New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4282722 | 57 (1.030) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 7.3% | coding (508/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4282759 | 48 (0.930) | coding (471/1089 nt) | PP_3753 | AraC family transcriptional regulator |
CTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCA > NC_002947/4282612‑4282907 | cTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCc < 5:143905‑M2/149‑2 (MQ=255) caccacCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgc > 6:143905‑M2/1‑145 (MQ=255) accaccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgccc > 4:291388‑M2/1‑144 (MQ=255) ccaccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccg < 5:295121‑M2/149‑7 (MQ=255) caccGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccgg < 5:354487‑M2/149‑8 (MQ=255) cGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgcca < 1:289770/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgcca < 8:42146/149‑1 (MQ=255) gtgcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCcagccagc < 6:2879/147‑1 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgccagc > 5:302677/1‑143 (MQ=255) gcAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGgccagc < 6:302677/143‑1 (MQ=255) ggTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcacagc < 7:27425/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCAGAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGc < 1:333132/148‑1 (MQ=255) gcgcTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCAGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGcc > 8:333340/1‑149 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatcatc < 6:295121/148‑1 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatcat > 7:51289/1‑147 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGa > 6:81130/1‑143 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGa < 5:81130/143‑1 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGAtcatca < 6:47846/149‑1 (MQ=255) gAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGAtcatca > 4:306497/1‑149 (MQ=255) aaCTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAg > 3:27170/1‑149 (MQ=255) cACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac < 3:2745/127‑1 (MQ=255) cACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac > 4:2745/1‑127 (MQ=255) cACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatca < 8:337797/140‑1 (MQ=255) cACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatca > 7:337797/1‑140 (MQ=255) aCCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatc > 6:287954/1‑138 (MQ=255) aCCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGatc < 5:287954/138‑1 (MQ=255) tCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCt < 6:354487/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCgg > 7:24911/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCgg > 7:2742/1‑149 (MQ=255) aGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGAc < 3:306497/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg < 8:9042/149‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCaa < 8:2742/149‑1 (MQ=255) tCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCaa < 4:27170/149‑1 (MQ=255) cGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAgg < 8:51289/149‑1 (MQ=255) ggCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg > 4:28307/1‑141 (MQ=255) ggCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCgg < 3:28307/141‑1 (MQ=255) ggCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAggg < 7:321363/149‑1 (MQ=255) cccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac < 4:310598/91‑1 (MQ=255) cccccACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCcagcac > 3:310598/1‑91 (MQ=255) cagcagCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCaa < 1:326389/149‑1 (MQ=255) agcagcAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAAt < 8:24911/149‑1 (MQ=255) cagcaAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCa > 1:46454/1‑104 (MQ=255) cagcaAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCa < 2:46454/104‑1 (MQ=255) gcaAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTc > 7:331237/1‑149 (MQ=255) gtcgtcCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGAAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGCCt > 4:9265/1‑149 (MQ=255) tcctGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCt > 7:264407/1‑149 (MQ=255) gggCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccg < 8:172651‑M2/149‑103 (MQ=255) gCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggt < 4:21614‑M2/149‑105 (MQ=255) ccGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcct < 1:343094‑M2/142‑99 (MQ=255) ccGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCcgcccggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcct > 2:343094‑M2/1‑44 (MQ=255) gACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCAccgcccgccc > 3:268384/1‑149 (MQ=255) gACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCAccgcccgccc < 7:333340/149‑1 (MQ=255) cgcgAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCAc > 1:41513/1‑149 (MQ=255) gCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTAcc > 5:326616/1‑149 (MQ=255) tCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGt > 7:269933/1‑149 (MQ=255) cGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAggg < 6:47740/96‑1 (MQ=255) cGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAggg > 5:47740/1‑96 (MQ=255) cGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCgac < 4:268384/148‑3 (MQ=255) tCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGcc < 2:41513/149‑1 (MQ=255) gATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCAc < 6:326616/149‑1 (MQ=255) gCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAg < 2:35433/149‑1 (MQ=255) cgccgcCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTACGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGc < 6:94531/96‑1 (MQ=255) gccgccCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCAca > 7:59407/1‑147 (MQ=255) ccgccgggcccaggaggacgacttgctgctgtgggggccggacctgcggctgggcagcggacgcaccgaggtggagttcgacagcgcctacctgcgcctgccggtggtgcaggatcgggcagccctgaagacctttctgcgcagtgcac < 6:2705‑M2/149‑149 (MQ=255) | CTGCACCACCGGCAGGCGCAGGTAGGCGCTGTCGAACTCCACCTCGGTGCGTCCGCTGCCCAGCCGCAGGTCCGGCCCCCACAGCAGCAAGTCGTCCTCCTGGGCCGGGCGCGACACCGCGAGCTCCGTGCGGTCGATGGCAATCCGCCGCCCGGCCAGCCAGCACAGCATGCCGATCATCAGCACCAGGTAGGTTTCCTCGGCATAGACCCGGGTCAAGGGGTCGGCAATGTTCGACTGCACGCTGATCACCGCCCGCCCGCCACGTACCGTCAGGCTGCCACGCAGGTCACGCA > NC_002947/4282612‑4282907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |