| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5983463 | 63 (1.140) | 5 (0.090) | 5/248 | NT | 7.6% | coding (4108/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
| ? | NC_002947 | = 5983500 | 60 (1.120) | coding (4145/5049 nt) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase | |||||
ACGTGAGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGG > NC_002947/5983329‑5983610 | aCGTGAGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAAc > 7:280447/1‑149 (MQ=255) aGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCg > 4:125662/1‑149 (MQ=255) gCATCGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGTTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGTCGCGCAACGCCCg < 2:319944/148‑1 (MQ=255) tGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCg < 5:140262/149‑1 (MQ=255) aCAACTGCCAGAAGTTCATGACCCGGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTg < 8:77393/149‑1 (MQ=255) aaCTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCt > 8:318934/1‑149 (MQ=255) aCTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCtg < 8:280447/149‑1 (MQ=255) ccAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGtgcc > 3:246567/1‑149 (MQ=255) ccAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGtgcc > 1:47594/1‑149 (MQ=255) ccAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGtgc < 3:125662/148‑1 (MQ=255) gAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCtgcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgc < 1:92739‑M1/149‑37 (MQ=255) gTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgc < 7:115346‑M2/149‑3 (MQ=255) cATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTgg > 7:102586/1‑149 (MQ=255) aTGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt > 3:91217/1‑149 (MQ=255) tGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt > 4:300546/1‑148 (MQ=255) aCCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGc < 6:256777/130‑1 (MQ=255) aCCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGc > 5:256777/1‑130 (MQ=255) ccAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt < 2:46899/144‑1 (MQ=255) ccAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGt > 1:46899/1‑144 (MQ=255) cAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATc > 1:303761/1‑147 (MQ=255) aGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAg > 4:267601/1‑149 (MQ=255) gCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAggg < 2:212981/149‑1 (MQ=255) cGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTg > 5:174290/1‑149 (MQ=255) tCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGAt < 3:267601/149‑1 (MQ=255) atcaACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCAGGAGGCCTTCCGCAAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCt > 8:324173/1‑149 (MQ=255) tcaACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTg < 6:174290/149‑1 (MQ=255) caccacCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgt > 7:321152‑M1/1‑77 (MQ=255) caccacCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgt < 8:321152‑M1/119‑43 (MQ=255) accaccATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCCCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTg > 8:39452/1‑144 (MQ=255) accaccATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCCCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTg < 7:39452/144‑1 (MQ=255) caccaTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcg < 3:215970‑M1/103‑30 (MQ=255) caccaTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcg > 4:215970‑M1/1‑74 (MQ=255) accaTGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCt < 4:91217/149‑1 (MQ=255) tGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaa < 5:94610/149‑1 (MQ=255) cgcACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaaa < 4:99625/148‑1 (MQ=255) cgcACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGaaa < 4:246567/148‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCtgt < 6:370297/92‑1 (MQ=255) ccGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCtgt > 5:370297/1‑92 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg > 7:274979‑M2/1‑97 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctg < 8:274979‑M2/101‑5 (MQ=255) gCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTc > 4:346449/1‑149 (MQ=255) aCCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGAGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAACCCGCCTCGTGc > 1:237940/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGcc > 8:312411/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGcc > 2:356315/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGcc > 7:70090/1‑148 (MQ=255) cTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGtt < 3:300546/149‑1 (MQ=255) tCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTc > 8:110811/1‑149 (MQ=255) tCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTc > 1:15055/1‑149 (MQ=255) tCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTc > 1:9353/1‑149 (MQ=255) aCGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGc < 8:115346/149‑1 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGt < 1:217952/132‑1 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGt > 2:217952/1‑132 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCa < 1:356315/149‑1 (MQ=255) cGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCa < 7:312411/149‑1 (MQ=255) gCCCTCAGTGACTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGGTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCGGATCGGACGGGTGTAGCGGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTACTGCAgg > 8:340166/1‑146 (MQ=255) cccTCAGGGAGGGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCACGCGCGCCACGCCCGCGCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGCTCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTc < 2:303761/147‑1 (MQ=255) ccTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAgc > 3:123403/1‑149 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTgg < 5:269744/112‑1 (MQ=255) cTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTgg > 6:269744/1‑112 (MQ=255) agtgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCt > 4:80532/1‑149 (MQ=255) tgagtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTgg < 7:318934/149‑1 (MQ=255) gtgCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGcc < 7:324173/148‑1 (MQ=255) ccGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCt > 5:110751/1‑149 (MQ=255) ggAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTgg < 8:102586/149‑1 (MQ=255) ggAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTgg < 3:346449/149‑1 (MQ=255) aGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGa > 6:289595/1‑148 (MQ=255) gCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTc < 7:337140/120‑1 (MQ=255) gCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTc > 8:337140/1‑120 (MQ=255) cTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcc > 6:1589/1‑149 (MQ=255) cTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcc > 7:111846/1‑149 (MQ=255) cGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATcctcg < 2:47594/148‑1 (MQ=255) aCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtg < 8:321152‑M2/119‑78 (MQ=255) aCAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCgctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtg > 7:321152‑M2/1‑42 (MQ=255) cAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgc < 8:274979‑M1/101‑98 (MQ=255) cAGCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgc > 7:274979‑M1/1‑4 (MQ=255) gCggcaggcacagcaccgagcgggcgttgcgcgcctgcagctgttggcggaaggcctccgggcactcactgagggcatcgttgagcaccagcggtttgcgggtgcgcatggtggtgttgatgaccgacaacggtgcctgggtcatgaac < 7:115346‑M1/149‑148 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCt < 2:339682/119‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCt > 1:339682/1‑119 (MQ=255) cTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCgcagg > 3:306106/1‑148 (MQ=255) | ACGTGAGCATGGACAACTGCCAGAAGTTCATGACCCAGGCACCGTTGTCGGTCATCAACACCACCATGCGCACCCGCAAACCGCTGGTGCTCAACGATGCCCTCAGTGAGTGCCCGGAGGCCTTCCGCCAACAGCTGCAGGCGCGCAACGCCCGCTCGGTGCTGTGCCTGCCGCTGGTGATCCAGGGCGTGCTGATCGGCCTGGTGTACCTGGAAAACCGCCTCGTGCCCAACCTGTTCGGCAGTCAGCGCCTGGCCATGCTGGAAATCCTCGCCTCGCAGG > NC_002947/5983329‑5983610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |