=255) cccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac < 4:310598/91‑1 (MQ=255) cagcagCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCaa < 1:326389/149‑1 (MQ=255) agcagcAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAAt < 8:24911/149‑1 (MQ=255) cagcaAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCa < 2:46454/104‑1 (MQ=255) cagcaAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCa > 1:46454/1‑104 (MQ=255) gcaAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTc > 7:331237/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGAAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGCCt > 4:9265/1‑149 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCt > 7:264407/1‑149 (MQ=255) gggCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccg < 8:172651‑M2/149‑103 (MQ=255) gCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggt < 4:21614‑M2/149‑105 (MQ=255) ccGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtg < 5:354487‑M1/149‑143 (MQ=255) ccGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcct > 2:343094‑M2/1‑44 (MQ=255) ccGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcct < 1:343094‑M2/142‑99 (MQ=255) cGGGCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtgg < 5:295121‑M1/149‑144 (MQ=255) gggCGgcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggt > 4:291388‑M1/1‑5 (MQ=255) gcggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtg > 6:143905‑M1/1‑3 (MQ=255) ggcggattgccatcgaccgcacggagctcgcggtgtcgcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcag < 5:143905‑M1/149‑149 (MQ=255) | GTGCACTGCGCAGAAAGGTCTTCAGGGCTGCCCGATCCTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCG‑‑TCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGC > NC_002947/4282575‑4282870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |